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分子標記在植物遺傳育種中的應用(完整版)

2025-02-18 20:09上一頁面

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【正文】 合作用的結(jié)果。生化標記 —— 貯藏蛋白和同工酶n 貯藏蛋白n 同工酶n 特點:經(jīng)濟、方便、成本較低n 結(jié)構(gòu)基因表達產(chǎn)物,對非結(jié)構(gòu)基因無能為力;所檢測位點只是基因組一部分;數(shù)量有限,有時受發(fā)育時期和環(huán)境影響。PolymorphismSequence20分鐘,抽真空,水冼n 印跡:加入 n 洗脫:將膜轉(zhuǎn)入洗脫盒,加入洗脫液 65℃ RFLP探針探針標記 — 隨機引物法n 25RAPDn 原理:n 用一個隨機引物( 810bp)、 堿基隨機排列的寡核苷酸序列,非定點地擴增基因組 DNA, 然后電泳分開擴增片段。 539。l) 1181。l) 95℃ GOTO5分鐘 l 缺點:l 對反應條件非常敏感,重復性差。l同一類內(nèi)堿基種類不同的 SSR,豐度差別很大。 部分 SSR可產(chǎn)生轉(zhuǎn)錄啟動復合物或活化染色體v 兩端序列多是保守的單拷貝序列,可以根據(jù)兩端序列設(shè)計一對特異引物,通過 PCR將其間微衛(wèi)星序列擴增出來,利用電泳技術(shù)獲得長度多態(tài)性。l混合后,進行 PCR擴增 :Step1 2分鐘Step2 30秒Step3 30秒Step4 60秒Step5 SSR的特點:l 兩側(cè)順序保守,在同種間多相同;l 數(shù)量豐富,在整個基因組均勻隨機分布;l 實驗重復性好,結(jié)果可靠;l 多數(shù) SSR增減重復序列頻率高,在品種間具廣泛位點變異;l 共顯性標記,可鑒別雜合子和純合子;l 僅需微量組織,適合 PCR分析半自動化v 相對的物種專一性;v 由于開發(fā)時需針對每個座位的微衛(wèi)星序列,發(fā)現(xiàn)其兩端的單拷貝序列設(shè)計引物,需建立基因文庫、克隆識別與篩選、測序等過程,開發(fā)困難,費用較高,耗時長;v 實際分析時一般每次只分析單個位點;v 不同引物退火溫度不同,需要探索。;P00:539。( 2)多態(tài)性遠遠超過其它分子標記,一般可檢測到 50100個 AFLP擴增產(chǎn)物,能夠在遺傳關(guān)系十分相近的材料產(chǎn)生多態(tài)性,被認為是指紋圖譜技術(shù)中多態(tài)性最豐富的一項技術(shù)。AFLP操作具體包括三個步驟:1.PstⅠ pmol/181。 ATP( 10mM) T4連接酶( 3U/181。 加水至 25181。引物( P00, 50ng/181。Mg2+( 30mM) Step1 95℃ 2分鐘Step8 72℃ 60秒3.酶切 連接反應可以分開作,也可以合在一起作,但合在一起更方便些。matching(1979)相似系數(shù) .其中 n 根據(jù)遺傳特性確定的羅杰斯距離在相關(guān)種質(zhì)的親緣關(guān)系分析中非常有用;而改良的羅杰斯距離還適用于雜種優(yōu)勢研究。特點:n 雙等位基因n 在基因組中的發(fā)生頻率比較高n 有些 SNP位點還影響基因的功能 gelmarkerasdensityQTL作圖所需的數(shù)據(jù)作圖所需的數(shù)據(jù)遺傳標記數(shù)據(jù) 數(shù)量性狀數(shù)據(jù)?分子標記連鎖圖譜的構(gòu)建? 定位群體親本間多態(tài)性分子標記的篩選? 定位群體的組建? 定位群體分子標記分析? 分子標記連鎖圖譜的繪制利用 3個分離群體,一個人,三個月時間,能完成包括 1032個 AFLP標記的遺傳連鎖圖譜( Faye等 1995) 。特點: 高度的個體特異性、環(huán)境的穩(wěn)定性及豐富的多態(tài)性 。優(yōu)點:克服了許多作物沒有或難以創(chuàng)造相應 NILs的限制 (Michelmore等 1991)。數(shù)量性狀基因的定位基于圖譜的基因克隆 誰最先了解基因的功能,誰就擁有了該基因的知識產(chǎn)權(quán),也就獲得了更多的利潤。216。AFLP研究基因表達是非常有效的方法,可同時比較植物發(fā)育的不同時期以及分離某些重要基因( cDNAAFLP)。? 張啟發(fā)認為 :? 分子標記雜合度與雜種優(yōu)勢的相關(guān)性因遺傳材料而異,在經(jīng)過改良的優(yōu)良種質(zhì)中,兩者之間高度相關(guān),而在一些未經(jīng)改良的優(yōu)良種質(zhì)中,相關(guān)程度很低。標準測驗種 n 進行選擇,無需測交或自交檢驗 。有效選擇目標基因附近發(fā)生重組的個體n 回交育種中 , 傳統(tǒng)解決連鎖累贅方式是通過擴大選擇群體或增加回交次數(shù)。3)QTL之間存在互作關(guān)系 ,使得對 QTL的效應估計發(fā)生偏差 。 三月 2116:37:4616:37Mar2111Mar21n 1故人江海別,幾度隔山川。 三月 21三月 21Thursday, March 11, 2023n 很多事情努力了未必有結(jié)果,但是不努力卻什么改變也沒有。 2023/3/11 16:37:4616:37:4611 March 2023n 1空山新雨后,天氣晚來秋。 11 三月 20234:37:46 下午 16:37:46三月 21n 1最具挑戰(zhàn)性的挑戰(zhàn)莫過于提升自我。 2023/3/11 16:37:4616:37:4611 March 2023n 1一個人即使已登上頂峰,也仍要自強不息。 三月 21三月 21Thursday, March 11, 2023n 閱讀一切好書如同和過去最杰出的人談話。 三月 2116:37:4616:37Mar2111Mar21n 1世間成事,不求其絕對圓滿,留一份不足,可得無限完美。 三月 21三月 2116:37:4616:37:46March 11, 2023n 1他鄉(xiāng)生白發(fā),舊國見青山。n Khan等( 2023)以 AFLP等分子標記輔助選擇,將二粒小麥 6BS的高谷蛋白 QTL成功地轉(zhuǎn)入普通小麥品種 Glupro。n Tanksley研究表明,用位于目標基因兩側(cè)1cM的兩個分子標記進行輔助選擇,通過兩個世代就可獲得含目標基因長度不大于2cM的個體,如果采用傳統(tǒng)的育種方式則需要 100代??焖龠x出以輪回親本為遺傳背景的單株n 在回交育種中不僅要考慮優(yōu)良性狀的導入,還必須考慮保持其整個基因組的遺傳背景基本不變。–四平頭 Dom 黃早四–旅大紅骨 丹 340–BSSS A B73–PA 掖 478–Lancaster B Mo17–PB類群 亞群 n 應用 cDNA- AFLP技術(shù)進行雜種優(yōu)勢機理的研究表明,強優(yōu)勢與弱優(yōu)勢組合間基因表達有明顯差異,有增強型、減弱型和沉默型。在植物育種上的應用n 在雜交育種中,單單根據(jù)育種材料的表型特點選配親本,往往會受到環(huán)境條件的干擾。? eg 番茄、馬鈴薯和辣椒( Tanksley等 1988; 1992);? 水稻、小麥和玉米( Ahn等, 1993; 1994);? 小麥、大麥和黑麥( Devos等, 1993);? 高粱和玉米( Pereira等, 1994);? 以及大麥和水稻( Maroof等, 1996)? ... ...n 比較基因組學研究表明,不同物種之間在標記探針的同源性,拷貝數(shù)及連鎖順序上都具有很大程度的保守性。Trait其中 AFLP被推薦為指紋圖譜繪制的最佳方法之一。在植物遺傳多樣性研究上的應用n 對植物種質(zhì)資源遺傳多樣性的全面了解,對于拓寬遺傳基礎(chǔ)的育種策略十分重要。distance“routetwohybridcSSR、 cSNP——— 從 EST中開發(fā) SSR、 SNPn 目前某些植物全序列的測定及 EST數(shù)據(jù)庫的開發(fā),為 SSR、 SNP的開發(fā)開辟了 新的途徑 。常用 UPGMAn 分析軟件: ( Rholf, 1998)QTL分析l ‘A’ Homozygote for the allele from A parentl ‘B’ Homozygote for the allele from B parentl ‘H’ Heterozygote carrying both alelles A and Bl ‘C’ Either BB or AB genotypel ‘D’ Either AA or AB genotypel ‘’ Missing data for the individual at this locusdata type F2 intercross20 5 1*locus1 BBBHHAAABBBHHHAABA*locus2 ABABHABHABABABHAH*locus3 ABBAHHH
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