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法醫(yī)物證學各章知識整理(編輯修改稿)

2025-09-01 08:52 本頁面
 

【文章內容簡介】 A指紋) ⑥探針標記 ⑦分子雜交 ⑧譜帶顯示限制性酶選擇要求:①識別序列位于VNTR兩側,盡量靠近VNTR; ②酶活性、特異性穩(wěn)定,反應條件容易控制; ③不受基因組DNA是否甲基化的影響。聚合酶鏈式反應(PCR):類似半保留復制,在體外以基因組DNA為模板,以一對寡核苷酸為引物,dNTP為原料,在Taq DNA聚合酶的催化下,經(jīng)過變性、退火和引物延伸三步循環(huán)使目標片段得到復制百萬倍。PCR反應體系:① 模板DNA,②寡核苷酸引物,③dNTP,④反應緩沖液,⑤TaqDNA聚合酶。 循環(huán)參數(shù) :溫度、時間PCR技術特點:①靈敏度高 ②特異性高 ③適用于降解DNA檢材 ④種屬特異性好 ⑤操作簡單,時間短 ⑥儀器自動完成 ⑦污染 ⑧樣本要求 ⑨影響因素多復合擴增:經(jīng)過篩選的STR基因座,擴增條件基本相同,可以在同一個PCR體系中擴增多個靶基因座,叫作復合擴增。應用于法醫(yī)的STR應滿足條件:① PCR擴增產物長度在300bp以下; ② 宜選擇四核苷酸STR基因組; ③ 選多個STR基因座應不在同一條染色體上; ④ 每個STR基因座等位基因數(shù)810個左右; ⑤ 基因頻率分布均勻,沒有高或低頻基因出現(xiàn); ⑥ 雜合度高,; ⑦ 低突變率%。不同DNA長度分析技術比較:不同DNA長度分析技術綜合評價:STR分型用于法醫(yī)物證鑒定的主要優(yōu)點:高靈敏度:適用于微量降解檢材。 高鑒別能力:節(jié)約檢材、試劑和提高效率。 標準化分型:實現(xiàn)數(shù)字化結果,利于實驗室間數(shù)據(jù)交換,建立數(shù)據(jù)庫。miniSTR:通過重新設計引物,使其結合在更靠近核心重復區(qū)的側翼序列,從而降低擴增產物的大小,進一步提高靈敏度和分型成功率,這種技術稱為短片段STR分型或miniSTR分型。miniSTR的優(yōu)勢:216。①STR基因座的擴增片段較短,靈敏度更高,尤其適用于極微量或嚴重降解生物檢材的DNA分型; 216。②等位基因片段長度范圍較窄,不易發(fā)生因小等位基因的優(yōu)勢擴增而造成的等位基因丟失現(xiàn)象; 216。③可對多個STR基因座進行復合擴增,從而節(jié)約檢材、降低成本,提高單次檢測的信息量miniSTR分型的局限性:因擴增片段長度的限制,構建復合擴增體系時只能同時擴增較少的基因座(通常每種顏色的熒光標記的基因座不超過2個)。要想達到與傳統(tǒng)的商品化試劑盒接近的個人識別能力,必須增加復合擴增的次數(shù)。miniSTR引物與傳統(tǒng)的引物結合區(qū)之間若存在堿基的插入和缺失,易導致miniSTR與傳統(tǒng)STR分型結果的不一致。 3. 若某些STR基因座核心重復區(qū)上游或下游側翼序列存在嘌呤或嘧啶堿基堆積現(xiàn)象,則不利于miniSTR引物設計。 當PCR擴增產物過小時,未消耗引物上的染料分子或稱“染料污斑”(dye blobs)可使產物峰變寬、信號變弱。這種影響在檢測降解生物樣本時更為明顯。 YSTR有何法醫(yī)學應用特點:Y染色體為男性特有YSTR呈父系遺傳特征單倍體遺傳:在減數(shù)分裂過程中,Y特異性區(qū)不發(fā)生重組,所有YSTR基因座均呈連鎖遺傳,等位基因頻率不能以相乘方法計算GD=PE結果不具有唯一性,不能認定。其法醫(yī)學應用價值在于排除YSTR分型中需要注意的問題:①因為X和Y染色體部分序列具有高度相似性,有些YSTR分型時在X染色體上也能檢出擴增產物男性個體可見額外的產物峰,女性個體也可有分型結果。 ②部分YSTR基因座,有時可檢出二個或三個等位基因,易被誤認為不同男性的混合樣本。第五章 STR自動分型 STR自動分型技術的主要步驟:DNA自動化提取 PCR多色熒光標記STR復合擴增 PCR產物電泳前處理 自動毛細管電泳結合激光誘導的熒光檢測 自動數(shù)據(jù)采集并分型 offladder:在STR分型圖譜中,常會遇到部分樣本的少量片段峰未被程序化數(shù)字命名,在分型圖譜中被標識為offladder。漂移作用和新等位基因都可標識為offladder低拷貝DNA(low copy number,LCN):是指基因組含量小于100pg的樣本。第六章 DNA序列多態(tài)性PCR循環(huán)測序的基本原理:PCR技術能夠快速、特異性地擴增靶DNA,應用PCR技術測定DNA序列分為兩個步驟:先利用PCR擴增靶序列片段,制備測序模板,然后再利用PCR直接測定序列。PCR測序采用了熱循環(huán)高效合成DNA的特性并結合雙脫氧核苷酸終止法,使引物鏈終止的延伸產物數(shù)量在熱循環(huán)過程中得到增加,因此稱為循環(huán)測序。每個測序循環(huán)包括:①PCR擴增制備的模板DNA變性成單鏈形式;②標記引物與其中的一條鏈上的互補序列退火;③退火后的引物在耐熱DNA聚合酶催化下發(fā)生鏈延伸終止反應。本次循環(huán)產生的模板鏈與延伸終止鏈形成的雙鏈的產物,在下一輪測序循環(huán)中,再次被變性,釋放出模板鏈,作為又一輪引發(fā)反應的模板,同時積累下一輪循環(huán)產生的鏈終止產物。上述循環(huán)步驟重復20~40次,使鏈終止產物以線性方式獲得擴增。DNA自動測序技術:DNA自動測序技術是以4種熒光染料基團分別作為4種ddNTP終止鏈的標記物,于20世紀80年代末期建立的一種高效、快速、自動化的序列測定技術。4種熒光染料分別作為測序反應中4種ddNTP終止鏈的標記物,即4種被雙脫氧核苷酸終止的DNA片段分別帶上4種不同的顏色。這些DNA片段的混合物同時加在一個樣品槽中電泳展開,相互間僅差1個堿基的DNA片段形成一條具有4種顏色的階梯分布圖像。階梯中的每 DNA片段由標記在該片段上的特征性熒光基團發(fā)出的熒光所指示。熒光染料基團作為
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