【正文】 全長 TTSuV 本研究采用基因組， 起源登錄號，基因組 長度核苷酸和參考 表 2。zar, C., Segal233。, L., Beven, V., de Boiss233。該報告的轉(zhuǎn)換和顛換數(shù)沒有差異。）。然而，直到基因組的 TTSuV2 較多的情況下，在亞型的定義應(yīng)推遲。 根據(jù)當(dāng)前結(jié)果， TTSuV1 和應(yīng)該考慮 TTSuV2 作為證實分類的種類等提議由黃 (2021)和 ICT( 提出 ，所有 TTSuV1 西班牙染色體分別地成群了與美國和亞洲染色體，陳列身分更低比 80%與比較參考鍵入 1a和 1b。提出的子型 2b 和 2c 顯示了相似的 PI 價值如被觀察在之中 。臺視 ORF1 基因似 乎是由選擇凈化水平的影響比較強的 ORF2 和ORF3。在 DS/ dN 的比率 1 表示凈化選擇。這種差異往往是被稱為 TI的偏見。在非編碼區(qū)區(qū)域的低變性很可能是由于其重要性在復(fù)制和轉(zhuǎn)錄為圓形單鏈 DNA 病毒的其他鑒定（ Mankertz等。 TTSuV2 基因組分別與每個位置替換為 TTSuV1（ ）類似金額較低的變異位點的數(shù)量（ 670）。一半左右的位置在橫跨約 500nt和 400 TTSuV2 TTSuV1nt2021 年開始。早期的描述非編碼區(qū)和三個潛在碼被發(fā)現(xiàn)在所有 TTVs（圖 1，表 2）。序列，獲得了 DNA的使用 BigDye終結(jié)者走循環(huán)測序試劑盒 ABI棱 柱 3100遺傳分析儀（應(yīng)用生物系統(tǒng)公司）。s, 2021). 由于可用的豬 TTV 序列 數(shù)量少，并且受到地理來源的限制，這種病毒的多樣性和 發(fā)展史沒有得到充分的研究。等， 2021?；痰?， 2021。 2021）。 Huang et al., 2021).）。 Okamoto et al., 2021。 與此相反， TTSuV2表明變異較低水平（ 15％），并沒有什么不同類型的可描述。noma de Barcelona, 08193 Bellaterra, Barcelona, Spain. Retrovirus Centre and Virology Section, Department of Experimental Pathology,University of Pisa, . AbetoneBrennero 2, 56127 Pisa, de Sanitat i Anatomia Animals, Universitat Aut242。? Cortey, Lisa Macera, Joaquim Segal180。 以完整基因組為依據(jù)的豬圓 環(huán)病毒 1型（ Torque teno sus1 TTSuV1）和 2型（ Torque teno sus2 TTSuV2）的 遺傳變異和發(fā)展史 由 Mart237。對于 TTSuV1 核苷酸多樣性高于 TTSuV2，及其相互之間的碼突變方式也不同 。選擇 介紹 豬細環(huán)病毒（ TTV）是一種在 Anelloviridae 科中 分類連同 TTlike Mini Virus (TTMV), and TT Midi Virus(TTMDV)的 單股環(huán)狀 DNA 病毒。主機的物種病毒基因組的長度從 kb的（貓）至 kb的（人），取決于主機的物種。臂章等， 2021。 2021）。 Martelli等， 2021。 Gallei等， 2021。對 TTSuV1 和 TTSuV2 的全長基因組擴增與校對 DNA 聚合酶（ Taq 酶洛杉磯 TaKaRa 公司，寶生物公司，日本）的特異性引物使用位于非編碼區(qū)。變化的有選擇性的壓力的作用和存在沿 TTSuV染色體的二個方法估計 ： i)密謀非之間的數(shù)字的區(qū)別 synonymous 區(qū)別每個密碼子 (dS)和同義區(qū)別的數(shù)字每密碼子 (dN)被預(yù)言的 ORFs 的和 ii)計算 dS/dN 比率由 修改過的 NeiGojobori 方法 (Nei 和 Gojobori 1986)使用短冷期 (Korber 2021)可利用在 HIV 數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站 ( 估計與那些人的 TTV基因型比較。 ORF2 的，最短的預(yù)測基因，編碼 69 個氨基酸的 TTSuV2 和 7374 在 TTSuV1機管局。表 2 總結(jié)了 TTV 的基因變異之間。超過一半的核苷酸突變報 TTSuV1（ 740 1349時， ％），變量之間的對應(yīng) tothe 出版六本的基因組和基因組研究獲得的發(fā)現(xiàn)位置。 有關(guān)基因突變類型，顛換（ TV，嘌呤或嘧啶對嘌呤嘧啶）已超過轉(zhuǎn)換支配的（ Ti，嘌呤嘌呤或嘧啶到嘧啶）為 TTSuV1（ 972 TV and 858 TI，χ 21df， P值），而在 TTSuV2 案件的模式完全相反，德州儀器寡不敵眾電視顯著（ 373 TV和 435 TI,，χ 21df， P值 ）。 對于 TTSuV1， ORF1 包含了大多在第三密碼子的代替。 TTSuV1 和 TTSuV2之間的選擇模式，再次不同。 核苷酸身分之間的這些區(qū)別在 孤立之中在 NJ 樹 ()，明顯地分裂的 TTSuV1 和 TTSuV2 也被反射了入不同的等級。 根據(jù)被觀察的在七條 TTV 染色體之中的 identity 作者暫時地提出的類型 1a 和 1b 和子型 2a、豬的 TTSuV1 和TTSuV2 2b 和 2c，分別。 2021），所有從美國分離TTSuV2 和歐洲應(yīng)該被視為一個單一類型的亞型數(shù)可能為 2至 7取決于應(yīng)用的門檻。 Brassard 等， 2021。 TTSuV1 比 TTSuV2 更具有變化性。 利益沖突聲明本論文的作者都沒有與其他人或組織可能不適當(dāng)?shù)赜绊懟蚱姷恼撐膬?nèi)容的財務(wù)或個人關(guān)系。s, J., 2021. Torque teno virus infection in the pig and its potential role as a model of human infection. Vet. J. 180, 163168. Kekarainen, T., Sibila, M., Segal233。 圖 3 鄰 joining 進化樹的基礎(chǔ)上， TTSuV 百分比的身份，在基因銀行中的基因組可從這項研究。 表 3。 圖 2成對的核苷酸序列比較序列分布在 23個 TTSuV 基因組： 1，觀察內(nèi) TTSuV1和 TTSuV2 差異 。ria de la UAB, 157 pp. PhD dissertation. Hall, ., 1999. BioEdit: a userfriendly biological sequence alignment editor andanalysis program for Windows 95/98/NT. Nuc. Ac. Symp. Ser. 41, 9598. Huang, ., Ni, ., Dryman, ., Meng, ., 2021. Multiple infection of porcine Torque teno virus in a single pig and characterization of the fulllength genomicsequences of four . prototype PTTV strains: Implication for genotyping of PTTV. Virol. 396, 289– 297. Jelcic, I., HotzWagenblatt, A., Hunziker, A., zur Hausen, H., de Villiers, ., 2021. Isolation of Multiple TT Virus Genotypes from Spleen Biopsy Tissue from a Hodgkin’s Disease Patient: Genome Reanization and Diversity in the Hypervariable Region. J. Virol. 78, 7498– 7507. Kakkola, L., Hedman, J., Qiu, J. amp。系統(tǒng)發(fā)育重建表明， TTSuV1 是分為三種類型，其中一人報告了這項工作的第一時間，地理結(jié)構(gòu)的某種可能存在的。在目前的研究已特點 TTV 的