產(chǎn)甲烷古細菌的特點(編輯修改稿)
2024-10-03 10:59 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 rachromosomal element，ECE)。[4]比如Methanococcus jannaschii不僅含有1個1664976bp的環(huán)狀染色體，還含有1個58407bp的大ECE和1個16550bp的小ECE。產(chǎn)甲烷菌的G+C含量在30%一65%之間，這種變化與其所生存的環(huán)境相關。比如嗜熱的MethanoPyruskandleriAV19的G+%。編碼蛋白的ORF與一個物種的復雜度相關聯(lián)，產(chǎn)甲烷菌的ORF約在1500一5000之間。傳統(tǒng)的分類是在對大量單個微生物進行觀察分析和描述的基礎上，以它們的形態(tài)結構、生理生化特性和遺傳性等特征的異同為依據(jù)進行的。隨著分子生物學的發(fā)展，人們利用不同物種間smallsubunitribosom習RNA的同源性進行分類取得了較為滿意的結果。但這種方法存在著明顯的弊端，當環(huán)境壓力使得某物種核酸中G+C含量變化時，分析結果會有較大偏差。隨著多個物種全基因組測序的完成，使人們可以用全基因組信息研究物種的進化、基因的垂直進化和水平遷移。[5]在產(chǎn)甲烷菌之間基因的“重疊”性很高，發(fā)現(xiàn)一些基因簇只在產(chǎn)甲烷菌中出現(xiàn)而不在其它古細菌中出現(xiàn)，同樣也發(fā)現(xiàn)一些其它微生物中共有的基因簇在產(chǎn)甲烷菌中找不到痕跡。不同基因組間基因順序的比較可以衡量2個物種間的親緣關系，也能提示基因之間功能的關聯(lián)性。利用核糖體蛋白同源性構建進化樹是目前認為最可靠的進化分析方法。[6]3產(chǎn)甲烷菌代謝特征產(chǎn)甲烷菌生活在厭氧條件下，它們通過甲烷的生物合成形成維持細胞生存所需的能量。在產(chǎn)甲烷菌中存在原核細胞和真核細胞所共有的糖酵解途徑(EMP)、三狡酸循環(huán)(TCA)、氨基酸和核昔酸代謝。但一些基本所需的酶在產(chǎn)甲烷菌中未被確定，如在Methanopyrus kandleri AV19的TCA循環(huán)中缺乏將兩分子丙酮酸縮合成一分子六碳三狡酸所需的酶。,。[7]產(chǎn)甲烷菌是自養(yǎng)型的生物，它能利用環(huán)境中的化學能。因而產(chǎn)甲烷菌中發(fā)現(xiàn)了許多無機物進人細胞所需的通道蛋白。如Na+，K+，Ca+，Cu2+,Fe2+,Fe3+,Cl,Co2+等離子。以及亞砷酸、磷酸、硫酸、硝酸等無機酸。產(chǎn)甲烷菌還具備運輸乳酸、六碳三狡酸、六碳二狡酸等有機物進人細胞的轉(zhuǎn)運蛋白。產(chǎn)甲烷菌是目前唯一
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