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正文內(nèi)容

pubmed完全攻略(編輯修改稿)

2024-09-26 05:53 本頁面
 

【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 文獻(xiàn)中心的主題詞稱主要主題詞( major topic headings),論述主題某一方面的內(nèi)容的詞稱為副主題詞。那么為什么要使用醫(yī)學(xué)主題詞呢? 我們先來看個(gè)比喻,如果有人問你感冒了嗎?你會(huì)不會(huì)回答 沒有啦,我只是有點(diǎn) 著涼發(fā)燒而已 呢?當(dāng)然不會(huì),因?yàn)槟阒栏忻熬褪侵鴽霭l(fā)燒。但一個(gè)檢索系統(tǒng),如果你 不告訴它的話,它就有可能不知道這一點(diǎn)。在期刊中,對(duì)于同一個(gè)概念往往可能有不同的描述形式,如 Tumor和 Neoplasm 都是指腫瘤。當(dāng)一個(gè)查詢者希望查閱腫瘤和 diet(飲食 )相關(guān)的文獻(xiàn)時(shí),他可能會(huì)輸入 Tumor,也可能輸入 Neoplasm 作為關(guān)鍵字,但其實(shí)這兩者之間是沒有區(qū)別的。一個(gè)愚蠢的檢索系統(tǒng)可能就認(rèn)識(shí)不到這點(diǎn),而像 PubMed這樣的 智能化 檢索系統(tǒng)就能夠準(zhǔn)確的意識(shí)到這點(diǎn),從而不會(huì)造成檢索結(jié)果的遺漏。 如何使用 如果你希望使用醫(yī)學(xué)主題詞進(jìn)行檢索,可以從 PubMed首頁上點(diǎn)擊 PubM ed Services 下 方的 MeSH Browser 即可進(jìn)入以下界面。 舉例說明,如果你想要檢索 Neoplasms 和 bone的相關(guān)文獻(xiàn),首先在 Me SH Browser 的 檢索框內(nèi)輸入檢索詞 Neoplasms,然后點(diǎn)擊 Browse按鈕,系統(tǒng)顯示其定義及在樹狀等級(jí)結(jié)構(gòu)中的位置,如下圖。 如果需要的話,你可以選擇 Detailed display,如同所示: 在這里,檢索系統(tǒng)將顯示詳細(xì)的內(nèi)容,可選擇特定的副主題詞,也可進(jìn)行主要主題詞或單個(gè)主題詞檢索,其選項(xiàng)如下: ( 1) Add the search to the following subheadings:點(diǎn)擊副主題詞前的方框,表示選 中該副主題詞,可連續(xù)選擇多個(gè)詞,它們之間的邏輯關(guān)系為 OR。 ( 2) Restrict Search to Major Topic headings only:若將檢出結(jié)果限定在主要 主題詞( Major Topic Heading)則可提高查準(zhǔn)率。 ( 3) Do Not Explode this term:系統(tǒng)要檢索某一主題詞時(shí),會(huì)自動(dòng)擴(kuò)展檢索( Ex plode),即將該主題詞的下位詞一并檢出。如果只需檢索單個(gè)主題詞,可點(diǎn)擊此按鈕。 完成上述選項(xiàng)后,點(diǎn)擊 Add按鈕,稍后在下一屏 Current Query的方框中將顯示所選的主題詞。 ( 3) Do Not Explode this term:系統(tǒng)要檢索某一主題詞時(shí),會(huì)自動(dòng)擴(kuò)展檢索 然后,我們?cè)僭?MeSH瀏覽器內(nèi)輸入 bone, 按檢索按鈕,系統(tǒng)會(huì)告訴你 bone不是一個(gè) 主題詞,但它會(huì)自動(dòng)將其轉(zhuǎn)換成主題詞 Bone and Bones, 同樣,其下方也會(huì)顯示出其定義及在樹狀等級(jí)結(jié)構(gòu)中的位置。你一樣可以選擇 Detailed display以便進(jìn)行更為精細(xì)的選擇,選擇完成后,點(diǎn)擊 Add按鈕,則進(jìn)入下面的界面。這時(shí),你只需點(diǎn)擊 PubMed Search按鈕即開始檢索,查詢出用這兩個(gè)主題詞為關(guān)鍵字以及所選擇的相應(yīng)邏輯關(guān)系的 文獻(xiàn)檢索結(jié)果。 總而言之,主題詞檢索法雖然稍嫌繁瑣,但其檢索結(jié)果的準(zhǔn)確性高,遺漏率低,是 最佳的檢索方法,一旦熟練掌握,將使得我們的檢索工作事半功倍。 第七章 如何獲取全文 當(dāng)很多人開始了解 PubMed,并且逐漸得心應(yīng)手的時(shí)候,都會(huì)面臨一個(gè)棘手的問題,即如何獲取全文?的確, PubMed 真正向公眾( public)免費(fèi)開放的只是摘要部分,而絕大部分文章都沒有全文提供。當(dāng)然,最省事最直截了當(dāng)?shù)淖龇?是在 PubMed 上花錢購買,但一篇文章動(dòng)輒十幾甚至幾十美金,使很多醫(yī)學(xué)工作者只好望而卻步。其實(shí),只要我們掌握一些技巧,還是有可能獲得一些文章的全文的。筆者查閱文獻(xiàn)數(shù)年為獲取全文也做了不懈努力,積累了一些經(jīng)驗(yàn)供大家參考。 一、 PubMed PubMed 上約有 5%的文獻(xiàn)是可以免費(fèi)看到全文的,通常這些文獻(xiàn)的左上角會(huì)有一個(gè) Fr ee Full Text的小標(biāo)記。你只要點(diǎn)擊這個(gè)圖標(biāo),系統(tǒng)就自動(dòng)鏈接入該文獻(xiàn)的全文。但有 兩點(diǎn)值得注意的是,第一,很多時(shí)候,這個(gè)圖標(biāo)在 PubMed處于顯示簡(jiǎn)要( summary)狀態(tài) 下并不出現(xiàn),而只有在選擇顯示摘要( abstract)時(shí)才出現(xiàn)。因此,如果你不只是泛泛瀏覽,而希望看到全文的話,我強(qiáng)烈建議你在 display 下拉菜單中選擇摘要( abstract)狀 態(tài)。第二,有些時(shí)候,小圖標(biāo)上僅標(biāo)著 Full Text,而并沒有 Free字樣,但仍然可以鏈接入全文,你不妨試一試。 二、免費(fèi)提供全文的期刊 天下沒有免費(fèi)的午餐,這句老話也不一定正確。有些期刊就提供全文免費(fèi)檢索。比 如著名的美國 Science(科學(xué))雜志,以前國內(nèi)很多高校、研究所的資料室都流傳著Science雜志的影印本,印 刷質(zhì)量低劣,而且有盜版之嫌。后來 Science 的老板充分理解到中國的國情,干脆順手做個(gè)人情,就與中國有關(guān)方面達(dá)成協(xié)議,使在中國大陸的讀者都可以 在網(wǎng)上免費(fèi)看到 Science 的全文。 方法如下: ( 1)先登錄 Science網(wǎng)址 : ,否則你得不到全文。 ( 2)點(diǎn)擊中間那個(gè) SEARCH 按鈕,就進(jìn)入查詢頁了。你可以選擇簡(jiǎn)單檢索還是復(fù)雜檢索。 ( 3)輸入您要找的關(guān)鍵詞(不一定是 MESH標(biāo)準(zhǔn)主題詞),再點(diǎn)擊 search就可以了。 ( 4)找出文章后,點(diǎn)擊標(biāo)題后的 Full Text,就可以瀏覽原文了。 除了 Science, 其他一些期刊如美國科學(xué)院院報(bào)( PNAS), Geics 等都可以在網(wǎng)上獲取全文,甚至能夠下載文獻(xiàn)的 pdf格 式,這樣就和真正在期刊上的排版形 式一模一樣了。一般而言,那些相應(yīng)期刊的網(wǎng)址是以 為域名的,往往提供免費(fèi)的全文。例如上面提到的兩家期刊的網(wǎng)址就分別是: ; 。 這里,我特別推薦一個(gè)提供免費(fèi)全文的網(wǎng)站 High Wire Press。該網(wǎng)站號(hào)稱擁有地球上最大最全的免費(fèi)的科學(xué)文獻(xiàn)全文數(shù)據(jù)庫。輸入網(wǎng)址 即可 登錄該網(wǎng)站,首頁即列出幾個(gè)生物醫(yī)學(xué)相關(guān)欄目,包括: 生命科學(xué)(包含:生物化學(xué) ,細(xì)胞和分子生物學(xué) / 微生物學(xué)與病 毒學(xué) / 免疫與免疫學(xué) / 神經(jīng)科學(xué)與神經(jīng)生物學(xué) / 生理學(xué) / 植物學(xué) / 其他生命科學(xué) / 醫(yī)學(xué)(包含:心血管醫(yī)學(xué) / 臨床醫(yī)學(xué) / 精神病學(xué)與心理學(xué) / 醫(yī) 學(xué)研究 /) 自然科學(xué)以及其他科學(xué)欄目。 你可以在這些欄目中選擇自己需要的期刊。然后,你需要重點(diǎn)看一下該期刊后面的的說明信息,尤其是提供免費(fèi)全文的方式,如 free ISSUES是在多長時(shí)間內(nèi)可以享受免費(fèi)索取原文,從 5年到一個(gè)月不等。而 free TRIAL 是在限定時(shí)間內(nèi) ,可以免費(fèi)提供原文。至于 free SITE 則是可以完全免費(fèi)獲取全文的站點(diǎn)。 當(dāng)然,你也可以在檢索框內(nèi)輸入關(guān)鍵字,然后點(diǎn)擊首頁右上方的 Search all journals ,你就可以在所有的 224種期刊里查找文獻(xiàn)了。不過由于所檢索到的結(jié)果僅僅 局限于這 200多種期刊,因此你一定要記住絕對(duì)不能用此網(wǎng)站來代替 PubMed,來 了解所研究課題的最新進(jìn)展。我個(gè)人的建議是,先在 PubMed上檢索,而僅以 High Wire Press作為獲取全文的一個(gè)途徑而已。 三、利用一些高校圖書館網(wǎng)站 國 內(nèi)一些高等院校,尤其是一些名牌高校的圖書館經(jīng)常和國外一些大的出版商簽訂 協(xié)議,支付不菲的費(fèi)用,從而可以檢索并看到所有由這些出版商出版的期刊的全文。你 可以就近到這些高校的圖書館的電子檢索廳去檢索,或者鏈接到大學(xué)圖書館的網(wǎng)站(如復(fù)旦大學(xué)圖書館的網(wǎng)址是 ),然后通過該網(wǎng)站的鏈接進(jìn)入相應(yīng)的檢索系統(tǒng)??上У氖牵瑥墓娋W(wǎng)到教育網(wǎng)之間的傳輸效率太低,很有可能等它等到你心痛,網(wǎng)頁還是猶抱琵琶半遮面。 四、 Free Medical Journals與 High Wire Press相似,該網(wǎng)站也提供了免費(fèi)各種可能搜集到的全文期刊的列表。 網(wǎng)址是 除了英文期刊 ,你還能檢索到一些小語種的期刊全文。方法是在這個(gè)網(wǎng)站的左面是導(dǎo)航條,點(diǎn)擊 Othe r Languages,里面有:法語、德語、加泰羅尼亞語、荷蘭語、希臘語、意大利語、挪威語、土耳其語、西班牙語和葡萄牙語等等。 五、向作者索要 這種方法究竟效率如何,沒有人統(tǒng)計(jì)過,不過在以上方法都沒有用時(shí)不妨試一試。 你可 以根據(jù)作者的 Email地址給作者去封信,先把對(duì)方的文章大大的吹捧一 番,說它如何 如何 exciting,如何如何 innovative,對(duì)自己的研究如何如何重要,然后說自己目前無法 access to the full text,最后非??锨械卣?qǐng)求他能否通過 把全文寄來。這里,我有兩條重要的建議。第一,不要簡(jiǎn)單的套用所謂的書信模板,應(yīng)該多談一談你現(xiàn)在的研究內(nèi)容以及對(duì)方的文章對(duì)自己的研究的重要性。這樣才有可能引起作者的興趣,不至于因?yàn)榍宦啥粚?duì)方直接刪除到垃圾箱里。我總結(jié)的另一個(gè)技巧是,向第一作者而不 是通信作者要全文。為什么這樣說呢?我們知道,一篇醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)往往有好幾個(gè)作者。文獻(xiàn)上有一個(gè)所謂的通信作者,通常是該實(shí)驗(yàn)室的老板。既然是老板,往往各種應(yīng)酬套磁自然頗多,每天 信箱里的信雜七雜八一大堆,他的私人秘書只會(huì)挑選出一些重要的信件,而那些明顯無關(guān)緊要的訊問信件自然就遭受冷落了。而文獻(xiàn)的第一作者,即該實(shí)驗(yàn)的主要承擔(dān)者,應(yīng)酬不會(huì)那么多,有 來訊問或索取文獻(xiàn)也樂于答復(fù)。那么又如何知道第一作者的 地址呢?其實(shí)這很容易,你只要到 PubMed 上顯示出文獻(xiàn)摘要,
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