【正文】 產(chǎn)生無性孢子，無性孢子萌發(fā)形成新的菌絲體，多次重復(fù)。b）方式因菌種不同而異，有的兩條營養(yǎng)菌絲就可以直接結(jié)合，有的則由特殊的性細(xì)胞（性器官）相互交配，形成有性孢子。2）有性孢子繁殖兩個性細(xì)胞結(jié)合產(chǎn)生新個體的過程：a）質(zhì)配：兩個性細(xì)胞結(jié)合，細(xì)胞質(zhì)融合，成為雙核細(xì)胞，每個核均含單倍染色體（n+n）。對熱、干燥、光照、脫水及普通化學(xué)試劑的抗性均差，離開宿主僅能存活數(shù)小時至數(shù)日，但如隨節(jié)肢動物糞便排出，在空氣中自然干燥后，其抗性變得相當(dāng)強。立克次氏體：1）某些性質(zhì)與病毒相近a 、專性活細(xì)胞寄生物，除五日熱（戰(zhàn)壕熱）立克次氏體（Rickettsia wolhynica）外均不能在人工培養(yǎng)基上生長繁殖。放線菌的形態(tài)與結(jié)構(gòu)t單細(xì)胞，大多由分枝發(fā)達(dá)的菌絲組成；t菌絲直徑與桿菌類似，約1mm；t細(xì)胞壁組成與細(xì)菌類似，革蘭氏染色陽性（少數(shù)陰性）；t細(xì)胞的結(jié)構(gòu)與細(xì)菌基本相同，按形態(tài)和功能可分為營養(yǎng)菌絲、氣生菌絲和孢子絲三種。（詳見P58）細(xì)菌的趨避運動：鞭毛的功能是運動，這是原核生物實現(xiàn)其趨性（taxis）即趨向性的最有效方式。經(jīng)特殊的莢膜染色，特別是負(fù)染色（又稱背景染色）后可在光學(xué)顯微鏡清楚地觀察到它的存在。芽孢是細(xì)菌的休眠體，在適宜的條件下可以重新轉(zhuǎn)變成為營養(yǎng)態(tài)細(xì)胞；產(chǎn)芽孢細(xì)菌的保藏多用其芽孢。氣泡的膜只含蛋白質(zhì)而無磷脂。當(dāng)環(huán)境中缺乏能源而碳源豐富時，細(xì)胞內(nèi)就儲藏較多的碳源類內(nèi)含物，甚至達(dá)到細(xì)胞干重的50%，如果把這樣的細(xì)胞移入有氮的培養(yǎng)基時，這些儲藏物將被作為碳源和能源而用于合成反應(yīng)。當(dāng)環(huán)境中環(huán)境中還原性硫缺乏時，可被細(xì)菌重新利用。 由磷脂分子形成的雙分子膜中加入甾醇類物質(zhì)可以提高膜的穩(wěn)定性：真核生物細(xì)胞膜中一般含有膽固醇等甾醇，含量為5%25%。第一章1. 巴斯德的工作(1) 發(fā)現(xiàn)并證實發(fā)酵是由微生物引起的 (2) 徹底否定了“自然發(fā)生”學(xué)說(3) 免疫學(xué)——預(yù)防接種　　 (4) 其他貢獻(xiàn)：巴斯德消毒法等2. 柯赫的工作(1) 微生物學(xué)基本操作技術(shù)方面的貢獻(xiàn)a） 細(xì)菌純培養(yǎng)方法的建立　　 b） 配制培養(yǎng)基c） 流動蒸汽滅菌　　　　d） 染色觀察和顯微攝影（2） 對病原細(xì)菌的研究作出了突出的貢獻(xiàn)：a） 具體證實了炭疽病菌是炭疽病的病原菌。有些寄生性真菌與宿主共同形成假菌核。為吸收菌絲，進(jìn)入藻類或植物細(xì)胞，二者共生。這些生長在土壤中真菌是捕食者，形成的特異菌絲構(gòu)成巧妙的網(wǎng)，可以捕捉小型原生動物或無脊椎動物，捕獲物死后，菌絲伸入體內(nèi)吸收營養(yǎng)。它們同人類的生產(chǎn)、生活關(guān)系密切，是人類實踐活動中最早認(rèn)識和利用的一類微生物。霉菌菌體均由分枝或不分枝的菌絲（hypha）構(gòu)成。在分類地位上與真細(xì)菌和真核生物并列為三域（Domain），并且在進(jìn)化譜系上更接近真核生物。6）分泌粘液層、莢膜或形成鞘衣，因此具有強的抗干旱能力。3）細(xì)胞中含有葉綠素a，進(jìn)行產(chǎn)氧型光合作用。一般認(rèn)為后者為突變株；可能成為防治有害細(xì)菌的一種有力武器。能形成子實體是粘細(xì)菌區(qū)別于其它原核微生物的最主要標(biāo)志。對紅霉素、氯霉素、四環(huán)素敏感。5）衣原體廣泛寄生于人類、哺乳動物及鳥類，少數(shù)致病，如沙眼衣原體是人類砂眼的病原體，甚至引起結(jié)膜炎、角膜炎、角膜血管翳等臨床癥狀，成為致盲的重要原因。核糖體也是由30S和50S二個亞基組成。微生物學(xué)筆記(沈萍版)支原體：1）無細(xì)胞壁，只有細(xì)胞膜，細(xì)胞形態(tài)多變；2）個體很小，能通過細(xì)菌過濾器，曾被認(rèn)為是最小的可獨立生活的細(xì)胞型生物。2）細(xì)胞呈球形或橢圓形， mm，能通過細(xì)菌濾器；3）專性活細(xì)胞內(nèi)寄生；衣原體有一定的代謝活性，能進(jìn)行有限的大分子合成，但缺乏產(chǎn)生能量的系統(tǒng)，必須依賴宿主獲得ATP，因此又被稱為“能量寄生型生物”4）在宿主細(xì)胞內(nèi)生長繁殖具有獨特的生活周期，即存在原體和始體兩種形態(tài)。1956年，我國微生物學(xué)家湯飛凡等應(yīng)用雞胚卵黃囊接種法，在國際上首先成功地分離培養(yǎng)出沙眼衣原體。粘細(xì)菌生活史：營養(yǎng)細(xì)胞：桿狀、柔軟、缺乏堅硬的細(xì)胞壁，無鞭毛，產(chǎn)生粘液，可在固體表面作“滑行”運動，以分類方式進(jìn)行繁殖。而在營養(yǎng)生長階段如果有足夠的養(yǎng)料就不形成子實體，當(dāng)營養(yǎng)耗盡時，營養(yǎng)細(xì)胞群就開始形成子實體。藍(lán)細(xì)菌特性：1）分布極廣；2）形態(tài)差異極大；有球狀、桿狀和絲狀體，個體直徑一般為310 mm，有的可達(dá)60 mm。它被認(rèn)為是地球上生命進(jìn)化過程中第一個產(chǎn)氧的光合生物，對地球上從無氧到有氧的轉(zhuǎn)變、真核生物的進(jìn)化起著里程碑式的作用。7）無鞭毛，但能在固體表面滑行，進(jìn)行光趨避運動。在細(xì)胞構(gòu)造上與真細(xì)菌較為接近，同屬原核生物。許多菌絲交織在一起，稱為菌絲體（mycelium）。食物、工農(nóng)業(yè)制品的霉變（據(jù)統(tǒng)計全世界平均每年由于霉變而不能食（飼）用的谷物約占2%，這是一筆相當(dāng)驚人的經(jīng)濟損失。3）附枝：匍匐菌絲、假根（類似樹根，吸收營養(yǎng)），功能是固著和吸收營養(yǎng)，例如根霉（Rhizopus）匍匐枝和基質(zhì)接觸處分化出來的根狀結(jié)構(gòu)。6）附著胞，許多植物寄生真菌在其芽管或老菌絲頂端發(fā)生膨大，并分泌粘性物，借以牢固地粘附在宿主的表面，這一結(jié)構(gòu)就是附著胞，附著胞上再形成纖細(xì)的針狀感染菌絲，以侵入宿主的角質(zhì)層而吸取營養(yǎng)。例如冬蟲夏草：8）子座：菌絲交織成墊狀、殼狀等，在子座外或內(nèi)可形成繁殖器官。　　b） 發(fā)現(xiàn)了肺結(jié)核病的病原菌c） 證明某種微生物是否為某種疾病病原體的基本原則——柯赫原則1 在每一病例中都出現(xiàn)這種微生物；　2 要從寄主分離出這樣的微生物并在培養(yǎng)基中培養(yǎng)出來；3用這種微生物的純培養(yǎng)接種健康而敏感的寄主，同樣的疾病會重復(fù)發(fā)生； 4 從試驗發(fā)病的寄主中能再度分離培養(yǎng)出這種微生物來。原核生物與真核生物的最大區(qū)別就是其細(xì)胞膜中一般不含膽固醇，而是含有hopanoid（藿烷類化合物 ）。微生物儲藏物的特點及生理功能：1） 不同微生物其儲藏性內(nèi)含物不同。3） 儲藏物以多聚體的形式存在，有利于維持細(xì)胞內(nèi)環(huán)境的平衡，避免不適合的pH，滲透壓等的危害。二種蛋白質(zhì)相互交連，形成一個堅硬的結(jié)構(gòu)，可耐受一定的壓力。芽孢的有無、形態(tài)、大小和著生位置是細(xì)菌分類和鑒定中的重要指標(biāo)。（2）產(chǎn)生糖被是微生物的一種遺傳特性，其菌落特征及血清學(xué)反應(yīng)是是細(xì)菌分類鑒定的指標(biāo)之一。（參見P60）化學(xué)趨避運動或趨化作用（chemotaxis）：細(xì)菌對某化學(xué)物質(zhì)敏感，通過運動聚集于該物質(zhì)的高濃度區(qū)域或低濃度區(qū)域。養(yǎng)菌絲：匍匐生長于培養(yǎng)基內(nèi)，吸收營養(yǎng)，也稱基內(nèi)菌絲。這是因為它們體內(nèi)酶系不完全，一些必需的養(yǎng)料需從宿主細(xì)胞獲得；細(xì)胞膜比一般細(xì)菌的膜疏松，營養(yǎng)物質(zhì)較易通過，細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)也容易漏出。有的可在室溫下保持毒力二年左右。b）核配：兩個核融合，成為二倍體接合子核，此時核的染色體數(shù)是二倍（2n）。c）核配后一般立即進(jìn)行減數(shù)分裂，因此菌體染色體數(shù)目為單倍，雙倍體只限于接合子。有性繁殖階段；在發(fā)育后期，在一定條件下，在菌絲體上分化出特殊性器官（細(xì)胞），質(zhì)配、核配、減數(shù)分裂后形成單倍體孢子，再萌發(fā)形成新的菌絲體。霉菌的孢子具有小、輕、干、多以及形態(tài)色澤各異、休眠期長和抗逆性強等特點。孢子的這些特點，都有助于真菌在自然界中隨機散播和繁殖。酵母菌的分布及與人類的關(guān)系：多分布在含糖的偏酸性環(huán)境，也稱為“糖菌”。B、進(jìn)行減數(shù)分裂，形成4個或8個子囊孢子，而原有的營養(yǎng)細(xì)胞就成為子囊。紅硫細(xì)菌，以H2S為電子供體，產(chǎn)生細(xì)胞物質(zhì)，并伴隨硫元素的產(chǎn)生。氧化還原電位：又稱氧化還原電勢（redox potential），是度量某氧化還原系統(tǒng)中的還原劑釋放電子或氧化劑接受電子趨勢的一種指標(biāo)，其單位是V（伏）或mV（毫伏）。以“野”代“家”：以野生植物原料代替栽培植物原料，如木薯、橡子、薯芋等都是富含淀粉質(zhì)的野生植物，可以部分取代糧食用于工業(yè)發(fā)酵的碳源。另外,大量的農(nóng)副產(chǎn)品或制品，如麩皮、米糠、玉米漿、酵母浸膏、酒糟、豆餅、花生餅、蛋白胨等都是常用的發(fā)酵工業(yè)原料。除了生產(chǎn)石油蛋白外，還可以將石油產(chǎn)品轉(zhuǎn)化成一些產(chǎn)值更高的高級醇、脂肪酸、環(huán)烷酸等化工產(chǎn)品和若干合成物，以及對石油產(chǎn)品的品質(zhì)進(jìn)行改良，如脫硫、脫蠟等。能進(jìn)行硝酸鹽呼吸（即能使硝酸鹽還原）的細(xì)菌被稱為硝酸鹽還原細(xì)菌，主要生活在土壤和水環(huán)境中，它們當(dāng)中有假單胞菌、依氏螺菌、脫氮小球菌等。克服反硝化作用的有效方法之一是松土，保持土壤的疏松狀態(tài)，排除過多的水分，保證土壤中有良好的通氣條件（此時菌行有氧呼吸）2）反硝化作用在氮素循環(huán)中也有重要作用。除氧以外的多種物質(zhì)可被各種微生物用作最終電子受體，充分體現(xiàn)了微生物代謝類型的多樣性。這是一個大量耗能和耗還原力[H]的過程。四種生理類型的微生物在不同光照和氧下的ATP合成微生物 ATP的合成有氧 無氧光照 黑暗 光照 黑暗光合細(xì)菌 – – + –綠藻 + – – –兼性厭氧菌（E. coli） + + + +鹽生鹽桿菌 + + + –目前認(rèn)為，細(xì)菌視紫紅質(zhì)與葉綠素相似，在光量子的驅(qū)動下，具有質(zhì)子泵的作用，產(chǎn)生質(zhì)子的跨膜運輸而形成ATP。嗜鹽菌紫膜光合磷酸化的發(fā)現(xiàn)，使經(jīng)典的葉綠素和細(xì)菌葉綠素（菌綠素）所進(jìn)行的光合磷酸化之外又增添了一種新的光合作用類型。一般來說處于遲緩期的細(xì)菌細(xì)胞體積最大；2）細(xì)胞內(nèi)RNA，尤其是rRNA含量增高，合成代謝活躍，核糖體、酶類和ATP的合成加快，易產(chǎn)生誘導(dǎo)酶。對數(shù)期到穩(wěn)定期的轉(zhuǎn)變是細(xì)胞重要的分化調(diào)節(jié)階段：1）開始儲存糖原等內(nèi)含物；2）形成芽孢或建立自然感受態(tài)（芽孢桿菌）；3）發(fā)酵過程積累代謝產(chǎn)物的重要階段；某些放線菌抗生素的大量形成也在此時期衰亡期特點：1）細(xì)菌代謝活性降低；　2）細(xì)菌衰老并出現(xiàn)自溶；　3）產(chǎn)生或釋放出一些產(chǎn)物；如氨基酸、轉(zhuǎn)化酶、外肽酶或抗生素等。濕熱比干熱滅菌更好：1）更易于傳遞熱量；2）更易破壞保持蛋白質(zhì)穩(wěn)定性的氫鍵等結(jié)構(gòu)；濕熱對一般營養(yǎng)體和孢子的殺滅條件：1） 多數(shù)細(xì)菌和真菌的營養(yǎng)細(xì)胞：在60℃左右處理510分鐘；2）酵母菌和真菌的孢子：用80℃以上溫度處理；2） 3）細(xì)菌的芽孢：121℃處理15分鐘以上 第七章1939年，Max Delbruck amp。4） （ gpcro表達(dá)得早，但與基因組的結(jié)合能力較cI弱）5）阻遏蛋白cI的同樣可以抑制其它新侵入的λ噬菌體的表達(dá)，從而使溶源性細(xì)菌具有“免疫性”6）阻遏蛋白cI在一般情況下通過自身的轉(zhuǎn)錄激活保持低水平的表達(dá)，但有時種種原因轉(zhuǎn)錄水平下降，會偶爾導(dǎo)致溶源性噬菌體進(jìn)入裂解循環(huán)（105~10 2）。基因組（genome）一個物種的單倍體的所有染色體及其所包含的遺傳信息的總稱。但是信息傳遞系統(tǒng)(復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯)則與細(xì)菌不同而類似于真核生物。4）重復(fù)序列多質(zhì)粒的檢測：a）　提取所有胞內(nèi)DNA后電鏡觀察；b）　根據(jù)質(zhì)粒的分子大小和結(jié)構(gòu)特征，通過超速離心或瓊脂糖凝膠電泳可將質(zhì)粒與染色體DNA分開c）　對于常用菌，可用質(zhì)粒所帶的某些特點，如抗藥性初步判斷。抗生素一般具有較廣的抗菌譜。而枯草芽孢桿菌（B. subtilis）產(chǎn)生的細(xì)菌素被命名為subtilisin（枯草桿菌素）。還有一些colicins則在細(xì)胞膜上形成通道，造成鉀離子和質(zhì)子的外泄，使細(xì)胞失去能化膜而不能產(chǎn)生能量。可以通過某待測物質(zhì)對微生物的誘變能力間接判斷其致癌能力。DNA不能復(fù)制，因此群體中僅一個細(xì)胞含有DNA，而其它細(xì)胞只能得到其基因產(chǎn)物，形成微小菌落。局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)與普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的主要區(qū)別：1）　被轉(zhuǎn)導(dǎo)的基因共價地與噬菌體DNA連接，與噬菌體DNA一起進(jìn)行復(fù)制、包裝以及被導(dǎo)入受體細(xì)胞中。 c）　DNA以雙鏈形式在細(xì)胞表面的幾個位點上結(jié)合并遭到核酸酶的切割，核酸內(nèi)切酶首先切斷DNA雙鏈中的一條鏈，被切斷的鏈遭到核酸酶降解，成為寡核苷酸釋放到培養(yǎng)基中，另一條鏈與感受態(tài)一特異蛋白質(zhì)結(jié)合，并被引導(dǎo)進(jìn)入細(xì)胞，d）　進(jìn)入細(xì)胞的外源DNA通過同源重組以置換的方式整合進(jìn)受體染色體DNA，經(jīng)復(fù)制和細(xì)胞分裂后形成重組體?，F(xiàn)在把DNA轉(zhuǎn)移至動物細(xì)胞的過程也稱轉(zhuǎn)染。菌種保藏：在一定時間內(nèi)使菌種不死、不變、不亂 第九章目前常用的三種體外DNA連接方法為：① DNA連接酶可連接具有互補粘性末端的DNA片段；② 用T4 DNA連接酶連接具有平末端的DNA片段；③ 先在DNA片段末端加上人工接頭，使其形成粘性末端，然后再行連接。2）具有質(zhì)粒載體的特性：在寄主細(xì)胞內(nèi)如質(zhì)粒一樣進(jìn)行復(fù)制，攜帶有抗性基因和克隆位點，并具氯霉素擴增效應(yīng)。 M13是大腸桿菌絲狀噬菌體，其基因組為環(huán)狀ssDNA，大小為6407bp。主要被用于制備測序用單鏈DNA模板、特異的單鏈DNA探針，進(jìn)行定位誘變等，也可用于噬菌體展示（phage display第十章　 微生物的生態(tài)有關(guān)基本概念：生態(tài)系統(tǒng)：在一定的空間內(nèi)生物的成分和非生物的成分通過物質(zhì)循環(huán)和能量流動互相作用、互相依存而構(gòu)成的一個生態(tài)學(xué)功能單位。由于水中含有過多的含氮、磷等的營養(yǎng)物質(zhì)，引起藻類過量生長，產(chǎn)生大量的有機物（藻類）異養(yǎng)微生物氧化這些有機物，耗盡水中的氧，使厭氧菌開始大量生長和代謝，并分解含硫化合物，產(chǎn)生H2S，從而導(dǎo)致水有難聞的氣味，并由于缺氧引起魚和好氧微生物的死亡，最終引起水出現(xiàn)大量沉淀物和水體顏色異常。2）土壤微生物的數(shù)量和分布受季節(jié)影響；3）微生物的數(shù)量也與于土層的深度有關(guān)，一般土壤表層微生物最多，隨著土層的加深，微生物的數(shù)量逐步減少。其方法通常是用各種特定的引物（例如所有真細(xì)菌（eubacteria）的保守16s rRNA區(qū)段或某種微生物的特異DNA或16s rRNA保守序列等）進(jìn)行PCR從各種生態(tài)環(huán)境中克隆16s rRNA，并對其進(jìn)行序列分析和同源性分析，發(fā)現(xiàn)和開發(fā)不可培養(yǎng)微生物。生態(tài)系統(tǒng)是生物圈的組成單元，生物圈內(nèi)的任何一個相對完整的自然整體都可以被看作為生態(tài)系統(tǒng)，如一個池塘，一片森林，一個污水處理池，等等。因此，這是一種“可分可合，合比分好”的相互關(guān)系（一）　 微生物間的互生關(guān)系　　在自然界中，微生物間的互生關(guān)系非常普遍，也很重要。（二）　　微生物和植物間的共生關(guān)系根瘤菌與豆