【正文】 , ., Erker, ., Chalmers, ., Deasi, ., Mushahwar, ., 1999. Improved detection systems for TT virus reveal high prevalence in humans, nonhuman primates and farm animals. J. Gen. Virol. 80, 21152120. Mankertz, A., Caliskan, R., Hattermann, K., Hillenbrand, B., Kurzendoerfer, P., Mueller, B., Schmitt, C., Steinfeldt, T., Finsterbusch, T., 2021. Molecular biology of porcine circovirus: analyses of gene expression and viral replication. Vet. Microbiol. 98, 81– 88. Martelli, F., Caprioli, A., di Bartolo, I., Cibin, V., Pezzotti, G., Ruggeri, ., Ostanello, F., 2021. Detection of swine torque teno virus in italian pig herds. J. Vet. Med. 53, 234238. Mart237?？?cè)藬?shù)的變異位點(diǎn)，為 第一，第二和第三密碼子位置和氨基酸替換（顯示百分比 括號(hào)）也給出。, ., Lamoureux, L., Inglis, ., Leblanc, D., Houde, A., 2021. Molecular detection of bovine and porcine Torque teno virus in plasma and feces. Vet. Microbiol. 126, 271276. Brassard, J., Gagne, ., Houde, A., Poitras, E., Ward, P., 311 2021. Development of a realtime TaqMan PCR assay for the detection of porcine and bovine Torque teno virus. J. Ap. Micro. 108, 21912198. Ellis, ., Allan, G., Krakowka, S., 2021. Effect of coinfection with genogroup 1 porcine torque teno virus on porcine circovirus type 2associated postweaning multisystemic wasting syndrome in gnotobiotic pigs. Am. J. Vet. Res. 69, 1608 1614. Gallei, A., Pesch, S., Esking, ., Keller, C., Ohlinger, ., 2021. Porcine Torque teno virus: Determination of viral genomic loads by genogroupspecific multiplexrtPCR, detection of frequent multiple infections with genogroups 1 or 2, and establishment of viral fulllength sequences. Vet. Microbiol. 143, 202212. GrauRoma, L., 2021. New insights into the epidemiology of postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS). Facultat de Veterin224。黃等人， 2021 年），大大增加了對(duì)于豬 TTVs 知識(shí)。 而且，考慮到分歧，一樣高象 30%在 TTSuV1 之內(nèi)和所有西班牙染色體的被分離的位置和美國(guó)相比，并且亞洲人一個(gè)在種系發(fā)生的樹(shù)，某一種類(lèi)與一個(gè)潛在的地理依據(jù)的內(nèi)部結(jié)構(gòu)可能存在。 2021）。斯特蘭德貝格和索爾特， 2021）。盡管飽和度進(jìn)行的測(cè)試（未顯示數(shù)據(jù)）并沒(méi)有任何重大基因組區(qū)域（夏等人。通過(guò)與雞貧血病毒和豬 圓環(huán)病毒?；谶@些原因，新 的豬 TTVs13 全長(zhǎng)基因組，獲得來(lái)自西班牙和分析了 10 個(gè)已公布的基因組在一起。72等， 2021。 Biagini, 2021） 豬 TTV基因組大概 ， 到今天為止，十段來(lái)自日本，巴西，加拿大，德國(guó)和美國(guó)的全長(zhǎng)基因組都已經(jīng)被公布。 關(guān)鍵詞： 豬圓環(huán)病毒 , Anellovirus,DNA 病毒，基因組 。es, J., Kekarainen, T., Geic 以完整基因組為依據(jù)的豬圓環(huán)病毒 1 型（ Torque teno sus1 TTSuV1）和 2型（ Torque teno sus2 TTSuV2）的 遺傳變異和發(fā)展史 ,獸醫(yī)微生物學(xué) (2021), doi:，未經(jīng)編輯的文稿PDF 文件 作為我們的客戶服務(wù)，我們提供這一手稿的早期版本。noma 電話 23 + 34935814620 傳真 :+ 34935814490 Email: 運(yùn)行標(biāo)題 : 豬圓環(huán)病毒 1型 和 2 型 的發(fā)展史 13 株豬圓環(huán)病毒 1型（ Torque teno sus1 TTSuV1）和 2型 （ Torque teno sus2 TTSuV2） 檢查得到 了 樣化和演化的豬 TTVs。 Ellis et al., 2021。尼爾等人， 2021年）。 Brassard等， 2021。 2021年 ）比較完整的核苷酸序列和推導(dǎo)的氨基酸序列。不同的非編碼區(qū)，以及在其長(zhǎng)度為 838844臺(tái)幣之間 TTSuV1株和 793797 新臺(tái)幣 TTSuV2 之間 的 2829％，占整個(gè)基因組。 鈴木等人。在負(fù)選擇 /選擇性收縮率最高的密碼子報(bào)道了 ORF1基因（ ％和 ％，圖 1），盡管病毒 ORF2 和 ORF3 一些地區(qū)也有選擇性的約束。 Niel 等， 2021)。Learly 等， 1999。系統(tǒng)發(fā)育重建表明， TTSuV1 是分為三種類(lèi)型，其中一人報(bào)告了這項(xiàng)工作的第一時(shí)間，地理結(jié)構(gòu)的某種可能存在的。 圖 2成對(duì)的核苷酸序列比較序列分布在 23個(gè) TTSuV 基因組： 1，觀察內(nèi) TTSuV1和 TTSuV2 差異 。 圖 3 鄰 joining 進(jìn)化樹(shù)的基礎(chǔ)上， TTSuV 百分比的身份，在基因銀行中的基因組可從這項(xiàng)研究。 利益沖突聲明本論文的作者都沒(méi)有與其他人或組織可能不適當(dāng)?shù)赜绊懟蚱?jiàn)的論文內(nèi)容的財(cái)務(wù)或個(gè)人關(guān)系。 Brassard 等， 2021。 根據(jù)被觀察的在七條 TTV 染色體之中的 identity 作者暫時(shí)地提出的類(lèi)型 1a 和 1b 和子型 2a、豬的 TTSuV1 和TTSuV2 2b 和 2c，分別。 TTSuV1 和 TTSuV2之間的選擇模式，再次不同。 有關(guān)基因突變類(lèi)型，顛換（ TV，嘌呤或嘧啶對(duì)嘌呤嘧啶）已超過(guò)轉(zhuǎn)換支配的（ Ti，嘌呤嘌呤或嘧啶到嘧啶）為 TTSuV1（ 972 TV and 858 TI，χ 21df， P值），而在 TTSuV2 案件的模式完全相反，德州儀器寡不敵眾電視顯著（ 373 TV和 435 TI,，χ 21df， P值 ）。表 2 總結(jié)了 TTV 的基因變異之間。變化的有選擇性的壓力的作用和存在沿 TTSuV染色體的二個(gè)方法估計(jì) ： i)密謀非之間的數(shù)字的區(qū)別 synonymous 區(qū)別每個(gè)密碼子 (dS)和同義區(qū)別的數(shù)字每密碼子 (dN)被預(yù)言的 ORFs 的和 ii)計(jì)算 dS/dN 比率由 修改過(guò)的 NeiGojobori 方法 (Nei 和 Gojobori 1986)使用短冷期 (Korber 2021)可利用在 HIV 數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站 ( 估計(jì)與那些人的 TTV基因型比較。 Gallei等， 2021。