酶促反應(yīng)動力學(xué)-多底物動力學(xué)(已修改)
2025-06-07 22:00 本頁面
【正文】 第二節(jié) 多底物反應(yīng)及其動力學(xué) 一 反應(yīng)機(jī)制的分類： (一 ) Cleland表示法的基本符號和概念： ? 底物：依照底物與酶結(jié)合的順序依次用 A、 B、 C、 D表示 ? 產(chǎn)物：根據(jù)產(chǎn)物從酶上脫落的順序用 P、 Q、 R、 S 表示 ? 游離酶： E、 F、 G ? 抑制常數(shù)： KiA 、 KiB 。 KiP 、 KiQ ? 米氏常數(shù)： KmA、 KmB。 KmP 、 KmQ ? 抑制劑： I ? 修飾劑： X或 Y ? 反應(yīng)分子數(shù) : Uni(單 ) 、 Bi(雙 )、 Ter(三 ) 、 Quad(四 ) ? 酶反應(yīng)中間物：分為兩類 (1) 穩(wěn)態(tài)中間物 ： 指酶和底物以共價鍵結(jié)合形成的較為穩(wěn)定的中間物。可以發(fā)生雙分子反應(yīng)而不能自身解離。例如：某些 Ser蛋白酶在催化過程中形成的?；钢虚g物 包括：共價結(jié)合的 ES中間物；自由酶 (2) 過渡態(tài)復(fù)合物 ： 非穩(wěn)定的酶中間物，本身可以單分子解離或異構(gòu)化之后再解離出產(chǎn)物或底物。 分為 : 非中心復(fù)合物：酶未完全被底物飽和 中心復(fù)合物： 酶已經(jīng)完全被底物飽和， (EAB EPQ)。 (EA EP) (二 ) 反應(yīng)機(jī)制的分類和命名 (以雙底物雙產(chǎn)物反應(yīng)為例）： 1. 序列 (sequential)反應(yīng)機(jī)制 : 酶必需與所有底物都結(jié)合之后才有產(chǎn)物放出。對于雙底物雙產(chǎn)物反應(yīng)，必有酶 底物三元復(fù)合物形成。 ? 根據(jù)底物及產(chǎn)物與酶的結(jié)合及釋放是否有序分為 : (1) 有序雙雙雙底物雙產(chǎn)物反應(yīng) (ordered Bi Bi) ： A B P Q E EA (EAB≒ EPQ) EQ E ? EA、 EQ : 非中心復(fù)合物； (EAB ≒ EPQ) : 中心復(fù)合物 ? A：領(lǐng)先底物； B：隨后底物 例如：許多以 NAD+或 NADP+為輔酶的脫氫酶類， 乳酸脫氫酶（ LDH)、蘋果酸脫氫酶 (MDH)等 NAD+ 蘋果酸 (MA) 草酰乙酸 (OAA) NADH MA OAA E ENAD+ (ENAD+≒ E NADH) E NADH E ? NAD+ / NADH 形成 外底物對 ? 機(jī)制：由于底物 A與酶結(jié)合后改變了酶的構(gòu)象，使 原來隱蔽的 B結(jié)合位點(diǎn)暴露， B才能結(jié)合上去。 暗示： A與 B可能結(jié)合在酶的不同部位。 (2) Theorell Chance (TC 機(jī)制 )： A B P Q E EA EQ E 第二個底物 B結(jié)合及釋放非?？?，沒有明顯的三元復(fù)合物變構(gòu)過程?？煽醋魇侨獜?fù)合物濃度極低的序列有序機(jī)制。 例如：馬肝醇脫氫酶： NAD+ 乙醇 乙醛 NADH E ENAD+ E NADH E (3)隨機(jī)雙雙 (random Bi Bi)： A B P Q EA EQ E （ EAB≒ EPQ） E B A Q P ? 產(chǎn)物從酶上的釋放及底物和酶的結(jié)合無一定順序。 ? 少數(shù)脫氫酶和一些磷酸激酶屬于該類，例如肌酸激酶 : 肌酸 + ATP ? 磷酸肌酸 + ADP ? 機(jī)制：酶蛋白上的 A、 B結(jié)合位均處于暴露狀態(tài)， 兩者與底物的結(jié)合即互不干擾，也不互相依賴。 EB EP 2 乒乓機(jī)制 (PingPang Bi Bi)： 各種底物全部和酶結(jié)合以前 ，已經(jīng)有一種或多種底物放出，不形成三元復(fù)合物。 A P B Q E (EA≒ FP) F (FB≒ EQ) E ? 屬于該機(jī)制的酶大多數(shù)具有輔酶，如轉(zhuǎn)氨酶、黃素酶等。谷草轉(zhuǎn)氨酶屬于典型的乒乓機(jī)制： Asp OAA AKG Glu E?CHO (E?CHO?Asp E?NH2 (E?NH2?AKG E?CHO
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