酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)-多底物動(dòng)力學(xué)-全文預(yù)覽
【正文】 次作圖法同樣求取各動(dòng)力學(xué)常數(shù)。 (三 ) 乒乓雙雙機(jī)制： 1 速度方程 : 乒乓機(jī)制的 KingAltman環(huán)形表達(dá)式為： E k1[A] (EA≒ FP) k1 k4 k4[Q] k2 k2[P] (EQ≒ FB) k3 F k3[B] ? m=4 n=4，每種酶都有 4種 3線圖。 E + A k1 EA k2 EP k3 E + P k1 k2 此反應(yīng)若沒有 k3 線，則某些 KingAltman 圖形不存在，反應(yīng)速度中凡是含 k3 項(xiàng) 者不存在。 m=封閉環(huán)的線數(shù) ? n=3。 [EA] ∝ К EA。環(huán)的角數(shù)就是酶存在形式數(shù)目，用 n表示。谷草轉(zhuǎn)氨酶屬于典型的乒乓機(jī)制： Asp OAA AKG Glu E?CHO (E?CHO?Asp E?NH2 (E?NH2?AKG E?CHO ≒ E?NH2?OAA) ≒ E?CHO?Glu) ?總結(jié)： 有序機(jī)制 序列反應(yīng)機(jī)制 TC 機(jī)制 隨機(jī)機(jī)制 乒乓反應(yīng)機(jī)制 二 KingAltman法 ——速度方程圖示法 (一 )Kappa表示法 : E + A k1 EA 1 k1 2 Vf= k1 [A] [E] 。 例如：馬肝醇脫氫酶： NAD+ 乙醇 乙醛 NADH E ENAD+ E NADH E (3)隨機(jī)雙雙 (random Bi Bi)： A B P Q EA EQ E （ EAB≒ EPQ） E B A Q P ? 產(chǎn)物從酶上的釋放及底物和酶的結(jié)合無一定順序。 ? 根據(jù)底物及產(chǎn)物與酶的結(jié)合及釋放是否有序分為 : (1) 有序雙雙雙底物雙產(chǎn)物反應(yīng) (ordered Bi Bi) ： A B P Q E EA (EAB≒ EPQ) EQ E ? EA、 EQ : 非中心復(fù)合物； (EAB ≒ EPQ) : 中心復(fù)合物 ? A：領(lǐng)先底物； B：隨后底物 例如：許多以 NAD+或 NADP+為輔酶的脫氫酶類， 乳酸脫氫酶（ LDH)、蘋果酸脫氫酶 (MDH)等 NAD+ 蘋果酸 (MA) 草酰乙酸 (OAA) NADH MA OAA E ENAD+ (ENAD+≒ E NADH) E NADH E ? NAD+ / NADH 形成 外底物對(duì) ? 機(jī)制：由于底物 A與酶結(jié)合后改變了酶的構(gòu)象，使 原來隱蔽的 B結(jié)合位點(diǎn)暴露， B才能結(jié)合上去。例如：某些 Ser蛋白酶在催化過程中形成的酰化酶中間物 包括：共價(jià)結(jié)合的 ES中間物；自由酶 (2) 過渡態(tài)復(fù)合物 ： 非穩(wěn)定的酶中間物，本身可以單分子解離或異構(gòu)化之后再解離出產(chǎn)物或底物。 第二節(jié) 多底物反應(yīng)及其動(dòng)力學(xué) 一 反應(yīng)機(jī)制的分類： (一 ) Cleland表示法的基本符號(hào)和概念： ? 底物：依照底物與酶結(jié)合的順序依次用 A、 B、 C、 D表示 ? 產(chǎn)物：根據(jù)產(chǎn)物從酶上脫落的順序用 P、 Q、 R、 S 表示 ? 游離酶： E、 F、 G ? 抑制常數(shù)： KiA 、 KiB 。可以發(fā)生雙分子反應(yīng)而不能自身解離。對(duì)于雙底物雙產(chǎn)物反應(yīng)，必有酶 底物三元復(fù)合物形成?？煽醋魇侨獜?fù)合物濃度極低
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