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db21t18612-20xx水產(chǎn)生物種質(zhì)檢驗(yàn)技術(shù)規(guī)程擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性法(存儲(chǔ)版)

  

【正文】 。應(yīng)保證DNA濃度在10μg/mL以上,方可正常進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。L)酶切緩沖液10X1XEcoRⅠ10U/181。l 接頭復(fù)性將EcoRⅠ和MseⅠ各自的單鏈接頭等分子數(shù)混合, 94℃變性3min,37℃保溫5min。表3  預(yù)擴(kuò)增反應(yīng)體系試劑體積(181。l)dNTPs (5mM)10X PCR緩沖液2Taq聚合酶 (5U/181。L。并用 UPGMA做基于Nei’s遺傳距離的樹(shù)形圖,以及用鄰近法(Neighbor joining method,NJ)構(gòu)建聚類圖(系統(tǒng)樹(shù)檢驗(yàn)置信度值為1000次)。TACTCAGGACTCAT5180。GATGAGTCCTGAGTAAXXX3180。GACTGCGTACCAATTCXXX3180。 GACGATGAGTCCTGAG3180。建立各個(gè)群體的01數(shù)據(jù)陣列。(5)產(chǎn)物變性 選擇性擴(kuò)增產(chǎn)物中添加等體積上樣緩沖液混勻,95℃變性5min,迅速置于冰上。L)EcoRⅠ選擇擴(kuò)增引物 (50ng/181。L)Acetylated BSA超純水總計(jì)預(yù)擴(kuò)增引物序列見(jiàn)附錄B。l——10181。L, 37℃保溫3h, 65℃保溫3h。 紫外吸收定量測(cè)試260nm波長(zhǎng)下測(cè)定產(chǎn)物(或產(chǎn)物稀釋液)的紫外吸收值,根據(jù)公式計(jì)算DNA濃度。 Ⅲ型樣品取鮮樣品50~150mg,剪成小塊放入研缽中,加入液氮,待樣品完全冷凍后,快速、用力研磨至粉末狀;將研缽放入65℃水浴至樣品粉末剛開(kāi)始融化,向研缽中加入DNA提取液(10mmol/L TrisHCl,pH ,75mmol/L NaCl,%SDS,5mmol/L EDTA)及RNA酶、蛋白酶K共400μL,用力碾磨30s。 Ⅱ型樣品從活體中直接采集肌肉或臟器組織, 20℃冰箱直接凍存。 Ⅱ型樣品:肌肉、臟器組織類(仿刺參、海膽、虹鱒、大菱鲆、鰻鱺、中國(guó)對(duì)蝦、日本對(duì)蝦、中華絨鰲蟹、三疣梭子蟹、皺紋盤鮑、海灣扇貝、蝦夷扇貝、櫛孔扇貝、文蛤、牡蠣、海蜇等)。 電泳槽。6  儀器和設(shè)備 凝膠成像分析系統(tǒng)。 37%甲醛溶液。 甲叉雙丙烯酰胺:分析純。 異戊醇:分析純。 遺傳距離(Genetic Distance,D)用基因頻率的函數(shù)表示的群體間遺傳差異,它的最適宜的測(cè)度是單位長(zhǎng)度DNA的核苷酸數(shù)或密碼子的差數(shù),是用來(lái)表示群體或個(gè)體之間遺傳關(guān)系遠(yuǎn)近的一個(gè)量化指標(biāo),其值可以從0至無(wú)限大。GB/T 養(yǎng)殖魚(yú)類種質(zhì)檢驗(yàn) 第15部分:RAPD分析3  術(shù)語(yǔ)和定義下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本標(biāo)準(zhǔn)。本標(biāo)準(zhǔn)歸口單位:遼寧省海洋與漁業(yè)廳。8 擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性法????? 擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性法1  范圍本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了水產(chǎn)生物擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析(AFLP)的原理、試劑、儀器和設(shè)備、采樣、分析步驟和數(shù)據(jù)運(yùn)算方法。 座位(Locus) 基因在染色體上所處的特定位置。 聚類分析(Cluster Analysis)
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