【正文】 fel、Java、 Perl、 PHP、 Python、 Ruby 和 Tcl 等。這種模式統(tǒng)一了客戶端，將系統(tǒng)功 能實(shí)現(xiàn)的核心部分集中到服務(wù)器上，簡(jiǎn)化了系統(tǒng)的開發(fā)、維護(hù)和使用。對(duì)一個(gè)稍微大一點(diǎn)單位來(lái)說(shuō)，系統(tǒng)管理人員如果需要在幾百甚至上千部電腦之間來(lái)回奔跑，效率和工作量是可想而知的，但 B/S 架構(gòu)的軟件只需要管理服務(wù)器就行了，所有的客戶端只是瀏覽器，根本不需要做任何的維護(hù)。 (3).應(yīng)用服務(wù)器運(yùn)行數(shù)據(jù)負(fù)荷較重 由于 B/S 架構(gòu)管理軟件只安裝在服務(wù)器端（ Server）上，網(wǎng)絡(luò)管理人員只需要管理服務(wù)器就行了，用戶界面主要事務(wù)邏輯在服務(wù)器 （ Server）端完全通過 WWW 瀏覽器實(shí)現(xiàn)，極少部分事務(wù)邏輯在前端（ Browser）實(shí)現(xiàn)，所有的客戶端只有瀏覽器，網(wǎng)絡(luò)管理人員只需要做硬件維護(hù)。 ? .數(shù)據(jù)存儲(chǔ)層 :就是數(shù)據(jù)庫(kù)層，它提供業(yè)務(wù)邏輯層所需的所有 信息和數(shù)據(jù)。 按上述三方面進(jìn)行可行性分析、研究后，我認(rèn)為該項(xiàng)目是可行的 ， PHP 結(jié)合 MYSQL 數(shù)據(jù)庫(kù)，可以很快速高效完成項(xiàng)目的設(shè)計(jì)；系統(tǒng)的實(shí)現(xiàn)對(duì)于實(shí)際的學(xué)習(xí) 研究 和 管理也有很大的意義。系統(tǒng)根據(jù)用戶提交的服務(wù)請(qǐng)求，進(jìn)行相應(yīng)的的操作，最后提交任務(wù)結(jié)果到 WEB 界面顯示。以MySQL 作為后臺(tái)數(shù)據(jù)庫(kù)，以 Apache 為服務(wù)器，用 PHP 語(yǔ)言構(gòu)建的基因信息的數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)。注釋 39。關(guān)鍵字 39。, `SOURCE` VARCHAR( 50 ) NOT NULL COMMENT 39。, PRIMARY KEY ( `GENE_ID` ) ) ENGINE = MYISAM 。數(shù)據(jù)來(lái)源 39。 （ 2） .MySQL 表的建立如圖所示： 18 圖 PROTEIN 信息表 三．主要模塊設(shè)計(jì) 19 圖 登陸界面 管理 界面 在輸入正確的賬號(hào)、密碼后，系統(tǒng)便可以跳轉(zhuǎn)到管理界面。 //mysql 數(shù)據(jù)庫(kù)服務(wù)器 $mysql_username =root。NAME 39。SEQUNCE39。$KEYWORDS 39。$DEFINITION39。這是該系統(tǒng)的最基本的功能。GENE_ID39。REFERENCE 39。$NAME 39。$SEQUNCE39。 ? 23 （ 3） PROTEIN 信息錄入功能： 基因數(shù)據(jù)庫(kù)管理系統(tǒng)提供 蛋白質(zhì) 信息錄入功能， 用戶可以通過 WEB 界面將基因信息保存在后臺(tái)的 MySQL 數(shù)據(jù)庫(kù)中。protein39。SOURCE39。NULL39。$REFERENCE 39。 $result=mysql_query($sql)。使用時(shí)應(yīng)注意有些程序?qū)Υ笮懹忻鞔_要求。width:400px。bp39。?echo $c\r\n??echo $d?/textarea /label /p （ 5）基因信息查詢功能 基因數(shù)據(jù)庫(kù)管理系統(tǒng)提供 基因信息的查詢，可以對(duì)堿基序列的序列名稱、序列物種、序列的關(guān)鍵詞進(jìn)行檢索，得到用戶想要的數(shù)據(jù)信息 [11]。 。 $result=mysql_db_query($mysql_database,$sql1,$conn)。 } mysql_free_result($result)。 echo關(guān)鍵字 :$row[6]\n。 echo堿基序列 $row[5]\n。下面以插入 p53 基因信息為例進(jìn)行測(cè)試： （ 1）首先填寫 DNA 信息錄入界面，如下圖： 圖 DNA 錄入 填寫 31 （ 2）填寫完成后，點(diǎn)擊確定，提交信息，系統(tǒng)返回是否錄入成功的的提示。 但是該系統(tǒng)功能和設(shè)計(jì)還不夠完善，在使用過程中可能會(huì)出現(xiàn)一些錯(cuò)誤和缺陷，這就需要對(duì) 系統(tǒng)進(jìn)行及時(shí)的維護(hù)和改進(jìn)。通過這次畢業(yè)設(shè)計(jì)，我鞏固了很多專業(yè)知識(shí) ，也學(xué)到了很多新的知識(shí) 。 MYSQL WEB[M]. 南京：東南大學(xué)出版社， 2020. [7] Ashish Wilfred,Meeta Gupta. PHP professional projects[M]. USA:Premier Press,2020. [8] 陳亮 ,顧珉 ,陶怡 等 . 學(xué)習(xí)科學(xué)相關(guān)基因數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建 [J]. 生物醫(yī)學(xué)工程研究 .2020,23(2). [9] 侯津杰 ,郭靠山 ,喬欽增 等 . 設(shè)計(jì)與構(gòu)建動(dòng)脈粥樣硬化相關(guān)基因數(shù)據(jù)庫(kù) [J].中國(guó)組織工程研究與臨床康復(fù) .2020,12(26). [10] 曾順 . 精通 CSS+DIV 網(wǎng)頁(yè)樣式與布局 [M]. 北京：人民郵電出版社 ， 2020. [11] NoebelsJL. Exploring new gene discoveries in idiopathic generalized epilepsy[J]. Epilepsia,2020,44(2):1621. [12] Pruitt KD,Maglott DR. RefSeq,LocusLink. NCBIgene centereder sources[J]. NucleicAcidsRes,2020,29(1):137140. [13] Schulze KermerS. Ontologies for molecular biology[J]. Bioput,1998,3:693 704. [14] 李桂源 ,錢駿 . 基于 的生物信息學(xué)應(yīng)用指南 [M]. 湖南：中南大學(xué)出版社， 2020. 37 [15] Christopher Cosentino. Advanced PHP For Web Professionals[J]. Prentice Hall,2020,23(2):1214. 38 附 錄 一、英文原文： Argonaute— a database for gene regulation by mammalian microRNAs Priyanka Shahi1 ABSTRACT MicroRNAs (miRNAs) constitute a recently discovered class of small noncoding RNAs that regulate expression of target genes either by decreasing the stability of the target mRNA or by translational inhibition. They are involved in diverse processes, including cellular differentiation, proliferation and apoptosis. Recent evidence also suggests their importance for cancerogenesis. By far the most important model systems in cancer research are mammalian anisms. Thus, we decided to pile prehensive information on mammalian miRNAs, their origin and regulated target genes in an exhaustive,curated database called Argonaute ( Argonaute collects latest information from both literature and other databases. In contrast to current databases on miRNAs like miRBase::Sequences, NONCODE or RNAdb, Argonaute hosts additional information on the origin of an miRNA, . in which host gene it is encoded, its expression in different tissues and its known or proposed function, its potential target genes including Gene Ontology annotation, as well as miRNA families and proteins known to be involved in miRNA processing. Additionally, target genes are linked to an information retrieval system that provides prehensive information from sequence databases and a simultaneous search of MEDLINE with all synonyms of a given gene. The web interface allows the user to 39 get information for a single or multiple miRNAs, either selected or uploaded through a text file. Argonaute currently has information on 839 miRNAs from human, mouse and rat. INTRODUCTION MicroRNAs (miRNAs) are small (21–23 nt) noncoding RNAs that are important regulators of gene expression. They act by base pairing with partially plementary sites in the mRNA of their targets, and either inhibit translation into protein or decrease the stability of the transcript . The number of currently known miRNAs in mammalian systems has risen dramatically in the last year, and predictions about their total number in humans amount up to 1000. miRNAs are transcribed as long primary transcripts (primiRNAs), some of them being polycistronic, which are processed in the cell nucleus by an enzyme called Drosha, yielding precursor miRNAs (premiRNAs) that exhibit a characteristic stem–loop sequence. These are exported into the cytosol where mature miRNAs are generated by the RNase IIItype enzyme Dicer, producing a small doublestranded RNA from which one strand (called miRNA*) is quickly degraded, releasing the small singlestranded miRNA. Translational inhibition, which seems to be the major mode of action in animals, is performed by a riboprotein plex called RNAinduced silencing plex (RISC) consisting of the miRNA and proteins of the argonaute family miRNAs are involved in several cellular processes, including cellular differentiation, anism development and apo。 35 致 謝 光陰似箭，美好的時(shí)光總是過的飛快，轉(zhuǎn) 眼間最美好的大學(xué)生活即將結(jié)束。 此次畢業(yè)設(shè)計(jì) 以 MySQL 作為后臺(tái)數(shù)據(jù)庫(kù)，以 Apache 為服務(wù)器，用 PHP 語(yǔ)言構(gòu)建的基因信息的數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)。 圖 DNA 信息成功錄入數(shù)據(jù)庫(kù) 化 功能測(cè)試 基因數(shù)據(jù)庫(kù)管理 系統(tǒng)提供 序列轉(zhuǎn)化為 FASTA 格式，根據(jù)要求可以將輸入的序列 按如下格式輸出：序列 的第一行是由大于號(hào) 打頭 ，然后顯示該序列的長(zhǎng)度， 用于序列標(biāo)記。 } mysql_free_result($result)。 $result=mysql_db_query($mysql_database