蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)原理(1)(存儲版)
【正文】 β 折疊結(jié)構(gòu)是常見的二級結(jié)構(gòu)單元，又稱 β 折疊片 β 折疊片由多肽鏈 不連續(xù) 幾區(qū)域 /β 折疊股 構(gòu)成 β 折疊股由 510個殘基 （ φ /ψ ）在 Ramachandran圖左上 120/140大區(qū)域 形成 幾乎伸展 結(jié)構(gòu) β 折疊片 通過 C=O與 NH在成對的 β 折疊股間形成氫鍵 結(jié)構(gòu)沒有螺旋構(gòu)象緊密 β 折疊結(jié)構(gòu)中 主鏈各肽鍵平面伸展 平面間彼此折疊成片近似鋸齒狀片層排列 α 碳原子位于折疊片平面的交界棱邊上 形成了一個十分引人注目的的特征： 3個方向上相互垂直 (見下圖 ) 反平行 折疊片 按多肽鏈 NC方向排列，平行與反平行兩種構(gòu)象 平行 β 折疊片 各折疊股主鏈方向相同，一折疊股似鄰股平移 二面角 φ 、 ψ 約為 11 113 折疊股各肽平面（一塊折疊片） C=O與 NH分別 一左一右和相應(yīng)二鄰股成氫鍵 氫鍵的方向呈有規(guī)律的角度傾斜 反平行折疊片 相鄰股的主鏈走向相反 二面角 φ 、 ψ 約為 13 135 折疊股間氫鍵和成鍵基團(tuán)方向同一直線 屬能量上較為穩(wěn)定的類型 同一 β 折疊股中側(cè)鏈間隔地朝上與朝下 相鄰股卻是相同一起朝上或朝下 反平行折疊片 經(jīng)常一面埋藏在內(nèi)部另一面暴露在溶劑中， 氨基酸通常是親水性與疏水性交替出現(xiàn) 平行的折疊片 往往兩邊均處在內(nèi)部，中間的殘基往往 高度疏水，親水的殘基集中在兩頭 兩種 β 結(jié)構(gòu)，邊上的折疊股有可能比中間的更為親水些 蛋白質(zhì)中混合的折疊片也可存在，幾率不高。從 DNA→RNA→蛋白質(zhì)法則中，基因在 DNA 序列上被內(nèi)含子分隔成一段段的外顯子，許多蛋白質(zhì)分子中發(fā)現(xiàn)這些外顯子對應(yīng)的即蛋白質(zhì)分子中的結(jié)構(gòu)域部分 免疫球蛋白的 2個重鏈和 2個輕鏈，可區(qū)別為 12個結(jié)構(gòu)域；肌動蛋白分子的馬達(dá)結(jié)構(gòu)域；細(xì)胞色素 b5可分為血紅素結(jié)合部分與膜結(jié)合部分兩個結(jié)構(gòu)域等 三 .蛋白質(zhì)分子的三級結(jié)構(gòu) 三級結(jié)構(gòu) 即蛋白質(zhì)分子多肽鏈的 3維空間構(gòu)象 在 X線衍射分析中，從蛋白質(zhì)晶體的不對稱單元的二維電子密度截面的堆積，可得到三維的電子密度分布，這種由計算機(jī)輸出的三維電子密度分布，包含著蛋白質(zhì)分子的 3級結(jié)構(gòu)的全部內(nèi)容，并用能夠從一個側(cè)面強(qiáng)調(diào)構(gòu)象特征的一些圖形表示出來。 三級結(jié)構(gòu)亞單位彼此在 3維空間中相對位置關(guān)系各亞單位多肽鏈間存在共價鍵或非共價鍵的連接 幾個亞單位形成的四級結(jié)構(gòu)也同樣符合三級結(jié)構(gòu)組成規(guī)律基本要求 Crystallographic structure of cdb3 14Fig 22 Structure of cdb3 dimer細(xì)胞色素氧化酶Imaging By Atomic Force Microscope (AFM)CaATPase 耐熱性()鄰苯二酚雙加氧酶 。蛋白質(zhì)分子中某些特定的區(qū)域，在結(jié)構(gòu)與功能兩個方面有著特征性意義。 L型的定義 ：從 H 到 C? 看， 順時針依次為 C0， R， N 氨基酸的 構(gòu)象 黑色代表 C? 蛋白質(zhì)的多肽鏈?zhǔn)?20種氨基酸通過形成肽鍵而連接得到的 肽鍵或酰胺鍵平面上 6個原子 共平面 蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu) （ p
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