【正文】 生成的，而不是由異戊二烯合成的 一、 萜類 一些真核蛋白質(zhì)合成后經(jīng)過異戊二烯化，常見的異戊二烯基團(tuán)就是 farnesyl 和 geranylgeranyl group ９ 二、 固醇類 結(jié)構(gòu)： 含有環(huán)戊烷多氫菲母核的一類醇、酸及其衍生物。 Plaque 中的膽固醇大部分是來自粥樣細(xì)胞吞噬的 LDL。 （ 3） 低密度脂蛋白 (LDL， )，把膽固醇運(yùn)輸?shù)浇M織，經(jīng)過一系列復(fù)雜的過程， LDL 與 LDL 受體結(jié)合并被細(xì)胞吞食。 ? 鞘脂貯積病 (sphingolipld storage disease, sphingolipidose) 溶酶體貯積病是由于降解某種特定代謝物的酶發(fā)生遺傳性缺陷造成的。 中樞神經(jīng)系統(tǒng)某些神經(jīng)元膜的特征性脂，可能與通過神經(jīng)元的神經(jīng)沖動傳遞有關(guān)。 圖 在鞘糖脂中，單糖、雙糖或寡糖通過 O糖苷鍵與神經(jīng)酰胺相連，重要的鞘糖脂有腦苷脂(cerebroside)、硫腦苷脂 (sulfatide)和神經(jīng)節(jié)苷脂 (ganglioside)。 鞘磷脂結(jié)構(gòu)與甘油磷脂相似，因此性質(zhì)與甘油磷脂基本相同。 鞘氨醇磷脂只是以鞘氨醇 代替了甘油。 與其他類二十烷酸不同的是凝血惡烷類有環(huán)醚的結(jié)構(gòu)。 大多數(shù)的類二十烷酸是花生四烯酸的衍生物。 亞油酸和亞麻酸必須從植物 中獲取。 不飽和脂肪酸有順式和反式兩種異物體。 第二章 脂類 Lipids 重點(diǎn)：磷脂、糖脂 一、 脂類的概念 不溶于水而能被乙醚、氯仿、苯等非極性有機(jī)溶劑抽提出的化合物，統(tǒng)稱脂類。但生物體內(nèi)大多數(shù)是順式結(jié)構(gòu)?；ㄉ南┧峥捎蓙営退嵩隗w內(nèi)合成。 花生四烯酸也稱 5,8,11,14二十碳四烯酸 (eicosatetraenoio acid)，是由亞油酸合成后加上一個二碳單位、引入兩個雙鍵。 ３ 凝血惡烷 A2(TxA2)是該類化合物中最重要的一種，它主要由血小板產(chǎn)生，促進(jìn)血小板凝聚和平滑肌收縮。 一、 甘油磷脂 天然存在的甘油磷脂都是 L— 構(gòu)型。 第四節(jié) 鞘脂類 鞘 脂類也是動植物生物膜的重要組分。 腦苷脂是單糖與神經(jīng)酰胺形成的糖脂，是非離子型的。 圖 人的神經(jīng)系統(tǒng)細(xì)胞膜至少有 15 種神經(jīng)節(jié)苷脂，它們的生物功能尚未完全了解。一些溶解體貯積病與鞘脂代謝有關(guān)，也稱鞘脂貯積病，常見的就是 Taysochs 神經(jīng)節(jié)苷 GM2貯積病，這是由于降解它的 ?hexosaminidaseA(?氨基己糖苷酶 )缺陷造成的。 （ 4） 高密度脂蛋白 (HDL， )，也是在肝臟中生成，可能負(fù)責(zé)清除細(xì)胞膜上過量的膽固醇。因此，毫不奇怪，高水平的血漿 LDL與冠狀動脈粥樣癥直接相關(guān) (LDL 含有大量的膽固醇及膽固醇脂 )，其它相關(guān)因素還包括高脂類飲食、吸煙、抑郁和缺少運(yùn)動，高水平的血漿 HDL 與代幾率的冠狀動脈病有關(guān)。包括：固醇、固醇衍生物。 c. 膽固醇是合成膽汁酸、類固醇激素、維生素 D 等生理活性物質(zhì)的前體。 分類 （ 4）、 按組成： 簡單蛋白：完全由氨基酸組成 結(jié)合蛋白：除蛋白外還有非蛋白成分（輔基） 詳細(xì)分類， P 75 表 31， 表 32。但有時也把含有一條肽鏈的蛋白質(zhì)不嚴(yán)謹(jǐn)?shù)胤Q為多肽。在酸、堿、蛋白酶的作用下，可以被水解成氨基酸單體。 近年發(fā)現(xiàn)谷胱甘肽過氧化物酶中存在硒代半胱氨酸，有證據(jù)表明此氨基酸由終止密碼 UGA編碼，可能是第 21 種蛋白質(zhì)氨基 酸。） １４ Gly 是唯一不含手性碳原子的氨基酸，因此不具旋光性。 （ 2）兩個 Cys 的巰基氧化生成二硫鍵，生成胱氨酸。 青霉胺的結(jié)構(gòu) （ 11）、 R 中含有酰胺基團(tuán)（ 2種 ） Asn、 Gln 圖 35 酰胺基中氨基易發(fā)生氨基轉(zhuǎn)移反應(yīng)，轉(zhuǎn)氨基反應(yīng)在生物合成和代謝中有重要意義 （ 12）、 R 中含有酸性基團(tuán)（ 2種） Asp、 Glu，一般稱酸性氨基酸 圖 36 Asp 側(cè)鏈羧基 pKa（β COOH）為 ， Glu 側(cè)鏈羧基 pKa（γ COOH）為 １５ 它們是在生理?xiàng)l件下帶有負(fù)電荷的僅有的兩個 氨基酸。在受體 — 底物、或分子相互識別過程中具有重要作用。 必須氨基酸在人體內(nèi)不能合成，是由于人體內(nèi)不能合 成這些氨基酸的碳架（α 酮酸） １６ 按照 R 基的極性性質(zhì) (能否與水形成氫鍵 )20 種基本 aa，可以分為 4 類： 側(cè)鏈極性 (疏水性程度 ) Gly 0 Ser Glu Lys Ala Asn Asp Arg Met Gln His Pro Thr Val Cys Leu Tyr Ile Phe Trp 非極性氨基酸 9 種，包括：甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、甲硫氨酸氨酸、脯氨酸，這類氨基酸的 R 基都是疏水性的，在維持蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)中起著重要作用。 Arg的胚基堿性很強(qiáng)，與 NaOH相當(dāng)。 （ 5） Tyr 的衍生物： 二碘酪氨酸、甲狀腺素 （甲狀腺蛋白中） （ 6）鎖鏈素由 4 個 Lys 組成（彈性蛋白中）。一個異構(gòu)體的溶液可使偏振光逆時針旋轉(zhuǎn)（記為（一））。 L胱氨酸和 D胱氨酸是外消旋物 圖 P86 L胱氨酸 D胱氨酸 內(nèi)消旋胱氨酸：（分子內(nèi)部互相抵消而無旋光性） 蛋白質(zhì)中 L 型氨基酸的比旋光度 P 87 蛋白質(zhì)中 L 型氨基酸的比旋光度。 三個現(xiàn)象： ①晶體溶點(diǎn)高→離子晶格，不是分子晶格。 滴定開始時，溶液中主要是 Gly+。 ]=pK2= Gly 的等電點(diǎn)： ][ ]][[1 ????Gly HGlyK ２０ 等電點(diǎn)時： [Gly]=[Gly+] 等 電點(diǎn)時氫離子濃度用 I 表示 I2=K1178。 和 Glu緩沖范圍 左右 P92 表 37，氨基酸的表觀解離常數(shù)和等電點(diǎn) ①從表中（ P92）可以看出，氨基酸的α 羧基 pKa 在 間，比典型羧基的 pKa（如乙酸pKa 為 ）要小很多，說明氨基酸羧基的酸性此普通羧基強(qiáng) 100 倍以上。 圖 N Gly— Ala— Ser— Leu— Phe C →→→→ DNS— Gly— Ala— Ser— Leu— Phe C 水解 DNS— Gly、 Ala、 Ser、 Leu、 Phe DNS氨基酸在紫外光激發(fā)后發(fā)黃色熒光。 圖 ③ Sanger 反應(yīng)（ 一二硝基氟苯， DNFP） 圖 二硝基苯基氨基酸（ DNP氨基酸），黃色，層析法鑒定，被 Sanger 用來測定多肽的 NH2末端氨基酸。 圖 此反應(yīng)使氨基酸的羧基活化，易與另一個氨基酸的氨基結(jié)合，在多肽的人工合成中常用。 結(jié)構(gòu)： P111 上 5 肽 主要重復(fù)單位： 側(cè)鏈Ｒ：由不同的氨基酸殘 基構(gòu)成 名稱：絲氨酰甘氨酰酪氨酰丙氨酰亮氨酸 寫法： Ｎ SerGlyTryAlaLeu 或ＳＧＹＡＬ，如果倒過來寫，則表示不同的肽，如Leu—AlaTyrGlySer。蛋白質(zhì)水解得到的各種短肽，只要不發(fā)生消旋作用，也具有旋光性。 21 213131 31 ２６ 問題 2： 把一個氨基酸結(jié)晶加入 的純水中，得到 的溶液，此氨基酸的 pI 值是大于 ？ 小 于 ? 還是等于 ？ （小于 ） 多肽的等電點(diǎn)，隨著肽鏈內(nèi)酸性氨基酸殘基數(shù)的增加而下降，隨著肽鏈內(nèi)堿性氨基酸殘基數(shù)的增加而上升。 活性肽是細(xì)胞內(nèi)部、細(xì)胞間、器官間信息溝通的主要化學(xué)信使。 一、 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)層 次 一級結(jié)構(gòu)（氨基酸順序、共價結(jié)構(gòu)、主鏈結(jié)構(gòu)） ↓ 是指蛋白質(zhì)分子中氨基酸殘基的排列順序 二級結(jié)構(gòu) ↓ 超二級結(jié)構(gòu) ↓ 構(gòu)象（高級結(jié)構(gòu)） 結(jié)構(gòu)域 ↓ 三級結(jié)構(gòu) (球狀結(jié)構(gòu) ) ↓ 四級結(jié)構(gòu) (多亞基聚集體 ) 一級結(jié)構(gòu)： 共價結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)分子中氨基酸殘基的排列順序 (含二硫鍵 ) 二級結(jié)構(gòu)： 多肽鏈主鏈中各個肽段形成的規(guī)則的或無規(guī)則的構(gòu)象。 RNase 單 條肽鏈 肌紅蛋白 單體蛋白 胰島素 ２８ 多條肽鏈 胰凝乳蛋白酶 蛋白質(zhì) 相同亞基 一種乳酸脫氫酶 α 4 寡聚蛋白 不同亞基 血紅蛋白 α 2β 2 蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu) (序列 )中含有形成高級結(jié)構(gòu)的全部需的信息，一級結(jié)構(gòu)決定高級結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)及功能。 （ 3） 測定多肽鏈的氨基酸組成。 間接法（測核酸序列推斷氨基酸序列） 核酸測序，一次可測 600800bp （三） 測序前的準(zhǔn)備工作 蛋白質(zhì)的純度鑒定 純度要求， 97%以上，且均一，純度鑒定方法。無色 PTH氨基酸，有機(jī)溶劑抽提，層析。 1971 固相測序儀 表面接有丙氨基的微孔玻璃球，可耦連肽段的Ｃ端。 （ 3）人血紅蛋白α和β鏈及肌紅蛋白的一級結(jié)構(gòu) P129 圖 340 （二） 同源蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的種屬差異與生物進(jìn)化 同源蛋白質(zhì)： 在不同的生物體內(nèi)具有同一功能的蛋白質(zhì)。 同源蛋白質(zhì)的特點(diǎn)： ①多肽鏈長度相同或相近 ②同源蛋白質(zhì)的 氨基酸順序中有許多位置的氨基酸對所有種屬來說都是相同的，稱不變殘基，不變殘基高度保守，是必需的。 （聚陽離子）四級銨鹽聚合物 液相： 5nmol 2040 肽 97% 氣相： 5pmol 60 肽 98% 肽段拼接成肽鏈 16 肽，Ｎ端 H Ｃ端Ｓ ３３ Ａ法裂解： ONS PS EOVE RLA HOWT Ｂ 法裂解： SEO WTON VERL APS HO 重疊法確定序列： HOWTONSEOVER LAPS （六） 二硫鍵、酰胺及其他修飾基團(tuán)的確定 二硫鍵的確定（雙向電泳法） 碘乙酰胺封閉 SH 胃蛋白酶酶解蛋白質(zhì) 第一向電泳 過甲酸氧化 — S— S— 生成 SO3H 第二向電泳 分離出含二硫鍵的兩條短肽，測序 與拼接出的肽鏈比較，定出二硫鍵的位置。 ANHNH2 、 BNHNH2 、 CNHNH2 、 DCOOH 氨基酸的酰肼，用苯甲醛沉淀， C 端在上清中， Gln、 Asn、 Cys、 Arg 不能用 此法。） 分子量： M 拆亞基： M1 、 M2 兩條帶 拆二硫鍵： M1 、 M2 兩條帶 110mw ３０ 分子量關(guān) 系： M = 2M1 + 2M2 測定氨基酸組成 主要是酸水解，同時輔以堿水解。 （ 5） 分析多肽鏈的 N 末端和 C 末端。 一級結(jié)構(gòu)要點(diǎn)： ⑴蛋白質(zhì)中的肽鍵都是由 αNH2和 αCOOH 結(jié)合生成的。 超二級結(jié)構(gòu)： 由兩個以上二級結(jié)構(gòu)單元相互聚集形成的有規(guī)則的二級結(jié)構(gòu)的組合體如 αα 、β α β、βββ。 谷胱甘肽 Glu— Cys— Gly 廣泛存在于動 、植、微生物細(xì)胞內(nèi)，在細(xì)胞內(nèi)參與氧化還原過程，清除內(nèi)源性過氧化物和自由基，維護(hù)蛋白質(zhì)活性中心的巰基處于還原狀態(tài)。可將肽鏈內(nèi)酸性殘基和堿性殘基進(jìn)行清點(diǎn)比較，推測等電點(diǎn)偏酸還是偏堿，然后用等電點(diǎn)聚焦電泳進(jìn)行實(shí)驗(yàn)測定。 在 pH0― 14 范圍內(nèi)，