蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)ppt課件(2)(已修改)
2025-05-19 13:49 本頁(yè)面
【正文】 第三節(jié) 蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu) ? 蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)： 蛋白質(zhì)多肽鏈骨架的規(guī)則排列 一 肽平面（ peptide plane） ： 蛋白質(zhì)多肽鏈?zhǔn)怯稍S多的氨基酸以肽鍵連接形成的 ， 其基本結(jié)構(gòu)是： H O H O H O NH2 CαCNCαCN CαCN … R H R H R H 其中虛線框內(nèi)的部分形成一個(gè) 肽 (基 )平面 。 肽平面結(jié)構(gòu)特征 : ? 肽鍵長(zhǎng) =， 具部分 雙鍵性質(zhì) ， 不能自由旋轉(zhuǎn) ? 肽單位上的六個(gè)原子 都位于同一個(gè)平面上 ， 因此肽平面具有剛性 ? 在肽單位中 ， C=O與 N–H 或兩個(gè) C?呈反式排布 。 ? 除 Pro外 ， N–C?（ ?） 和 C?–C（ ?） 都是單鍵 ， 可以繞鍵軸自由旋轉(zhuǎn) ， 其旋轉(zhuǎn)角度分別用 ?和 ?表示 ， 稱為 二面角 （ dihedral angle） N C O H C? C? ? ? 二面角取值的定義 ： ? 從 C?看 N1：順時(shí)針轉(zhuǎn) ， ?為正 逆時(shí)針轉(zhuǎn) ， ?為負(fù) ? 從 C?看 C2：順時(shí)針轉(zhuǎn) ， ?為正 逆時(shí)針轉(zhuǎn) ， ?為負(fù) ? C?–C， 兩側(cè) : C?–N1與 C2=O呈反式： ? =0186。 順式： ?=180186。 ? N–C? 兩側(cè) : C?–C2與 N1–H呈反式： ?=0186。 順式： ?=180186。 N C o 完全伸展的多肽主鏈構(gòu)象 α碳原子 酰胺平面 Φ=1800， ψ=1800 多肽主鏈構(gòu)象 酰胺平面 Φ=00， ψ=00 側(cè)鏈 非鍵合原子接觸半徑 二 Ramachandran 圖 (拉氏圖， ? ? map) ? 允許區(qū) （ %） ：非鍵合原子之間的距離都不小于標(biāo)準(zhǔn)接觸距離 ,為最穩(wěn)定的構(gòu)象類型 。 右手 ?螺旋 ， ?折疊 ， 膠原螺旋等 。 ? 部分允許區(qū) （ 13%） ： ?和 ?所決定的構(gòu)象是立體 化學(xué)所允許的 ， 但不夠穩(wěn)定 。 如： 310螺旋 ， ?螺旋和左手 ?螺旋等 。 ? 不允許區(qū) （ ~80%） ： 非鍵合原子之間的距離小于 極限值 ， ?和 ?值所決定的構(gòu) 象是立體化學(xué)所不允許的 。 A186。 C N O H C () () … N () ()
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