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第十章核酸分子雜交技術-wenkub

2022-10-28 15:27:36 本頁面
 

【正文】 原理 ? 具有互補序列兩條單鏈核酸分子在一定條件下 按堿基互補配對原則退火形成雙鏈的過程。 ( 2)酸堿變性: pH值低于 3或高于 10時,雙鏈核 酸分子鏈 間的氫鍵斷裂。 復性過程 ( 1)單鏈分子間碰撞形成局部雙鏈 ( 2)局部雙鏈周圍的堿基如不配對時,雙鏈重新解離 ( 3)局部雙鏈周圍的堿基如配對,則形成中心序列 ( 4)形成完整的雙鏈分子 復性的速率方程(服從二級反應動力學) dC dt =K2C2 ( 1) 將( 1)積分 C Co 1 1+K2Cot = ( 2) 一半單鏈 DNA分子復性時,( 2)式中的 為 1 2 1 2 1 1+K2Cot = Cot1/2值越大,復性速度越慢 C Co ( 3) 1 K2 Cot1/2= 二、影響雜交的因素 核酸分子的濃度和長度: 濃度越大,復性速度越快 分子越大,復性速度越慢 單鏈探針,濃度增加,雜交效率增加 雙鏈探針,濃度控制在 ~,濃度過高影響雜 交效率 溫度: ( 1) DNA/DNA雜交,適宜溫度較 Tm值低 20~25℃ ( 2) RNA/DNA或 RNA/RNA雜交,加甲酰胺降低 Tm值 ( 3)用寡核苷酸探針雜交,適宜溫度較 Tm值低 5℃ 離子強度: ( 1)低鹽濃度時雜交率較低,隨著鹽濃度增加,雜交率增加 ( 2)高濃度的鹽使堿基錯配的雜交體更穩(wěn)定,當進行序列不完全同源的核酸分子雜交時,必須維持雜交反應液中較高的鹽濃度和洗膜溶液的鹽濃度 甲酰胺: ( 1)甲酰胺能降低核酸雜交的 Tm值,能降低雜交液的溫度,低溫時探針與待測核酸雜交更穩(wěn)定,當待測核酸與探針同源性不高時,加 50%甲酰胺溶液在35~42 ℃ 雜交 ( 2)如待測核酸序列與探針同源性高時,則用水溶液在 68℃ 雜交 核酸分子的復雜性: ( 1)核酸的復雜性是指存在于反應體系中不同順序的總長度 ( 2) Cot189。 其基本原理是:容器中的轉移緩沖液含有高濃度的 NaCl和檸檬酸鈉,上層吸水紙的虹吸作用使緩沖液通過濾紙橋、濾紙、凝膠、硝酸纖維素濾膜向上運動,同時帶動凝膠中的 DNA片段垂直向上運動,凝膠中的 DNA片段移出凝膠而滯留在膜上 ( 2)電轉法 利用電場的電泳作用將凝膠中的 DNA轉移到固相支持物上。 (一) RNA酶保護分析法 RNA酶保護分析法原理 RNaseA和 RNaseT1專一水解雜交體系中的單鏈 RNA,不水解探針 RNA與待測 RNA互補形成的雙鏈 RNA,使雜交分子得到保護,稱 RNA酶保護分析法。gDNA以上 可直接在低熔點瓊脂糖溶液中進行標記 (三) PCR標記法: 將標記的核苷酸作為 PCR反 應的底物,以待標記的 DNA為模板,經PCR反應,標記的核苷酸摻入到新合成的 DNA分子中
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