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[理學(xué)]如何做好酶切(完整版)

  

【正文】 切一般要維持在1050ul,酶切鑒定1020ul就可以了。一般反應(yīng)都用37度,但是 Sma I 的最適合溫度是25度,37度時(shí)酶仍表現(xiàn)出活性,但是效率下降50%。 2.如果遇到酶切不動(dòng)或切不完全,該怎么辦? 要回答這么問(wèn)題常常需要了解酶活性單位是如何確定,我們多次接到這樣的問(wèn)題:1個(gè)單位的酶能在60分鐘內(nèi)切1ug的DNA,為什么我們的DNA那么少切那么長(zhǎng)時(shí)間也不能切開或切完全? 從下面幾個(gè)因素去考慮: 1) 酶是否有活性:酶的活性單位通常是在60分鐘酶切1ug lambda DNA或特定線狀DNA所需要的酶量。對(duì)超螺旋狀DNA完全酶切所需要的酶量要比線狀的高好幾倍(在我們的目錄上有部分酶是有標(biāo)注的),同時(shí)需要提高酶的用量(10U/ug)和延長(zhǎng)反應(yīng)時(shí)間等措施。注意有些研究人員將buffer長(zhǎng)時(shí)間放在4度或室溫,這是很不規(guī)范的行為。 4.如何對(duì)PCR擴(kuò)增的產(chǎn)物進(jìn)行酶切? Fermentas公司的研究表明,限制性內(nèi)切酶在 PCR擴(kuò)增體系中仍然有部分活性,可以通過(guò)稀釋(3倍以上)擴(kuò)增混合液,適當(dāng)提高酶量和反映時(shí)間,進(jìn)行酶切。結(jié)果是要么裝不上去,要么裝上去切不下來(lái),測(cè)序發(fā)現(xiàn)末端引物堿基少了。通常是將緩沖、酶和適量的水配制成一個(gè)混合物,然后分裝,最后加模板。 3) 模板純度是否夠:模板
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