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連鎖遺傳分析ppt課件-資料下載頁

2025-01-08 00:38本頁面
  

【正文】 =不交換 ?校正的 RF(vcv)=兩基因間交換值 +2倍的雙交換率 =%+2 % =% 即為: (45+40+89+94+3+3+5+5) / 1448=% 不經(jīng)作圖直接排列基因座順序 ? 在配子基因型中雙交換的頻數(shù)最低 ? 按 F1代(或配子基因型最多)的基因型排列順序,把親本三個(gè)基因座中的每一個(gè),各排在中間一次 ? 把中間的一對(duì)等位基因位置互換(相當(dāng)于雙交換) ? 與 8種配子基因型比較,從三種排列中找出符合雙交換(頻數(shù)最低的配子基因型)的基因型,它的順序即為三個(gè)基因座的順序 位置互換后的“ 2” 基因型與屬于雙交換的配子基因型一致, ct應(yīng)位于中間,所以“ 2” 的排列順序是正確的 干涉 ?如果兩個(gè)單交換的發(fā)生是彼此獨(dú)立的,雙交換的頻率就應(yīng)該是兩個(gè)單交換頻率的乘積 ?但實(shí)際雙交換值比預(yù)期少 ?一個(gè)單交換發(fā)生后,在它附近再發(fā)生第二個(gè)單交換的機(jī)會(huì)就會(huì)減少一些。這種現(xiàn)象叫做 干涉(interference) ?用并發(fā)系數(shù)表示干涉的大小 名詞 ? 干涉 (interference) ? 染色體干涉 (chromosome interference):染色體的某個(gè)區(qū)段出現(xiàn)交換,影響相鄰區(qū)段出現(xiàn)交換的現(xiàn)象。常發(fā)生 ? 染色體單體干涉 (chromatid interference) :一對(duì)同源染色體的 4條染色單體之間參與多線交換機(jī)會(huì)的偏離。偶爾發(fā)生 ? 正干涉 (positive interference):在染色體的一個(gè)區(qū)段上出現(xiàn)交換,減少了相鄰區(qū)段的交換 ? RF(vct)=, RF(ctcv) = ,若兩區(qū)段相互獨(dú)立,則雙重組頻率= =, 1448只 =12只,實(shí)際上只有 8只,證明兩區(qū)段不獨(dú)立,存在正干涉 ? 負(fù)干涉 (negative interference):在染色體的一個(gè)區(qū)段上出現(xiàn)交換,增加了相鄰區(qū)段的交換。僅在微生物中發(fā)生基因轉(zhuǎn)變時(shí)才出現(xiàn) ?并發(fā)系數(shù) (coefficient of coincidence, .) ? 系數(shù)愈大,表示干擾愈小 ? 符合系數(shù)等于 1,表示無干擾 ? 符合系數(shù)為 0,表示完全干擾,即一點(diǎn)發(fā)生交換,其鄰近的另一點(diǎn)就不再發(fā)生交換 ?干涉值 (interference value) ? 干涉值 (I) = 1 . ? I = 1 8/12 = 1/3 制圖函數(shù) (mapping function) ?以重組率為自變量,圖距為因變量所得到的函數(shù) ? 在這里只需要重組率一個(gè)變量,并不需要考慮兩基因座之間是否存在雙或多交換 ?為什么使用制圖函數(shù)? ? 只有在兩個(gè)基因座距離較近時(shí),才可以使用以 RF表示的圖距 ? 在中等距離時(shí)開始出現(xiàn)雙交換,這時(shí)圖距與 RF已不成線性關(guān)系 ? 距離更遠(yuǎn)時(shí),兩基因座之間會(huì)出現(xiàn)多重交換,這種非線性關(guān)系變得更加明顯;呈現(xiàn)非連鎖狀態(tài) 在后 2種情況下,需尋找一個(gè)或多個(gè)標(biāo)記(為發(fā)現(xiàn)雙或多交換而尋找的居間基因)。實(shí)際操作起來很困難 Haldane制圖函數(shù) ?Haldane(霍爾丹 )推導(dǎo)的重組率校正函數(shù) RF = (1 e2x) / 2 x代表交換率, e是自然底數(shù) 公式表示重組率與圖距的關(guān)系 圖距的單位是 1%交換率 說明 ? 縱軸為重組率。橫軸為圖距,單位為 μ= 100 x ? 平均交換次數(shù)越多,基因座之間的距離越遠(yuǎn) ? 從上圖的實(shí)線可以看出,不論染色體上的兩個(gè)基因座相距有多遠(yuǎn),其RF值永不會(huì)大于 50%。當(dāng) x →∞ 時(shí) ex →0 ,這時(shí) RF→50% ? 從上圖的虛線可以看出,只有在 μ值很小時(shí)的一個(gè)很小區(qū)間內(nèi),圖距才與 RF呈線性關(guān)系,斜率為 1,重組率是加性的。這時(shí)的 RF可直接用來作為圖距 ? 交換次數(shù)很多時(shí)(曲線較大區(qū)域),斜率小于 1,重組率不再是加性的, RFacRFab+RFbc。必須用制圖函數(shù)加以校正 ? 由 RF = (1 e2x) / 2解出 x, x = ln (1 2RF ) / 2 由此得出: MD = 50 ln (1 – 2 RF ) . ? 不管基因座之間的遠(yuǎn)近,該公式都是適用的 RF = (1e2x)/2 例 ?已知 RF = %,問基因座之間的圖距是多少? MD = 50 ln (1 2RF) = 50 ln = 40 . 兩基因座之間的距離是 40 .,若以 RF為圖距,則低估基因座之間的真實(shí)距離 ?已知 RF = 4%,求圖距 MD = 50 ln (1 ) = .
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