基因組研究鳥獸學會華大基因樊偉-全文預覽
【正文】 BGI current sequencing capacity （硬件 資 源） Data production: ? 100 Gb / day (2022) ? ~5 Tb / day (end of 2022) BGI superputing （硬件資源） CPUS Flops RAM Storage 1,500 18T 4TB 2PB 3,000 50T 10TB 5PB 5,000 100T 20TB 10PB 50,000 1,000T (1P) 200TB 1,000PB (1EB) 20222022 華大近年來主要科學成果 BGI Premier Scientific Partner 高通量測序平臺 基因分型平臺 生物信息分析中心 云計算平臺 （基因組數(shù)據(jù)庫） 經驗豐富的基因組研究團隊 Outline ? 基因組研究與測序技術發(fā)展回顧 ? 華大基因 (BGI)介紹 ? De novo測序與物種研究 ? Resequencing與群體研究 ? 性狀基因定位與分子育種 ? 轉錄組、甲基化測序與基因調控研究 ? Meta測序于共生微生物研究 17 Cucumber genome. Nature Geics 2022 Short read assembly: de bruijn graph algorithm 2022. Sequencing depth 60X, pure Solexa. Contig N50 40 kb, Scaffold N50 Mb. 2022. Sequencing depth: 4X Sanger, 50X solexa. Contig N50 kb, Scaffold N50 Mb. 千種動植物基因組計劃 兩年之內，計劃完成上千種 重要動植物的基因組 denovo測序 和核心種質資源的重測序。基因組研究 樊 偉， Fan Wei Tel: 13510143870 September 27, 2022 Outline ? 基因組研究與測序技術發(fā)展回顧 ? 華大基因 (BGI)介紹 ? De novo測序與物種研究 ? Resequencing與群體研究 ? 性狀基因定位與分子育種 ? 轉錄組、甲基化測序與基因調控研究 ? Meta測序于共生微生物研究 2 二十世紀孕育了“基因世紀” Genomic Era 人類基因組計劃奠定了 —“基因組時代”的基石 “基因組時代” “人類基因組計劃” 基因組學發(fā)展的源動力：測序技術 三代測序技術比較 測序技術 測序原理 代表測序儀器 上市時間 Read讀長 (bp) 測序速度及成本（人基因組） 第一代 Sanger測序法：PCR+電泳 AB 3730 1981年 500 花
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