ipca算法ppt課件-資料下載頁(yè)
2025-05-05 13:17本頁(yè)面
【正文】 酵母蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)識(shí)別的復(fù)合物超過１００個(gè)與已知蛋白質(zhì)匹配；而隨機(jī)網(wǎng)絡(luò)中識(shí)別的蛋白質(zhì)復(fù)合物為０。 這說明隨機(jī)網(wǎng)絡(luò)破壞了蛋白質(zhì)相互作用中的生物本質(zhì)特性。 實(shí)驗(yàn)四、ＩＰＣＡ與其它算法的比較 到目前為止，每一種實(shí)驗(yàn)技術(shù)或計(jì)算方法預(yù)測(cè)出來的蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)都 不可避免地具有一定程度的假陽(yáng)性和假陰性。所以，好的蛋白質(zhì)復(fù)合物識(shí)別 方法應(yīng)該對(duì)蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)中存在的假陽(yáng)性和假陰性具有很好的健壯性。這里我 們用隨機(jī)增加和移除一定比例的邊來模擬蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)的假陽(yáng)性和假陰性。隨 機(jī)增加邊的比例從 10％到 100％，從這些具有高的假陽(yáng)性的數(shù)據(jù)中進(jìn)行蛋白質(zhì) 復(fù)合物識(shí)別，并將識(shí)別出來的結(jié)果與已知蛋白質(zhì)復(fù)合物進(jìn)行匹配，匹配的結(jié) 果如圖所示 實(shí)驗(yàn)五、算法的健壯性 圖（ａ）：隨著假陽(yáng)性的增強(qiáng)，算法 IPCＡ能夠標(biāo)識(shí)出來的已知蛋 白質(zhì)復(fù)合物數(shù)量幾乎沒有下降多少，說明其具有相當(dāng)高的抗噪能力 ；圖（ｂ）：只要移除邊的比例小于 50％，算法 IPCＡ能夠標(biāo)識(shí) 出來的已知蛋白質(zhì)復(fù)合物數(shù)量下降的很少。 實(shí)驗(yàn)六、運(yùn)行時(shí)間的分析
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