基因芯片在生物醫(yī)藥應(yīng)用中的價(jià)值研討(編輯修改稿)
2025-01-20 20:32 本頁(yè)面
【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 片 啟動(dòng)子區(qū)域 10kb覆蓋 堿基之間 ?全基因組拷貝數(shù)變異分析 ?全基因組甲基化分析 ?全基因組轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)分析 ?全基因組非編碼 RNA檢測(cè) ?全基因組可變剪切分析 Affymetrix 啟動(dòng)子芯片 35 bp resolution 6500元，檢測(cè)全基因甲基化； 6500元，檢測(cè)轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控； 全基因組轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合基因篩選 全基因甲基化檢測(cè) ? 使用 MeDIP/MBD抗體 甲基化 芯片檢測(cè) 發(fā)現(xiàn)基因表達(dá)調(diào)控方式 高甲基化 低甲基化 甲基化芯片 DNA結(jié)構(gòu)變異情況 LOH SNP突變對(duì)蛋白 3級(jí)結(jié)構(gòu)的變化 Affymetrix SNP芯片特征 拷貝數(shù)變異特征 ——以拷貝數(shù)擴(kuò)增為例 ? SNP + 拷貝數(shù)變異芯片 發(fā)現(xiàn)疾病遺傳特征 腫瘤組 高頻擴(kuò)增區(qū) Hepatolgy 2023 ? 與基因表達(dá)無關(guān) ? 不知道目標(biāo)基因序列 ?目標(biāo)基因明確，且檢測(cè)數(shù)量較少 ? 快速檢測(cè) ——當(dāng)日獲得檢測(cè)結(jié)果 何時(shí)不需要基因芯片 ? 基因注釋查詢方法 NCBIGene數(shù)據(jù)庫(kù) ——基因功能綜合注釋數(shù)據(jù)庫(kù) KEGG數(shù)據(jù)庫(kù) ——信號(hào)通路數(shù)據(jù)庫(kù) Gene Ontology數(shù)據(jù)庫(kù) ——基因功能分類數(shù)據(jù)庫(kù) dbSNP數(shù)據(jù)庫(kù) ——SNP數(shù)據(jù)庫(kù) UCSC基因組瀏覽器 ——基因、基因調(diào)控元件定位瀏覽器 ? 基本統(tǒng)計(jì)術(shù)語(yǔ) ttest——兩類樣本間差異基因分
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