《功能基因組學》ppt課件-全文預覽
【正文】 苷酸序列的 DNA片段（序列標簽位點）為路標，以堿基對作為基本測量單位（圖距）的基因組圖。功能基因組學 20世紀人類科技史上的三大創(chuàng)舉 40年代第一顆原子彈爆炸 60年代人類首次登上月球 90年代人類基因組計劃 基因組 (genome) 泛指一個有生命體 、 病毒或細胞器的全部遺傳物質；在真核生物 ， 基因組是指一套染色體 （ 單倍體 ） DNA。 ?HGP的內容就是制作高分辨率的人類遺傳圖和物理圖 ， 最終完成人類和其它重要模式生物全部基因組 DNA序列測定 ， 因此 HGP屬于結構基因組學范疇 。 ? 序列圖分析（ sequence map） 測定由 30億個核苷酸組成的全部序列。主要是開展功能基因組學和蛋白質組學的研究。 ? 功能基因組學的目的 ? 基因功能發(fā)現(xiàn) ? 基因表達分析及突變檢測 ? 從基因組整體水平上對基因的活動規(guī)律進行闡述 。 中英聯(lián)合實驗室 DNA（分子）標記 ? 限制性片段長度多態(tài)性 （ restriction fragment length polymorphisms,RFLP） ? 簡單序列長度多態(tài)性 （ simple sequenece length polymorphisrns,SSLPs) ? 小衛(wèi)星序列：（ Minisatellite DNA） ? 微衛(wèi)星序列：（ Microsatellite DNA, MS） ? 單核苷酸多態(tài)性標記 （ single nucleotide polymorphisms,SNP） SNPs與表型 ? 編碼區(qū)內的 SNPs可能改變氨基酸殘基的種類，這可以直接影響蛋白質的功能； ? 外顯子和內含子相連部位的 SNPs可能改變外顯子一內含子的剪接，影響蛋白質的修飾； ? 在調控區(qū)域內的 SNPs可以改變 mRNA的表達水平和穩(wěn)定性。 EST的應用 ? 構建遺傳學圖譜 遺傳圖譜、物理圖譜和轉錄圖譜 ,是基因組計劃要獲得的 3張遺傳學圖譜。由于在構建 cDNA文庫時要盡可能的選用全長 cDNA,所以一旦發(fā)現(xiàn)有價值的 EST,可以找到對應的克隆 ,獲得的全長 cDNA可以直接用于轉基因等研究。 EST的應用 ? 基因的定位克隆 以 EST為重要來源的染色體物理圖譜進一步方便了對抗病基因的連續(xù)分析 ,可將抗病基因定位在染色體中的狹小區(qū)段 ,縮小抗病基因的篩選范圍。 EST的應用 ? 用于制備 cDNA芯片 芯片技術 ,是目前高通量篩選 EST的有效方法。 1. 將 5μg含有 oligo dT（引物）的磁珠與RNA混合。 5. 用 Mme I切割每一個樣品形成約 60bp的標簽。 9. 連接片斷形成串聯(lián)體。 基因芯片基本操作流程 ? 制備總 RNA mRNA經(jīng) RTPCR用 Cy3（正常對照組）和Cy5（實驗組）熒光標記目的基因，得到
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