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dna重組ppt課件(2)-資料下載頁

2025-05-05 12:09本頁面
  

【正文】 準(zhǔn)確度比 Tth DNA聚合酶高 2倍 Taq DNA聚合酶, Pwo DNA聚合酶 將喜溫性細(xì)菌中此酶的基因轉(zhuǎn)入 ,市售產(chǎn)品為此酶基因在 產(chǎn)物。 Tth DNA聚合酶, . DNA聚合酶 直接從發(fā)現(xiàn)它們的微生物中提取 靶 DNA 和模板 靶 DNA: 待擴增的特定 DNA雙鏈片段。應(yīng)該知道其兩端 20~ 30bp的核苷酸序列,供設(shè)計一對引物之用。 模板: 一條單鏈的 DNA片段 PCR引物 ? PCR擴增引物: 是指與待擴增 DNA區(qū)域兩端序列互補的人工合成的寡核苷酸短片段,其長度通常在 15~ 30個核苷酸之間。它包括引物 1和引物 2。 ? 引物設(shè)計的基本原則 是最大限度地提高擴增效率和特異性,同時盡可能抑制非特異性擴增。 具體的設(shè)計原則: ? 引物 3’端必須具有游離 OH基團; ? 引物長度 2030個核苷酸, G+C含量一般為40%~60%,四種堿基的分布最好隨機,不要有聚嘌呤或聚嘧啶存在; ? 引物應(yīng)避免回文結(jié)構(gòu),同時引物之間也不能有互補性 ,避免形成引物二聚體; ? 5’端可以修飾,如加酶切位點序列;標(biāo)記生物素、熒光素、地高辛等,這對擴增的特異性影響不大。但 3′端絕對不能進行任何修飾,因為引物的延伸是從 3′端開始的。 ? 擴增編碼區(qū)域時,引物 3′端不要終止于密碼子的第 3位,因為密碼子第 3位易發(fā)生 簡并 ,會影響擴增的特異性與效率 ; ? 引物與非特異擴增序列的同源性不要超過 70%或有連續(xù) 8個互補堿基同源 PCR原材料 dATP、 dGTP、 dCTP、 dTTP 或修飾過的核苷酸 PCR緩沖液 140mM TrisHcl( ) 、 4 ~ 8mM MgCl 40mM (NH4)2SO 30μg/ml BSA(無核酸酶 )、 16mM DTT PCR循環(huán)的溫度和時間 ( 1)變性(快速高溫) 溫度: 90 ~ 95 ℃ ,多采用 94 ℃ 時間: 20s ( 2)復(fù)性 溫度: 取決于引物長短和 GC含量 如長度 20個核苷酸, GC含量 50% → 55 ℃ ; 如長度 12 ~ 15個核苷酸 → 40~ 45 ℃ ; 時間: 20s ( 3)延伸 溫度: 70 ~ 75 ℃ 時間: 隨擴增 DNA片段長度而定 1000bp→1min , 150bp甚至不需考慮延伸時間 ?平臺效應(yīng)出現(xiàn)的遲早主要取決于起始模板的拷貝數(shù)、所用的 DNA聚合酶的性能及底物dNTP的濃度等多種因素。 PCR擴增的平臺效應(yīng) ? 在 PCR反應(yīng)中,當(dāng)引物-模板與 DNA聚合酶達到一定比值時, DNA聚合酶催化的反應(yīng)趨于飽和,會出現(xiàn)“平臺效應(yīng)”,即PCR反應(yīng)產(chǎn)物不再增加。 三、 PCR擴增 DNA片段的方法 四、常用的 DNA片段 PCR擴增系統(tǒng) 遺傳密碼 64個密碼子 61個代表各種氨基酸( AUG起始密碼) 3個密碼子為終止子( UAA、 UAG、 UGA)
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