外文翻譯-基因組計(jì)劃在決定基因功能中的角色：來自模式生物的洞察（譯文）-生物工程-全文預(yù)覽
【正文】 應(yīng) (Fischer,1993。這是非常明顯的，老鼠和人類之間的比較將是的確定哺乳基因的控制區(qū)域的首選方法 (Ravetch et al.,1980)，為人類和老鼠基因組位于同一染色體測(cè)序提出了論據(jù)。例如，果蠅和黑果蠅的啟動(dòng)子區(qū)域的四個(gè)視紫紅質(zhì)基因的 DNA 序列比較，顯示了核心序列的可交換保守序列，這個(gè)序列有一個(gè)額外的下游序列授予環(huán)細(xì)胞類型特異性。此外，研究發(fā)現(xiàn)，在胚胎形成過程中，報(bào)告基因在超過 3700 增強(qiáng)子夾線中在不同時(shí)間和不同地點(diǎn)過量表達(dá) (Bier et al.,1989)。 進(jìn)一步表明潛在的基因多效性基因表達(dá)的研究顯露出來 ,幾乎都揭露了一個(gè)基因在多個(gè)地方或多次表達(dá) 。 在果蠅細(xì)菌排列和復(fù)眼進(jìn)行了大量的功能要求的分析。在果蠅 也遵循 基因多效性 規(guī)則。Pickett and MeeksWagner,1995)。 同樣 ,老鼠激活素 /抑制素 B 亞族敲除 ,在 129 / Sv 背景看不見的缺失 ,而在 29/Sv C57BL/6 和 129/Sv BALB/c 背景下滲透 (Vassalli et al.,1994)。 在不同的遺傳背景中，基因敲除可以導(dǎo)致不同的表型。很明顯 ,在人類簡(jiǎn)單的單基因疾病是少見的 (van Heyningen,1994。例如在酵母中，可能編碼醋酸出口泵的膜蛋白的缺失可能有小的表型影響。Thomas,1993。在進(jìn)行 t 區(qū)遺傳分析 ,找到 17 個(gè)致命的位點(diǎn) ,就在這記錄樣品是根據(jù)老鼠基因組存在 5000 到10000 個(gè)致命位點(diǎn)的數(shù)據(jù)獲得的 (Dove 1987)。 在 263 個(gè)敲除基因，大約有 25%是胚胎致死。 在斑馬魚 ,估計(jì)有大約 5000 個(gè)致命的基因 (Haffter et al.,submitted),雖然基因組中的基因總數(shù)在不被人所知。 在釀酒酵母 ,5800 中大約 900 個(gè)基因是細(xì)胞致死 ,和另外 900 個(gè)停止細(xì)胞周期進(jìn)程或在特殊培養(yǎng)基中造成生長(zhǎng)損害 (Burns et al.,1994)。我們?cè)u(píng)價(jià)了公布 27 個(gè)受到大量的突變的不同的染色體區(qū)域的數(shù)據(jù)。 一些基因組變動(dòng)的后果不可能通過正常的遺傳過程得到彌補(bǔ) ， 并導(dǎo)致有機(jī)體在成年之前死亡。關(guān)于基因數(shù)目增加趨勢(shì)的事例支持這個(gè)觀點(diǎn) :果蠅 的Ras,Raf、 Notch 基因和 Hox 基因的聚類各有一個(gè)復(fù)制 ,而脊椎動(dòng)物這些基因有三個(gè)或三個(gè)以上的復(fù)制。在老鼠和人類基因組大多數(shù)的基因的存在是多基因家族 ,多基因家族有些成員存在數(shù)百到幾千年了。 在基因組水平復(fù)制有多廣泛？ 流感嗜血桿菌的分析表明 ,30%的 1760 個(gè)基 因復(fù)制基本上是相同的產(chǎn)品 (布等問題 ,1995)。 如果基因 組計(jì)劃驗(yàn)證人類與老鼠的基因組八倍體的本質(zhì)的基礎(chǔ) ,然后基本脊椎動(dòng)物基因數(shù)目可能和的果蠅和蠕蟲相似 ,大約12020 到 14000 個(gè)基因。 就目前掌握的信息來看 ,人類基因組可能少于 50000 或多于 100,000 基因。 在所有的后生動(dòng)物中核心生化途徑及機(jī)制的數(shù)目相似 多聚核糖體 mRNA 數(shù)據(jù)證實(shí)魷魚至少有 35000個(gè)基因（ Capano et al.,1986），且我們根據(jù)克隆 mRNA 長(zhǎng)度從四倍體煙草的重新評(píng)估數(shù)據(jù)顯示這個(gè)植物大約有 43000 個(gè)基因。 其他生物的比較顯示 ,單細(xì)胞原生動(dòng)物、線蟲的蠕蟲、果蠅發(fā)育和功能用 到了 12020 到 14000 個(gè)基因 (表 1)。在 嵌入的 158 轉(zhuǎn)錄單位的范圍，每個(gè)基因組大約是 11000。 當(dāng)按一一排列時(shí)， 278 個(gè)用于分析的轉(zhuǎn)錄單位占有 的基因組 DNA。首先我們通過分析文庫(kù)里的 cDNAs 來確定轉(zhuǎn)錄單元的長(zhǎng)度，這個(gè)庫(kù)利用了 cDNAs 可以和基因組 DNA 對(duì)齊的 278 處。我們檢查現(xiàn)有的數(shù)據(jù)，總結(jié)出果蠅中基因數(shù)目將近 12020，數(shù)據(jù)接近尖毛蟲和線蟲。在極小的獨(dú)立生存的紅藻，如果這個(gè)單細(xì)胞藻類的基因密度和酵母相似，我們估算大約有 5000 基因。這些只是能夠在模式生物中迅速獲得，允許大部分人類基因組編碼的大約 70000 個(gè) 獨(dú)立基因減少為小數(shù)目的多部件，這是知道生物化學(xué)功能的過程。 基因組計(jì)劃在決定基因功能中的角色：來自模式生物的洞察 前言 大量數(shù)據(jù)表明，從 DNA 序列到線上腦圖譜，都在公共數(shù)據(jù)庫(kù)中迅速被累積，并且人們對(duì)利用增長(zhǎng)的強(qiáng)大的計(jì)算機(jī)分析完整的數(shù)據(jù) 來 滿足我們從 DNA序列到生物學(xué)功能的研究具有很高的期望值。轉(zhuǎn)基因 技 術(shù)和遺傳學(xué)方法的應(yīng)用 —— 和總基因組序列及基因表達(dá)平臺(tái)數(shù)據(jù)庫(kù)信息、在發(fā)展中的形態(tài)學(xué)變化、突變表型相一致 —— 能夠加強(qiáng)我們解開控制基因表達(dá)和變異的多層網(wǎng)絡(luò)的能力。 來自啤酒酵母菌基因組計(jì)劃的估算證實(shí)在這個(gè)真菌基因組中大概有 5800的蛋白編碼基因。 在果蠅中，現(xiàn)在估計(jì)基因數(shù)目范圍 在 8000 到 20200 之間。我們通過三種方式估算 115Mb 組分的編碼能力。多重轉(zhuǎn)錄是由于自身起始位點(diǎn)出聚腺苷酸化位點(diǎn)的改變或者是單位點(diǎn)的選擇性 RNA 剪接產(chǎn)生的，不是多基因而是單轉(zhuǎn)錄單位的變體。我們的第二個(gè)設(shè)想是利用了只有兩轉(zhuǎn)錄單元的最小量的那些例子，它們可應(yīng)用在基因組 DNA 的任何相鄰段 ,因此包括轉(zhuǎn)錄單元之間的 DNA?；诳寺〔牧蠌?11000變化到大概 13000轉(zhuǎn)錄單位的兩個(gè)最可靠的估算，我們將 12020 當(dāng)成果蠅蛋白質(zhì)編碼基因的數(shù)目的工作數(shù)據(jù)。在被遺傳單位占有的 DNA 的平均數(shù)目不斷增加，在細(xì)菌中是 1Kb，酵母中 2Kb，果蠅中 10Kb，很可能反應(yīng)了后生生物體中對(duì)順式作用元件的增長(zhǎng)性需求。雖然到 1995 年，10 月，公共 數(shù)據(jù)庫(kù)中可應(yīng)用的人類表達(dá)序列標(biāo)簽（ ESTs）超過 270000 ，但是還不清楚有多少基因
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