課件)-b型dna僅僅是眾多dna雙螺旋構(gòu)象中的一種。在外界條(編輯修改稿)
2025-02-08 16:03 本頁(yè)面
【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 數(shù)旋數(shù) 。 ?其特點(diǎn)是： (1)可以是非整數(shù)； (2)是變量； (3)右手螺旋時(shí) ， W取負(fù)值 。 ?T（ Twisting number） ： 纏繞數(shù) ， 即雙螺旋的圈數(shù) 。 ?其特點(diǎn)是： (1) 可以是非整數(shù)； (2) 是變量； (3) 右手螺旋時(shí) T為正值 。 超螺旋的量度可以用 超螺旋密度 λ 來(lái)表示： λ= （ LT） /T 在天然 DNA中， λ 約為 （二） 三鏈和四鏈 DNA 這些 DNA分子的結(jié)構(gòu)單元分別是 三堿基體和 四堿基體 ； 這些堿基體通過(guò) WatsonCrick氫鍵 配對(duì)和Hoogsteen氫鍵 配對(duì)相互作用而結(jié)合成共平面聚合體： WatsonCrick－ Hoogsteen WatsonCrick－ reversed Hoogsteen Reversed WatsonCrick－ Hoogsteen Reversed WatsonCrick － reversed Hoogsteen 三鏈 DNA ? 基本結(jié)構(gòu)： ? PyPuPy構(gòu)象 (如 , +) ? PuPuPy構(gòu)象 (如 , ) H| DNA 表 9 2 不同類型 D N A 的三級(jí)結(jié)構(gòu)及性質(zhì)類 型 形態(tài) 拓?fù)浣Y(jié)構(gòu) 沉淀系數(shù)電泳遷移率Ⅰ 閉合環(huán) 超螺旋 1 . 4 1 最快Ⅰ176。 閉合環(huán) 松弛形 1 . 4 1 最慢Ⅱ 開(kāi)環(huán) 松弛形 1 . 1 4 同Ⅰ176。型Ⅲ 線形 松弛形 1 . 0 0 中等速度第四節(jié) DNA的變性與復(fù)性 變性 （ denaturation）或 解鏈 （ melting〕 復(fù)性 （ renaturation）或 退火 （ annealing） 成核作用 （ nucleation） 拉拉鏈作用 （ Zippering） DNA的復(fù)性對(duì)片段有兩個(gè)要求： (1) 互補(bǔ)順序的碰撞和排列； (2) 堿基的正確配對(duì)和氫鍵的形成。 下列因素可導(dǎo)致 DNA變性 ： ? 高溫 、 ? 酸 、 ? 堿 、 ? 尿素 、 ? 甲酰胺 DNA變性后物理性質(zhì)發(fā)生的變化 ： （ 1） 流體力學(xué)的性質(zhì)發(fā)生改變：粘度下 降 ， 而沉降速度增加； （ 2） 提高了對(duì)紫外線的吸收能力 ， 此稱為 增色效應(yīng) （ hyperchromic effect） 。 ?雙鏈 DNA的 A260=（ 濃度為 50μg/ml 時(shí) ，對(duì)波長(zhǎng) 260nm紫外線的吸收能力 ） ； ?單鏈 DNA的 A260=； ?游離堿基 或核苷酸的 A260=。 ?解鏈溫度 （ melting temperature, Tm）或 熔點(diǎn) ， Tm是 A260的升高達(dá)到極大值一半時(shí)的溫度 。 即是變性溫度范圍的中點(diǎn) 。 ?影響變性的因素： 外部條件 如 溫度 和 正離子 的濃度 。 濃度低于 ， 單價(jià)陽(yáng)離子增高 10倍 ， T m增加 176。 內(nèi)部條件 GC含量 及 分子類型 當(dāng) GC的含量上升 1%，則 Tm上升 ℃ 馬默多蒂 （ MarmurDoty） 關(guān)系式 ： Tm = +(G +C)%， 或 GC%=（ ） 復(fù)性動(dòng)力學(xué)公式 C 1 1 C0 2 1+KC0t1/2 根據(jù)復(fù)性動(dòng)力學(xué)公式我們可以知到些什么？ 復(fù)性進(jìn)行一半時(shí) = = (1) 單鏈濃度隨著時(shí)間的增大而減?。? (2） 反應(yīng)速率取決于初始的單鏈濃度 Co； (3) 以反應(yīng)濃度和 COt1/2為座標(biāo)可繪復(fù)性曲線； (4) 通過(guò) COt1/2值可測(cè)原核生物基因組的大??； 已知大腸桿菌的基因組為 , COt1/2 = COt1/2 （ 任何基因組 DNA） / = 任何基因組大小 / (5)原核生物基因組大小不同 ， 復(fù)性曲線也不同； (6) 可用以區(qū)分真核生物和原核生物基因組 。 單一順序和重復(fù)順序 復(fù)性動(dòng)力學(xué)曲線的區(qū)別 ?真核生物的 DNA有重復(fù)順序，而原核 生物多為單一順序。 (1) 單一順序的復(fù)性曲線常只有一個(gè)拐點(diǎn)， 而重復(fù)順序常有多個(gè)拐點(diǎn)。 (2) COt 比值變化范圍。 原核 生物的 COt比值為 100,
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