【正文】 但隨后，由于在動物毒性研究中發(fā)現(xiàn)其會劑量依賴導(dǎo)致強(qiáng)烈的免疫刺激， Anadys 終止了針對 HCV 病人的一個 28 天的Ⅰ b 期臨床項目?，F(xiàn)將部分化合物活性列出 （ TLR7 HEK293） ： 編號 結(jié)構(gòu) 編號 結(jié)構(gòu) 1 EC50= 3 EC50= 50 15 EC50= 16 EC50= 17 EC50= 18 EC50= 在專利 US2020306610A124中， Aamp。其中， SM276001在 2020 年作為 HBV和 HCV的治療藥物處在臨床前研究。以，每周兩次，連續(xù)四周，在此計量水平下化合物能被很好的耐受，但是沒有表現(xiàn)出有意義的病毒載量和顯著的系統(tǒng)性細(xì)胞因子和生物標(biāo)記物水平的改變。 Zhou, L.。 Lawrence, B. S.。 Lemm, J.。 Xuejie, Y.。 Hua, F.。 Peter, T. N.。 JinHua, S.。 Lawrence, B. S., Inhibitors of HCV NS5A: From Iminothiazolidinones to Symmetrical Stilbenes. ACS Medicinal Chemistry Letters 2020, 2。 Hickey, M.。 Luc, J. W. v. d. L., New targets for treatment against HCV infection. Best Practice amp。而比較 30 與化合物 3 苯甲酰胺和苯胺環(huán)的構(gòu)想， 發(fā)現(xiàn)相差很大，推測，可能化合物 3 的構(gòu)象與 NS5A GT1b的生物構(gòu)象較符合，而 30 則與 NS5A GT1a 的較符合。而延長飽和烷基鏈的鏈長，活性降低程度中等。 C） NS5A 結(jié)構(gòu)相對內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的位置。此非結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)也參與若干細(xì)胞過程，比如干擾素抵抗以及凋亡調(diào)節(jié)。 途徑 /新穎性 藥物 進(jìn)展 備注（靶點等） 評價 風(fēng)險 潛力 釋放 ★★★☆ celgosivir Phase 2 Glucosidase inhibitors ★★★☆ ★★★☆ 、 其它方式 。 NS2 和 NS3 具有蛋白酶活性，參與病毒多聚蛋白前體的切割。大約 7585%的新感染者出現(xiàn)慢性肝病，慢性感染者中 6070%會出現(xiàn)慢性肝病，520%會出現(xiàn)肝硬化， 15%會死于肝硬化或肝癌。但干擾素在全球并不能普遍獲得， 并不總是耐受良好，有些病毒基因型對干擾素的反應(yīng)優(yōu)于其它基因型，而且許多使用干擾素治療的人未完成其療程。 圖三、 HCV的生命周期 6 三、 以生命周期劃分 HCV治療藥物整理 對 HCV不同周期時藥物所針對的不同 途徑，我們分四個階段進(jìn)行總結(jié)，大體如下圖所示： 同時，我們對各個途徑的新穎性，各個靶點、藥物的風(fēng)險、 潛力進(jìn)行了簡單的評級 ，黑色四星（ ★★★ ★ ）為最高， 白色四星（ ☆☆☆☆ ）最低。 綜合上述總結(jié)， 我們認(rèn)為 HCV 藥物最具潛力治療方式是將核苷聚合酶 抑制劑（ NS5B 抑制劑） 、 NS5A 抑制劑 、 蛋白酶抑制劑結(jié)合的療法。最近研究又發(fā)現(xiàn)區(qū)域三（ 356447 殘基）在病毒組裝而不是 RNA 復(fù)制中起到關(guān)鍵作用。 20 表一、代表性 NS5A 抑制劑 Comp Company In vitro EC50 (pM) Phase 1b 1a BMS790052(daclatasvir) Bristol–Myers Squibb 9 50 3 GS5885 Gilead 4 34 2 ABT267（結(jié)構(gòu)未知，以專利中代表性化合物代替） US2020172368A1 Abbott 5 14 2 GSK2336805， WO2020091446A1 GlaxoSmithKline 8 44 2 ACH2928（結(jié)構(gòu)未知，以專利中代表性化合物代替） Achillion 2–3 46 1 ACH3102（結(jié)構(gòu)未知，以專利中 代表性化合物代替） US2020302538A1 Achillion 4 10 1 PPI461（結(jié)構(gòu)未知，以專利中代表性化合物代替）WO2020096777A1 Presidio 10 210 1 21 續(xù)表一、代表性 NS5A 抑制劑 Comp Company In vitro EC50 (pM) Phase 1b 1a PPI668（結(jié)構(gòu)未知，以專 利中代表性化合物代替） US2020115855A1 Presidio 10 100 1 IDX719（結(jié)構(gòu)未知，以專利中代表性化合物代替） US2020200827A1 Idenix 3 8 1 EDP239（結(jié)構(gòu)未知，以專利中代表性化合物代替） US2020217261A1 Enanta/Novartis 4 34 PC MK8742（結(jié)構(gòu)未知，以專利中代表性化合物代替） US2020083483A1 Merck 3 4 PC 還有另外一些結(jié)構(gòu)類型，僅挑選其中高活性代表化合物，見下表： 22 表二、其它代表性 NS5A 抑制劑 Comp Company In vitro EC50 (pM) 注 1b 1a Example 1002 BOEHRINGER INGELHEIM INTERNATIONA 15 230 Example 44 JANSSEN Ramp。引入雜環(huán)，改變聯(lián)苯的角度，也對活性不理利。 (b) Scheel, T.。 (g) Vermehren, J.。 Scott, W. M.。 Ramesh, K.。 Lawrence, B. S., HCV NS5A replication plex inhibitors. Part 2: Investigation of stilbene prolinamides. Bioanic amp。 Robert, A. F.。 Mengping, L.。 St Laurent, D.。 medicinal chemistry letters 2020, 23 (15), 44284435. 4. Donald, R. O. B., II。 Amblard, F.。 McBrayer, T.。此化合物能夠計量依賴和給藥頻率依賴的誘導(dǎo)免疫生物標(biāo)記物和 IFN 反應(yīng)。在 C2 位的功能團(tuán)化也得到 TLR7 強(qiáng)效激動劑如 SM360320，在干細(xì)胞中能夠抑制 HCV復(fù)制。 而在專利 US2020098248A127中， Gilead Science, 更深入的研究，披露了以下骨架： 54 此類化合物是 TLR7 的激動劑，給出結(jié)構(gòu)的 59 個化合物中多數(shù)化合物的活性（ MEC）接近 1nM。 部分化合物結(jié)構(gòu)見下表： 編號 結(jié)構(gòu) 編號 結(jié)構(gòu) 1 2 3 4 5 6 66 7 而在專利 US2020258928A136， US2020316327A137 中， Gilead Science, Inc.公司披露了以下兩個骨架： 此類化合物是 HCV治療藥物的前藥，但在專利中并沒有提及機(jī)理是否是通過 TLR 途徑實現(xiàn)，然而鑒于其與上述 Anadys 化合物結(jié)構(gòu)的相似性，也將其進(jìn)展列出。其中，艾沙托立賓進(jìn)入到治療 HCV 感染的Ⅱ期臨床實驗。D 公司披露了以下結(jié)構(gòu)骨架： 此專利 披露了 7 個化合物結(jié)構(gòu)，部分活性結(jié)果見下表（ 活性結(jié)果 pEC50 為TLR7 激動劑誘導(dǎo) SEAP（ secreted alkaline phosphatase）產(chǎn)生達(dá)到此化合物最大水平一半時所需的濃度）。 36 Comp R EC50， nM Comp R EC50， nM 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 目前，相關(guān)專利中對此類化合物的涵蓋范圍如下： Pfizer 公司的 US2020197478A114 、 US2020039884A11 US2020302598A116三篇專利。 化合物分類依據(jù)其核心結(jié)構(gòu)特點進(jìn)行。 Tharnish, P.。 Jeffrey, L. R.。 O39。 Jeffrey, L. R.。 Medicinal Chemistry Letters 2020, 23。 Michael, H. .。 Peter, T. N.。 JinHua, S.。 therapeutics 2020, 32 (1), 1428. 2. (a) Tellinghuisen, T.。 Vliegen, I.。 同時，在咪唑上的某些鹵素取代也改善了化合物的藥 藥相互作用問題。 BMS411 的結(jié)構(gòu)如下圖所示： 23 結(jié)合方式通過 QUANTA軟件模擬，可見 BMS411活性狀態(tài)為 γ扭曲形結(jié)構(gòu)，橫穿 NS5A 二聚體的接觸面，其“蓋子”區(qū)靠近 Y93 氨基酸，其核心區(qū)域平躺于氨基酸 L31 殘基之下，氨基酸殘基 Q54 靠近 BMS411 的末端，并與 α螺旋的氨基酸殘基 L28 相接觸。 B、 D 兩圖顯示區(qū)域一的保守度，一不同顏色表示，品紅色表示 95%，淡粉紅色表示75%95%，白色表示 75%。 NS5A在 HCV復(fù)制和組裝中起到重要作用 ， 還與宿主免疫反應(yīng)有關(guān)， 是一個比較新穎的靶點 ，此類藥物大多處在臨床階段，這給我們很多 追趕 機(jī)會 研發(fā)出中國自主的丙肝治療藥物 。不耐突變，與其它藥物連用效果好。 一、 HCV的結(jié)構(gòu) ： 如 右 圖所示 ， HCV 病毒體呈球形，直徑小于 80nm（在肝細(xì)胞中為 3640nm，在血液中為 3662nm），為單 股正鏈 RNA 病毒，在核衣殼外包繞含脂質(zhì)的囊膜，囊膜上有剌突 . 圖一、 HCV結(jié)構(gòu) 如下圖所示， HCV 的 RNA 大約 由 9500－ 10000bp 組成， 5′和 3′非編碼區(qū)（ NCR）分別有 319341bp 和 2755bp，含有幾個順向和反向重復(fù)序列，可能與基因復(fù)制有關(guān)。1 目錄 丙型肝炎治療藥物研究與設(shè)計 ………………………………………………………3 以生命周期劃分 HCV 治療藥物整理 ………………………………………4 HCV 的結(jié)構(gòu) ………………...……………………………………………4 HCV 生命周期 ………………………………………………………...…5 以生命周期劃分 HCV 治療藥物整理 …………………………..............6 總結(jié)和展望 ………………………...…………………………..……….13 基于 NS5A抑制劑的創(chuàng)新藥物設(shè)計 ………………………………………14 前言 ..........................................................................................................14 NS5A靶點 ...............................................................................................14 NS5A抑制劑研究進(jìn)展 ...........................................................................15 BMS790052(daclatasvir)研究 ................................................................20 創(chuàng)新藥物設(shè)計 ..........................................................................................24 參考文獻(xiàn) ..................................................................................................26 TLR7 激動劑研究與設(shè)計 ………………………………………………….29 目前已開發(fā)的激動劑 ..............................................................................29 咪唑喹啉胺（ imidazoquinoline amine）類 ..................................29 1取代 吡唑啉酮 （ 1Substituted Pyrazolo(3,4C) Ring）類 ......31 8氧 去氮嘌呤類 /咪唑并吡啶酮類 ............................................32 8羥基腺嘌呤（ 8Hydr