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畢業(yè)設計(論文)外文參考資料及譯文-豬細環(huán)病毒orf1全基因組的克隆與序列分析(存儲版)

2025-07-15 02:37上一頁面

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【正文】 豬基因組和基因組的比較可在文獻中。Learly 等, 1999。 量的多樣性 TTSuV2檢測 “ ( 15%)較低。 Niel 等, 2021)。 直方圖對 wised PI ()表示,在本研究中和 TTSuV2 之內(nèi)的核苷酸身分出版的 TTSuV1 高于 85%。在負選擇 /選擇性收縮率最高的密碼子報道了 ORF1基因( %和 %,圖 1),盡管病毒 ORF2 和 ORF3 一些地區(qū)也有選擇性的約束。 TI 的偏見,這是觀察核,線粒體和葉綠體 DNA 與原核生物,真核生物和病毒。 鈴木等人。 2021)。不同的非編碼區(qū),以及在其長度為 838844臺幣之間 TTSuV1株和 793797 新臺幣 TTSuV2 之間 的 2829%,占整個基因組。 ORF 外殼蛋白和復制相關蛋白通常在圓形單鏈 DNA 病毒 特點,比喻。 2021年 )比較完整的核苷酸序列和推導的氨基酸序列。 材料與方法 研究中使用的血清標本,從以前通過測試,聚合酶鏈反應積極的 9 豬 TTV 中獲得,獲得健康的育肥豬從 11日至 15 周齡。 Brassard等, 2021。尼爾等人, 2021年 。尼爾等人, 2021年)。(岡本等人, 2021年 。 Ellis et al., 2021。 多樣性 。noma 電話 23 + 34935814620 傳真 :+ 34935814490 Email: 運行標題 : 豬圓環(huán)病毒 1型 和 2 型 的發(fā)展史 13 株豬圓環(huán)病毒 1型( Torque teno sus1 TTSuV1)和 2型 ( Torque teno sus2 TTSuV2) 檢查得到 了 樣化和演化的豬 TTVs。這份手稿將進行審稿,排版,以及由此產(chǎn)生的證據(jù)審查 在其 出版之前 的 最后的形式。es, J., Kekarainen, T., Geic 以完整基因組為依據(jù)的豬圓環(huán)病毒 1 型( Torque teno sus1 TTSuV1)和 2型( Torque teno sus2 TTSuV2)的 遺傳變異和發(fā)展史 ,獸醫(yī)微生物學 (2021), doi:,未經(jīng)編輯的文稿PDF 文件 作為我們的客戶服務,我們提供這一手稿的早期版本。 通訊作者 通訊地址 Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA), Universitat Aut242。 關鍵詞: 豬圓環(huán)病毒 , Anellovirus,DNA 病毒,基因組 。 Brassard et al., 2021。 Biagini, 2021) 豬 TTV基因組大概 , 到今天為止,十段來自日本,巴西,加拿大,德國和美國的全長基因組都已經(jīng)被公布。 其中,導致豬的兩個基因小組定義為: TTV1和 TTV2(岡本等人,2021年 。72等, 2021。 Kekarainen等, 2021。基于這些原因,新 的豬 TTVs13 全長基因組,獲得來自西班牙和分析了 10 個已公布的基因組在一起。 TTV 的基因組的分子變異分析使用 MEGA4(田村等。通過與雞貧血病毒和豬 圓環(huán)病毒。與機管局的 221232 和 200203 為 TTSuV2 TTSuV1 機管局功能未知蛋白 ORF3編碼。盡管飽和度進行的測試(未顯示數(shù)據(jù))并沒有任何重大基因組區(qū)域(夏等人。具體來說,臺視非編碼區(qū)含有啟動子和轉(zhuǎn)錄增強子 表現(xiàn)出不同的活動測試(鐮田等細胞株的不同, 2021 年。斯特蘭德貝格和索爾特, 2021)。同樣,同義替代率比人類基因型 TTV 的非同義替換為高,領先的比率值大于 1(表 3)。 2021)。 根據(jù)在孤立之中被觀察的大基因距離,他們最初被考慮了作為 genogroups申請標準的 1和 2被用于分類人的 TTVs (等 Okamoto, 2021年 。 而且,考慮到分歧,一樣高象 30%在 TTSuV1 之內(nèi)和所有西班牙染色體的被分離的位置和美國相比,并且亞洲人一個在種系發(fā)生的樹,某一種類與一個潛在的地理依據(jù)的內(nèi)部結(jié)構(gòu)可能存在。 結(jié)論 如今, anelloviruses 完整的基因組進行了表征,并對一些動物物種提供(。黃等人, 2021 年),大大增加了對于豬 TTVs 知識。病毒 ORF2 和 ORF3 不太保守,盡管一些保守地區(qū)也報告。, ., Lamoureux, L., Inglis, ., Leblanc, D., Houde, A., 2021. Molecular detection of bovine and porcine Torque teno virus in plasma and feces. Vet. Microbiol. 126, 271276. Brassard, J., Gagne, ., Houde, A., Poitras, E., Ward, P., 311 2021. Development of a realtime TaqMan PCR assay for the detection of porcine and bovine Torque teno virus. J. Ap. Micro. 108, 21912198. Ellis, ., Allan, G., Krakowka, S., 2021. Effect of coinfection with genogroup 1 porcine torque teno virus on porcine circovirus type 2associated postweaning multisystemic wasting syndrome in gnotobiotic pigs. Am. J. Vet. Res. 69, 1608 1614. Gallei, A., Pesch, S., Esking, ., Keller, C., Ohlinger, ., 2021. Porcine Torque teno virus: Determination of viral genomic loads by genogroupspecific multiplexrtPCR, detection of frequent multiple infections with genogroups 1 or 2, and establishment of viral fulllength sequences. Vet. Microbiol. 143, 202212. GrauRoma, L., 2021. New insights into the epidemiology of postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS). Facultat de Veterin224。絕對數(shù)量和選擇(正或負)和反選(零)密碼子的百分比顯示???cè)藬?shù)的變異位點,為 第一,第二和第三密碼子位置和氨基酸替換(顯示百分比 括號)也給出。沿分行號碼代表的 NJ 進化算法的信心值 415(只值高于 90顯示)。s, J., 2021. Prevalence of swine Torque teno virus in postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS)affected and non PMWSaffected pigs in Spain. J. Gen. Virol. 87, 833837. Korber, B., 2021. HIV Signature and Sequence Variation Analysis. Computational Analysis of HIV Molecular Sequences, . Rodrigo, . Learn. (Eds.), Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, pp 5572. Krakowka, S., Ellis, ., 2021. Evaluation of the effects of porcine genogroup 1 torque teno virus in gnotobiotic swine. Am. J. Vet. Res. 6
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