《功能基因組學(xué)》ppt課件-全文預(yù)覽
【正文】 苷酸序列的 DNA片段（序列標(biāo)簽位點(diǎn)）為路標(biāo)，以堿基對(duì)作為基本測(cè)量單位（圖距）的基因組圖。功能基因組學(xué) 20世紀(jì)人類(lèi)科技史上的三大創(chuàng)舉 40年代第一顆原子彈爆炸 60年代人類(lèi)首次登上月球 90年代人類(lèi)基因組計(jì)劃 基因組 (genome) 泛指一個(gè)有生命體 、 病毒或細(xì)胞器的全部遺傳物質(zhì)；在真核生物 ， 基因組是指一套染色體 （ 單倍體 ） DNA。 ?HGP的內(nèi)容就是制作高分辨率的人類(lèi)遺傳圖和物理圖 ， 最終完成人類(lèi)和其它重要模式生物全部基因組 DNA序列測(cè)定 ， 因此 HGP屬于結(jié)構(gòu)基因組學(xué)范疇 。 ? 序列圖分析（ sequence map） 測(cè)定由 30億個(gè)核苷酸組成的全部序列。主要是開(kāi)展功能基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究。 ? 功能基因組學(xué)的目的 ? 基因功能發(fā)現(xiàn) ? 基因表達(dá)分析及突變檢測(cè) ? 從基因組整體水平上對(duì)基因的活動(dòng)規(guī)律進(jìn)行闡述 。 中英聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室 DNA（分子）標(biāo)記 ? 限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性 （ restriction fragment length polymorphisms,RFLP） ? 簡(jiǎn)單序列長(zhǎng)度多態(tài)性 （ simple sequenece length polymorphisrns,SSLPs) ? 小衛(wèi)星序列：（ Minisatellite DNA） ? 微衛(wèi)星序列：（ Microsatellite DNA, MS） ? 單核苷酸多態(tài)性標(biāo)記 （ single nucleotide polymorphisms,SNP） SNPs與表型 ? 編碼區(qū)內(nèi)的 SNPs可能改變氨基酸殘基的種類(lèi)，這可以直接影響蛋白質(zhì)的功能； ? 外顯子和內(nèi)含子相連部位的 SNPs可能改變外顯子一內(nèi)含子的剪接，影響蛋白質(zhì)的修飾； ? 在調(diào)控區(qū)域內(nèi)的 SNPs可以改變 mRNA的表達(dá)水平和穩(wěn)定性。 EST的應(yīng)用 ? 構(gòu)建遺傳學(xué)圖譜 遺傳圖譜、物理圖譜和轉(zhuǎn)錄圖譜 ,是基因組計(jì)劃要獲得的 3張遺傳學(xué)圖譜。由于在構(gòu)建 cDNA文庫(kù)時(shí)要盡可能的選用全長(zhǎng) cDNA,所以一旦發(fā)現(xiàn)有價(jià)值的 EST,可以找到對(duì)應(yīng)的克隆 ,獲得的全長(zhǎng) cDNA可以直接用于轉(zhuǎn)基因等研究。 EST的應(yīng)用 ? 基因的定位克隆 以 EST為重要來(lái)源的染色體物理圖譜進(jìn)一步方便了對(duì)抗病基因的連續(xù)分析 ,可將抗病基因定位在染色體中的狹小區(qū)段 ,縮小抗病基因的篩選范圍。 EST的應(yīng)用 ? 用于制備 cDNA芯片 芯片技術(shù) ,是目前高通量篩選 EST的有效方法。 1. 將 5μg含有 oligo dT（引物）的磁珠與RNA混合。 5. 用 Mme I切割每一個(gè)樣品形成約 60bp的標(biāo)簽。 9. 連接片斷形成串聯(lián)體。 基因芯片基本操作流程 ? 制備總 RNA mRNA經(jīng) RTPCR用 Cy3（正常對(duì)照組）和Cy5（實(shí)驗(yàn)組）熒光標(biāo)記目的基因，得到
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