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分子標記在植物遺傳育種中的應(yīng)用-預(yù)覽頁

2025-02-10 20:09 上一頁面

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【正文】 Gdenature 95? C539。GCTCGC AGTACTTCATGACGAGCGTCATGAGCTCGCanneal primers 60? CTaq polymerase binds 3’ and extendsGCTCGC539。AGTACTTCATGACGAGCGTCATGAGCTCGCDNA is doubled with each cycleRepeat 2540 timesRAPD的操作PCR反應(yīng):l10Buffer 2分鐘Step230秒Step446循環(huán)Step6DAF(DNA amplification fingerprinting):與 RAPD不同的是 :引物濃度更高,引物長度更短(一般 5- 8個堿基),且往往用聚丙烯酰胺凝膠電泳,通常會產(chǎn)生非常復(fù)雜的帶型,譜帶信息比 RAPDs大得多。SCARs( Sequenced Characterized Amplified Regions)n 為提高 RAPD標記穩(wěn)定性,把目標 RAPD片段克隆測序,根據(jù)片段兩末端的序列設(shè)計特定引物(通常 24個堿基),再進行 PCR擴增,可把相應(yīng)的單一位點鑒定出來。l根據(jù)核心序列堿基數(shù)的不同 ,可分為單堿基、 2堿基、 3堿基、 4堿基等多種重復(fù)型。SSR的分布特點SSR的功能長期以來一直認為 SSR是轉(zhuǎn)錄啞區(qū),沒有明確的生理功能。 染色體末端的 SSR,有保護 DNA完整性、避免降解、融合及丟失的功能;216。v 不同材料重復(fù)次數(shù)的不同 , 導(dǎo)致了SSR長度的高度變異性。l) 4181。95℃ 95℃ 56℃ 72℃ GOTO31循環(huán)注: SSR引物退火溫度在 5265不足:SSR的檢測u瓊脂糖凝膠檢測(同前)u聚丙烯酰胺凝膠檢測u一般采用銀染、熒光檢測。 GACTGCGTACCAATTC339。GATGAGTCCTGAGTAANNN3‘EcoRIprimers +3: 539。( 3) AFLP分析由于擴增片段較短( 30700bp), 分辨率高。( 5)由于特定引物擴增,退火溫度高,因而假陽性低,可靠性高。酶切 連接;2.AFLP操作步驟:模板 DNA的酶切與連接DNA( 200ng/181。l) pmol/181。 100BSA l) l, 37℃ 酶切 連接 46小時,或過夜 。MseⅠ l) l 混合后,在如下 PCR條件下擴增:Step2 95℃ 30秒Step4 72℃ 60秒Step2l如下反應(yīng)液:PstⅠ 引物( 50ng/181。MseⅠ 引物( 50ng/181。Buffer 混合后按如下 PCR程序擴增:Step4 72℃ 60秒Step7 56℃ 30秒Step6 同位素檢測注意事項 :1. AFLP酶切反應(yīng)對模板 DNA質(zhì)量要求較高,要求 260/2804. AFLP反應(yīng)對 PCR要求較高,要首先摸索優(yōu)化 Mg2+、 dNTP條件,達到最佳擴增。7coefficient) a a + b + cJaccardNei:a bc d+ 聚類分析n 聚類指標:遺傳距離n 聚類方法: SAHNn mRNA反轉(zhuǎn)錄成 cDNA, 克隆到質(zhì)?;蚴删w載體,構(gòu)建 cDNA文庫,而后大規(guī)模隨機挑選克隆,對 5’或 3’端進行一步法測序,獲得對生長發(fā)育、遺傳變異、衰老死亡等過程認識的技術(shù)。n SNPs可大大豐富既有的連鎖圖n 成熟自動化技術(shù),有望分析成千上萬的 SNPsn 蛋白質(zhì)組研究 了解生物體蛋白質(zhì)表達的時空分布規(guī)律 , 不同個體 /組織間的表達差異n 蛋白質(zhì)分子標記 定位生物的表性變異(如抗病、抗逆等性狀 )和相關(guān)基因The key technique involves in proteomicselectrophoresisn 分子標記技術(shù)的發(fā)展,使圖譜上標記的密度越來越高。as(%)“mapmapAFLP不僅能縮小抗病基因與連鎖標記之間的距離,而且在 RFLP遺傳圖上,可增加染色體末端標記和填充 RFLP空隙,不干擾 RFLP標記簇,從而大大增加了遺傳圖的飽和度。n eg. 通過 288個位點上對 338個一粒小麥系群 AFLP指紋分析,結(jié)合種系分析,發(fā)現(xiàn)來源于土耳其 東南部 Karacadag山脈的一個野生一粒小麥( T. boeoticum) 群體與栽培一粒小麥( T. monococcum ) 遺傳上最為相近,從而推斷該地區(qū)為現(xiàn)代栽培一粒小麥的發(fā)源地( 用途:鑒定品種真實性和純度,用于新品種登記和品種知識產(chǎn)權(quán)保護等。利用 NILs方法已定位了許多質(zhì)量性狀基因, eg.番茄抗病毒基因 Tm2a, 番茄抗細菌病毒基因及水稻半矮桿基因 Sdy等。n 定位基因:萵苣抗霜霉病基因 、 水稻抗癭蠓基因水稻抗稻瘟病基因、水稻耐黃叢卷葉病毒病基因等分離群體分組分析法 (Bulked Segregation Analysis)產(chǎn)量、品質(zhì)、熟期等大多數(shù)重要農(nóng)藝性狀,均表現(xiàn)數(shù)量性狀的遺傳特點,受許多數(shù)量基因座位 (Quantitative數(shù)量遺傳學(xué)無法確定控制 數(shù)量性狀的 QTLs數(shù)目,也無法確定單個 QTL的遺傳效應(yīng)及染色體位置。 ? 前者以欲克隆基因的功能為基礎(chǔ),通過鑒定其產(chǎn)物或某種表型的突變進行;? 后者則著眼于基因本身,通過其特定的序列或其在基因組中的特定位置進行。 新發(fā)現(xiàn): 不同物種之間在標記探針的同源性、拷貝數(shù)及連鎖順序上都具有很大程度的保守性。應(yīng)用比較基因組學(xué)進行基因的克隆n 綠色革命 Rht Rht2基因的克隆擬南芥 GAI 水稻 EST 篩選小麥 BAC文庫 Rht Rht2Blast探針標記深遠意義n 比較基因組研究已使得傳統(tǒng)的植物遺傳學(xué)突破了物種的框架限定,發(fā)展成了新的系統(tǒng)遺傳學(xué)。n 利用 cDNAAFLP的方法,闡明了馬鈴薯塊莖在不同發(fā)育階段基因表達的情況,并克隆了 2個與塊莖脂肪氧合酶高度同源的 cDNA片段( Bachem等1996) 。n 對遺傳差異與雜種優(yōu)勢關(guān)系的評價方法經(jīng)歷了從形態(tài)性狀遺傳距離,到生化標記遺傳差異,親緣系數(shù),以及分子標記遺傳差異等各種嘗試。? 提出了 “ 上位性是雜種優(yōu)勢的主要遺傳基礎(chǔ) ” 的重要觀點。l 通過對與雜種優(yōu)勢相關(guān) QTLs效應(yīng)的研究,可以加深對雜種優(yōu)勢機理的了解。n 長期以來,選擇都是基于植株的表型性狀進行的。n ,采用 MAS可直接在當代確定。n 賈繼增等( 2023)根據(jù) AFLP標記進行小麥白粉病抗性的回交選擇,對小麥的外源染色質(zhì)及基因可以進行準確的跟蹤鑒定,從而加速種質(zhì)創(chuàng)新的進程。但研究表明,即使回交 20代,還能發(fā)現(xiàn)相當大與目標基因連鎖的供體染色體片段?;蚓酆贤黄屏嘶亟挥N改良個別性狀的局限 ,使品種在多個性狀上同時得到改良。4)在對 QTL進行轉(zhuǎn)移時 ,如果沒有轉(zhuǎn)移互作 QTL,則不會達到預(yù)期的結(jié)果。n ......成功的報道n 靜夜四無鄰,荒居舊業(yè)貧。 16:37:4616:37:4616:37Thursday, March 11, 2023n 1乍見翻疑夢,相悲各問年。 三月 214:37 下午 三月 2116:37March 11, 2023n 1行動出成果,工作出財富。 16:37:4616:37:4616:373/11/2023 4:37:46 PMn 1成功就是日復(fù)一日那一點點小小努力的積累。 11 三月 20234:37:46 下午 16:37:46三月 21n 1楚塞三湘接,荊門九派通。 4:37:46 下午 4:37 下午 16:37:46三月 21n 楊柳散和風(fēng),青山澹吾慮。 16:37:4616:37:4616:37Thursday, March 11, 2023n 1知人者智,自知者明。 三月 214:37 下午 三月 2116:37March 11, 2023n 1業(yè)余生活要有意義,不
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