3130xl簡明使用手冊(編輯修改稿)
2025-07-03 21:05 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 斷其是否阻塞毛細管未充滿膠檢查是否有毛細管斷裂，重新灌膠過期的光譜校正樣品檢查保質(zhì)期和儲存條件，必要的話更換新批號的樣品有很多雜峰膠過期更換新膠氣泡，尤其在膠中l(wèi) 使用Bubble Remove向?qū)Ч嗄zl 使用前要使膠升溫至室溫l 更換過期的膠膠污染更換新膠創(chuàng)建Instrument Protocoll 選擇GA Instruments ga3130 Protocol Manager.l 在Instrument Protocol界面中，點擊New按鈕l 填寫彈出的Protocol Editor窗口名字描述選擇REGULAR按照下表的內(nèi)容選擇相應(yīng)的Module按照下表的內(nèi)容選擇相應(yīng)的Dye SetRun ModuleDye Setl 點擊OK按鈕創(chuàng)建Analysis Protocoll 選擇GA Instruments ga3130 Protocol Manager.l 在Analasis Protocol界面中，點擊New按鈕l 選擇Sequencing Analysis，點擊OK按鈕l 填寫General菜單名字和描述按下表選擇相應(yīng)的序列文件格式文件格式選項含義Write .Seq File .seq文件用文本文件格式來打印序列或用在其它軟件中l(wèi) ABI格式用于Applied Biosystems軟件l FASTA格式用于其它軟件Write Standard Chromatogram Format file (.scf)Write Phred (.) File當KB basecaller同時被使用時，l 填寫B(tài)asecalling菜單選擇合適的basecaller和DyeSet Primer如果愿意，可以選擇分析的中止點選擇Quality Threshold選項選擇True或Flat ProfileProcessed Data選項功能使用同一的標準來處理顯示數(shù)據(jù)，使得其最強區(qū)域的峰高為一固定值。處理后的圖譜與原始圖譜類似。不同的區(qū)域不同處理，使得中間區(qū)域（約40堿基）的峰高相平注意：只能在使用KB basecaller分析時使用，若使用ABI basecaller必須用True ProfileQuality Threshold選項功能使用KB basecaller時，每個位置都要分配一個堿基和相應(yīng)的QV值使用KB basecaller時，低于設(shè)定的QV值的位置標記Ns，依然會顯示其QV值l 填寫Mixed Baeses菜單（只有在使用KB Basecaller選項時才能激活該菜單）選擇Use Mixed Base Identification選項設(shè)置相應(yīng)的檢測域值（默認為25%，不能低于15%）l 在Clear Range菜單中，選擇相應(yīng)方法l 點擊OK按鈕保存設(shè)置 Result Group，具體如下，設(shè)置完成后，點擊 OKl 選擇GA Instruments Results Group.l 點擊New按鈕創(chuàng)建新Result Group或Edit按鈕編輯已有的Result Groupl 填寫General界面填寫名字 填寫所有者（可選）填寫描述（可選）l 填寫Analysis界面分析類型中選擇Sequencing Analysis選擇是否需要程序結(jié)束后自動分析l 填寫Destination界面（若想使用默認文件夾位置則跳過以下內(nèi)容）點擊Use Custom Location選擇框自定義文件夾位置點擊Browse按鈕來瀏覽文件夾位置點擊Test按鈕來測試選擇的文件夾位置是否成功l 在Naming界面中按自己的習(xí)慣定義命名規(guī)則創(chuàng)建序列分析樣品板記錄l 選擇GA Instruments ga3130 Plate Manager.l 點擊New按鈕l 在彈出的New Plate Dialog窗口中填寫以下內(nèi)容樣品板名字樣品板描述（可選）選擇相應(yīng)的測序程序選擇96孔板輸入所有者和操作者的名字點擊OK按鈕l 在彈出的Sequencing Analysis Plate Editor窗口中，填入相關(guān)內(nèi)容n 在Sample Name欄中填入樣品名n 在Comments欄中填入相關(guān)描述n 在Results Group 1欄中選擇上面創(chuàng)建的Result Groupn 在Instrument Protocol 1欄中選擇上面創(chuàng)建的Instrument Protocoln 在Analysis Protocol 1欄中選擇上面創(chuàng)建的Analysis Protocoll 使用Fill Down功能來完成有相同設(shè)置的樣品填寫l 若想讓樣品運行一輪以上，選擇Edit Add Sample Run并填寫相關(guān)信息l 點擊OK按鈕創(chuàng)建Instrument Protocoll 選擇GA Instruments ga3130 Protocol Manager.l 在Instrument Protocol界面中，點擊New按鈕 l 填寫彈出的Protocol Editor窗口名字描述選擇REGULAR選擇GeneMapper36_POP7選擇G5點擊OK按鈕Run Modules:DyeSet:設(shè)置Results Group，參考第24頁，只需將分析類型改為GeneMapper。創(chuàng)建片段分析樣品板記錄l 選擇GA Instruments ga3730 Plate l 在彈出的New Plate Dialog窗口中填寫以下內(nèi)容樣品板名字樣品板描述（可選）選擇相應(yīng)的GeneMapper程序選擇96孔板輸入所有者和操作者的名字點擊OK按鈕l 在彈出的GeneMapper Plate Editor界面中，填寫以下信息1. 在Sample Name欄中，輸入樣品名2. 在Comment欄中，輸入相關(guān)描述3. 在Sample Type欄中，選擇樣品類型4. 在Size Standard欄中，選擇合適的內(nèi)標5. 在Panel欄中，選擇合適的panel6. 在Analysis Method欄中，選擇合適的分析方法7. 在Snp Set欄中，選擇合適的SNP8. 輸入相關(guān)的用戶自定義信息9. 在Result Group 1欄中，選擇合適的Result Gro
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