【正文】 和豬 圓環(huán)病毒。 結(jié)果和討論 五個 TTSuV1 和八個 TTSuV2 基因組（見表 1）分別擴增豬血清測序，并與幾個特點已經(jīng)發(fā)表的基因組一起序列。 TTV 的基因組的分子變異分析使用 MEGA4（田村等。 聚合酶鏈反應(yīng)條件為： 初始變性步驟 95℃ 5分鐘，隨后在 95 度 30 秒， 48℃（ TTSuV1）或 56℃（ TTSuV2）30 S 和 72186?；谶@些原因，新 的豬 TTVs13 全長基因組，獲得來自西班牙和分析了 10 個已公布的基因組在一起。 Huang等， 2021）。 Kekarainen等， 2021。Gallei等人， 2021年），以及越來越多的研究已經(jīng)專門為 TTSuV2搜查。72等， 2021。 TTSuV1已被描述在不同國家（ Learyet人， 1999年 。 其中，導(dǎo)致豬的兩個基因小組定義為： TTV1和 TTV2（岡本等人，2021年 。 Gallei等人， 2021年。 Biagini, 2021） 豬 TTV基因組大概 ， 到今天為止，十段來自日本，巴西，加拿大，德國和美國的全長基因組都已經(jīng)被公布。 高遺傳的 P 距離內(nèi)（ 30％）之間（ 50％）的物種已報告出具體 TTVs（ Jelcic et al., 2021。 Brassard et al., 2021。 TTVs 能夠感染幾種脊椎動物物種（ Ng et al., 2021。 關(guān)鍵詞： 豬圓環(huán)病毒 , Anellovirus,DNA 病毒，基因組 。 種系發(fā)生和基因分析支持 TTV分裂入二個種類 。 通訊作者 通訊地址 Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA), Universitat Aut242。 Cortey1, Lisa Macera1,2, Joaquim Segal233。es, J., Kekarainen, T., Geic 以完整基因組為依據(jù)的豬圓環(huán)病毒 1 型（ Torque teno sus1 TTSuV1）和 2型（ Torque teno sus2 TTSuV2）的 遺傳變異和發(fā)展史 ,獸醫(yī)微生物學(xué) (2021), doi:，未經(jīng)編輯的文稿PDF 文件 作為我們的客戶服務(wù)，我們提供這一手稿的早期版本。 畢 業(yè) 設(shè) 計（論 文） 外 文 參 考 資 料 及 譯 文 譯文題目： 豬細(xì)環(huán)病毒 ORF1 全基因組的克 隆與序列分析 學(xué)生姓名： 蔣瑩 學(xué) 號： 0721115633 專 業(yè)： 動物醫(yī)學(xué) 所在學(xué)院： 龍蟠學(xué)院 指導(dǎo)教師： 張志成 職 稱： 講師 2021 年 3 月 7 日 接受手稿 標(biāo)題 :以完整基因組為依據(jù)的豬圓環(huán)病毒 1型（ Torque teno sus1 TTSuV1）和2型 （ Torque teno sus2 TTSuV2）的 遺傳變異和發(fā)展史 作者 Mart180。這份手稿將進行審稿，排版，以及由此產(chǎn)生的證據(jù)審查 在其 出版之前 的 最后的形式。s, Tuija Kekarainen， Centre de Recerca en Sanitat Animal Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA), UABIRTA, Campus de la Universitat ut242。noma 電話 23 + 34935814620 傳真 :+ 34935814490 Email: 運行標(biāo)題 : 豬圓環(huán)病毒 1型 和 2 型 的發(fā)展史 13 株豬圓環(huán)病毒 1型（ Torque teno sus1 TTSuV1）和 2型 （ Torque teno sus2 TTSuV2） 檢查得到 了 樣化和演化的豬 TTVs。 TTSuV1表明高變異水平 (30%)，三種不同類型（第三首次描述）可能會顯示一個地理結(jié)構(gòu)。 多樣性 。 岡本 ,49 2021） Anelloviruses 目前被認(rèn)為非致病性，雖然他們已經(jīng)最近在多個病理條件下使人類和豬被感染 (Learly et al., 1999。 Ellis et al., 2021。 56 Biagini et al., 2021。（岡本等人， 2021年 。黃等人。尼爾等人， 2021年）。岡本等人， 2021年 。尼爾等人， 2021年 。（ Bigarr233。 Brassard等， 2021。而且很可能到處存在在國內(nèi)豬和野豬的體內(nèi) (Kekarainen and Segal233。 材料與方法 研究中使用的血清標(biāo)本，從以前通過測試，聚合酶鏈反應(yīng)積極的 9 豬 TTV 中獲得，獲得健康的育肥豬從 11日至 15 周齡。3 分鐘的 C， C 由 40 個循環(huán)最終于延長 5 分鐘 9972 攝氏度擴增產(chǎn)物經(jīng)電泳分離在 ％瓊脂糖凝膠，使用 NucleoSpin 提取純化二（馬謝雷格爾）。 2021年 ）比較完整的核苷酸序列和推導(dǎo)的氨基酸序列。 TTV 豬基因組 被認(rèn)為是稍有不同長度： KB 的 TTSuV2 基因組（ 2735 年至 2803 年 nt），以及 KB 的 TTSuV1（ 2863年至 2913 年 nt），主要是由于插入，刪除多個職位 700900 左右， 14001500和 16501750 位于群體。 ORF 外殼蛋白和復(fù)制相關(guān)蛋白通常在圓形單鏈 DNA 病毒 特點，比喻。與 ORF2 的一半，和 339。不同的非編碼區(qū)，以及在其長度為 838844臺幣之間 TTSuV1株和 793797 新臺幣 TTSuV2 之間 的 2829％，占整個基因組。對于 TTSuV1，一共有 1349 變量的位置進行了鑒定，含有 每個 平均單位 位置替換。 2021）。 TTSuV1 之間的這種不均衡和 TTSuV2 突變是在基因組的編碼區(qū)觀察，但不是在非編碼區(qū)，顯示幾乎相等的比例（ ％和 TTSuV2 TTSuV1％）。 鈴木等人。在 DNA 序列演化的過渡性變化率不同于顛的變化率，與TI一般比 TV 更頻繁發(fā)生。 TI 的偏見，這是觀察核，線粒體和葉綠體 DNA 與原核生物，真核生物和病毒。 中碼突變模式的差異，顯然也反映在同義與非同義氨基酸替換（ dS/ dN的，表 3），并在每個密碼子 dN的雙鏈差異（圖 1）地積比率。在負(fù)選擇 /選擇性收縮率最高的密碼子報道了 ORF1基因（ ％和 ％，圖 1），盡管病毒 ORF2 和 ORF3 一些地區(qū)也有選擇性的約束。總之，核苷酸替換似乎是采取結(jié)構(gòu)性的約束下，一些功能性的地方。 直方圖對 wised PI ()表示，在本研究中和 TTSuV2 之內(nèi)的核苷酸身分出版的 TTSuV1 高于 85%。 相反，在 TTSuV2 之中被觀察的極小的身分是 88%。 Niel 等， 2021)。 TTSuV1 和 TTSuV2 (%)類似 Niel (2021)和黃等獲得的那個等 (2021)，在種類定義的更低的邊界的 TTV，但是接近類狀態(tài)。 量的多樣性 TTSuV2檢測 “ （ 15％）較低。在第二個方案，四個額外的子類型可以定義：二維（ TTSuV2G61）， 2e（ TTSuV2G64），2樓（ TTSuV2GE1 和 TTSuV2GE9）和 2G（ TTSuV2G31， TTSuV2G33 和 TTSuV21907）。Learly 等， 1999。岡本等人， 2021 年。在目前的研究已特點 TTV 的豬基因組和基因組的比較可在文獻(xiàn)中。在更保守的非編碼區(qū)翻譯區(qū)和更變量。系統(tǒng)發(fā)育重建表明， TTSuV1 是分為三種類型，其中一人報告了這項工作的第一時間，地理結(jié)構(gòu)的某種可能存在