中國地方雞種核酸數(shù)據(jù)庫建設(shè)與功能設(shè)計-資料下載頁
2025-07-18 06:50本頁面
【正文】 程 》 北京，電子工業(yè)出版社， 2022 數(shù)據(jù)類型轉(zhuǎn)換實例 %利用 MatLab構(gòu)建不同地方雞種親緣關(guān)系進(jìn)化樹； %定義數(shù)組二維 data，存儲雞種名稱和 mtDNA序列； function phylogenyanalysis(data,m) %data = {39。白銀耳雞 39。 39。AF12832039。 39。靈昆雞 39。 39。AF12833039。 39。壽光雞 39。 39。AF51205839。 39。絲羽烏骨雞 39。 39。AF51206039。 39。茶花雞 39。 39。AF51207839。}。 %for ind = 1:5 % seqs(ind).Header = data{ind,1}。 % seqs(ind).Sequence = getgenbank(data{ind,2}, 39。sequenceonly39。, true)。 %end %進(jìn)化距離運算； UPGMA，非加權(quán)分組平均法（ unweighted pair group method with arithmetic means） JukesCantor， for ind = 1:m seqs(ind).Header = data{ind,1}。 seqs(ind).Sequence = data{ind,2}。 end distances = seqpdist(seqs,39。Method39。,39。JukesCantor39。,39。Alphabet39。,39。DNA39。)。 tree = seqlinkage(distances,39。UPGMA39。,seqs)。 %畫出進(jìn)化樹； h = plot(tree,39。orient39。,39。bottom39。)。 set(findobj(gca,39。Type39。,39。line39。,39。Color39。,[0 10 1]),39。Color39。,39。red39。,39。LineWidth39。,2)。 ylabel(39。進(jìn)化距離 39。) title(39。中國地方雞種進(jìn)化關(guān)系樹 39。) set(,39。Rotation39。,45) saveas(gca,39。C:\39。) %close(39。all39。,39。hidden39。) 討 論 1. 在 Windows操作系統(tǒng)下運行具有更廣泛的適應(yīng)性； 2. 采用組件技術(shù)開發(fā)，具有更強適應(yīng)性、可移植性和復(fù)用性； 3. 根據(jù)中國地方雞種定制分析組件庫，針對性強； 4. 構(gòu)建了中國地方雞種分子數(shù)據(jù)存儲、共享和分析平臺，先進(jìn)性和創(chuàng)新性強。 展 望 數(shù)據(jù)倉庫 SQL Server 算法、模型 Matlab 地方品質(zhì) 特色研究 Matlab組件 .NET開發(fā)平臺 Windows操作系統(tǒng)
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