【正文】 香族氨基酸與脂肪族氨基酸 ? 極性氨基酸與非極性氨基酸 按照 R基的化學(xué)結(jié)構(gòu)分類 （ 1）、 R為脂肪烴基的氨基酸（ 5種） （ 2）、 R中含有羥基和硫的氨基酸（共 4種） （ 3）、 R中含有酰胺基團(tuán)（ 2種） （ 4）、 R中含有酸性基團(tuán)（ 2種） （ 5）、 R中含堿性基團(tuán)（ 3種） （ 6）、 芳香族氨基酸 （ 7）、雜環(huán)族氨基酸（ 1種） 極性分類可分為： a)非極性氨基酸： Ala， Val， Leu， Ile，Pro， Phe,Try,Met。 第一節(jié) 蛋白質(zhì)通論 ?蛋白質(zhì)的組成與分類 ?蛋白質(zhì)的大小與分子量 ?蛋白質(zhì)的構(gòu)象 ?蛋白質(zhì)的功能 第二節(jié) 蛋白質(zhì)的組成－氨基酸 ? 組成蛋白質(zhì)的基本單位是氨基酸 。 ② 不溶于非極性溶劑 → 極性分子 ③ 介電常數(shù)高 → 水溶液中的氨基酸是極性分子 。 λ（ nm） ε Tyr 275 103 Phe 257 102 Trp 280 103 3． 氨基酸的化學(xué)反應(yīng) （ 1） 氨基參與的反應(yīng) ?與亞硝酸反應(yīng) （ Van Slyke 法測(cè)定氨基酸 ） ?Sanger 反應(yīng) ： （ DNFB） ?Edman反應(yīng)：苯異硫氰酸酯， PITC ? 生成西佛堿的反應(yīng)（ Schiff）：西佛堿是某些酶促反應(yīng)的中間產(chǎn)物（如轉(zhuǎn)氨基反應(yīng)的中間產(chǎn)物）。 一、一級(jí)結(jié)構(gòu) （一）氨基酸的連接方式 肽鍵 二硫鍵 鉸鏈 異肽鍵 ?蛋白質(zhì)是由若干氨基酸的氨基與羧基經(jīng)脫水縮合而連接起來形成的長鏈化合物。 G lu Cys G l y G lu Cys G ly S H S S G l u Cys G ly 谷胱甘肽的生理功用： ?解毒作用 ：與毒物或藥物結(jié)合 ， 消除其毒性作用； ?參與氧化還原反應(yīng) ：作為重要的還原劑 ，參與體內(nèi)多種氧化還原反應(yīng)； ?保護(hù)巰基酶的活性 ：使巰基酶的活性基團(tuán) SH維持還原狀態(tài)； ?維持紅細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定 ：消除氧化劑對(duì)紅細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)的破壞作用 。 端基分析 ① N端分析 ★ DNScl法：最常用 ， 黃色熒光 ， 靈敏度極高 ， DNS多肽水解后的 DNS氨基酸不需要提取 。 親源關(guān)系越遠(yuǎn) ， 同源蛋白的氨基酸順序差異就越大 。 ?蛋白質(zhì)分子中的許多氨基酸殘基側(cè)鏈也是非極性的 ， 這些非極性的基團(tuán)在水中也可相互聚集 ， 形成疏水鍵 ， 如 Leu， Ile，Val， Phe， Ala等的側(cè)鏈基團(tuán) 。 但由于α 碳原子與其他原子之間均形成單鍵 ，因此兩相鄰的肽鍵平面可以作相對(duì)旋轉(zhuǎn) 。 （二）蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的類型： ?蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)主要包括 α 螺旋 ，β 折迭 ， β 轉(zhuǎn)角及無規(guī)卷曲等幾種類型 。 2. β 折迭： ?β 折迭是由若干肽段或肽鏈排列起來所形成的扇面狀片層構(gòu)象 ， 其結(jié)構(gòu)特征為： ⑴ 由若干條肽段或肽鏈平行或反平行排列組成片狀結(jié)構(gòu)； ⑵ 主鏈骨架伸展呈鋸齒狀； ⑶ 借相鄰主鏈之間的氫鍵維系 。 復(fù)繞 α螺旋（ αα結(jié)構(gòu) ） βxβ結(jié)構(gòu) β曲折（ βmeander） 回形拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)（希臘鑰匙） β折疊桶 α螺旋 β轉(zhuǎn)角 α螺旋 鋅指結(jié)構(gòu) (螺旋 折迭 折迭模序 ) 轉(zhuǎn)錄因子 MyoD的螺旋 環(huán) 螺旋模序 四、 結(jié)構(gòu)域 domain， motif(模塊 ) 在二級(jí)結(jié)構(gòu)及超二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，多肽鏈進(jìn)一步卷曲折疊，組裝成幾個(gè)相對(duì)獨(dú)立的、近似球形的三維實(shí)體。 三級(jí)結(jié)構(gòu)有以下特點(diǎn)： ? 許多在一級(jí)結(jié)構(gòu)上相差很遠(yuǎn)的 aa堿基在三級(jí)結(jié)構(gòu)上相距很近 。 （ 2）、 肌紅蛋白的氧合曲線 胰島素分子的三級(jí)結(jié)構(gòu) 溶菌酶分子的三級(jí)結(jié)構(gòu) 磷酸丙糖異構(gòu)酶和丙酮酸激酶的三級(jí)結(jié)構(gòu) 六、蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu) ?蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu) （ quaternary structure)就是指蛋白質(zhì)分子中亞基的立體排布 ， 亞基間的相互作用與接觸部位的布局 。 ?具有協(xié)同效應(yīng)和別構(gòu)效應(yīng)，實(shí)現(xiàn)對(duì)酶活性的調(diào)節(jié) 亞基的立體排布 血紅蛋白的結(jié)構(gòu)與功能 血紅蛋白的結(jié)構(gòu)： 成人： HbA： α2β2 98% ， HbA2： α2δ2 2% 胎兒： HbF α2γ2 早期胚胎： α2ε2 ▲ 接近于球體 ， 4個(gè)亞基分別在四面體的四個(gè)角上 ， 每個(gè)亞基上有一個(gè)血紅素輔基 。 ★ 正協(xié)同效性： 一種配基的結(jié)合促進(jìn)后續(xù)配基的結(jié)合 ， S型配體結(jié)合曲線 。 無 BPG時(shí) ， P50=1 torr， BPG= ， P50=26 torr BPG進(jìn)一步提高了血紅蛋白的輸氧效率。 （三）蛋白質(zhì)的變性、沉淀和凝固： ? 在某些物理或化學(xué)因素的作用下 ， 蛋白質(zhì)嚴(yán)格的空間結(jié)構(gòu)被破壞 （ 不包括肽鍵的斷裂 ） ， 從而引起蛋白質(zhì)若干理化性質(zhì)和生物學(xué)性質(zhì)的改變 ， 稱為蛋白質(zhì)的變性 (denaturation)。 因此 ， 凡凝固的蛋白質(zhì)一定發(fā)生變性 。 （二）電泳： ?帶電粒子在電場(chǎng)中移動(dòng)的現(xiàn)象稱為 電泳（ electrophoresis) 。 2. 取一定量的樣品進(jìn)行完全水解 ， 再用氨基酸自動(dòng)分析儀 ， 測(cè)定蛋白質(zhì)的氨基酸組成 。