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生物化學(xué)第十章酶的作用機(jī)制和酶的調(diào)節(jié)(已修改)

2025-01-28 14:26 本頁(yè)面
 

【正文】 202217 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 第十章 酶的作用機(jī)制和酶的調(diào)節(jié) 一、酶的活性部位 二、酶催化反應(yīng)的獨(dú)特性質(zhì) 三、影響酶催化效率的有關(guān)因素 四、酶催化反應(yīng)機(jī)制的實(shí)例 五、酶活性的調(diào)節(jié)控制 六、同工酶 202217 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 一、酶的活性部位 活性中心:酶分子中結(jié)合底物并起催化作用的少數(shù)氨基酸殘基 , 包括底物結(jié)合部位 ( 決定酶的專(zhuān)一性 ) 、 催化部位 ( 決定酶所催化反應(yīng)的性質(zhì) ) 。 頻率最高的活性中心的氨基酸殘基: Ser、 His、 Cys、Tyr、 Asp、 Glu、 Lys。 不需要輔酶的酶:活性中心是酶分子在三維結(jié)構(gòu)上比較靠近的少數(shù)幾個(gè)氨基酸殘基或是這些殘基的某些基團(tuán) 。 需要輔酶的酶:輔酶分子或輔酶分子的某一部分結(jié)構(gòu)往往就是活性中心的組成部分 。 (一)酶活性部位的特點(diǎn) 202217 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 接觸殘基: R R RR R R163 輔助殘基: R R RR16 R165 結(jié)構(gòu)殘基: R R162 、R169 非貢獻(xiàn)殘基:其它 202217 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 酶蛋白 必需殘基 非必需殘基 活性中心 活性中心外 接觸殘基 輔助殘基 結(jié)構(gòu)殘基 結(jié)合殘基 催化基團(tuán) ( 1) 接觸殘基: 結(jié)合基團(tuán) , 催化基團(tuán) 。 ( 2) 輔助殘基: 不與底物接觸 , 輔助酶與底物結(jié)合 , 協(xié)助接觸殘基 。 上述兩類(lèi)殘基構(gòu)成 酶活性中心 。 ( 3) 結(jié)構(gòu)殘基: 維持酶分子三維構(gòu)象 , 與酶活性相關(guān) , 但不在酶活性中心范圍內(nèi) , 屬于酶活性中心以外的必需殘基 。 上述三類(lèi)殘基統(tǒng)稱(chēng)酶的 必需基團(tuán) ( 4) 非貢獻(xiàn)殘基 ( 非必需基團(tuán) ) 可能在免疫 , 酶活性調(diào)節(jié) , 運(yùn)輸轉(zhuǎn)移 , 防止降解等方面起作用 。 202217 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 酶活性部位的特點(diǎn): ( 1) 活性部位在酶分子的總體中只占相當(dāng)小的部分 ,往往只占整個(gè)酶分子體積的 1%2% ; ( 2) 酶的活性部位是一個(gè)三維實(shí)體 , 具有三維空間結(jié)構(gòu) 。 活性中心的空間構(gòu)象不是剛性的 , 在與底物接觸時(shí)表現(xiàn)出一定的柔性和運(yùn)動(dòng)性 。 ( 鄒承魯研究酶變性的工作 ) ( 3) 通過(guò)誘導(dǎo)契合酶和底物結(jié)合; ( 4) 酶的活性部位是位于酶表面的一個(gè)裂隙內(nèi) , 裂隙內(nèi)是一個(gè)相當(dāng)疏水的環(huán)境 , 從而有利于同底物的結(jié)合 ; ( 5) 底物通過(guò)次級(jí)鍵較弱的力結(jié)合到酶上 。 202217 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 (二)研究酶活性部位的方法 ( 1) 通過(guò)酶的專(zhuān)一性: 研究酶的專(zhuān)一性底物的結(jié)構(gòu)特點(diǎn) 、 酶的競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑結(jié)構(gòu)特點(diǎn)等 。 ( 2) 酶的化學(xué)修飾法: 例如 共價(jià)修飾的試劑 作用于酶 , 查明保持酶活力的必需基團(tuán); ( 合成底物類(lèi)似物 ) ; 3.— SH保護(hù)劑的使用 。 ( 3) X射線晶體衍射法 ( 4) 分子生物學(xué)的方法 202217 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 二、酶催化反應(yīng)的獨(dú)特性質(zhì) ( 1) 酶反應(yīng)分為兩類(lèi):僅涉及 電子轉(zhuǎn)移 和涉及 電子和質(zhì)子兩者或者其他基團(tuán)的轉(zhuǎn)移 。 ( 2) 催化作用是以氨基酸側(cè)鏈上的功能基團(tuán)和輔酶為媒介 。 ( 3) 酶催化反應(yīng)的最適 pH范圍通常狹小 。 ( 4) 酶分子很大 , 而活性部位通常只比底物稍大一些 ,一個(gè)巨大的酶結(jié)構(gòu)對(duì)穩(wěn)定活性部位的構(gòu)象是必要的 。 ( 5) 酶具有復(fù)雜的折疊結(jié)構(gòu) 。 202217 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 三、影響酶催化效率的有關(guān)因素 (一)底物和酶的 鄰近效應(yīng)與定向效應(yīng) 鄰近效應(yīng): 酶與底物形成中間復(fù)合物后使底物之間 、 酶的催化基團(tuán)與底物之間相互靠近 , 提高了反應(yīng)基團(tuán)的有效濃度 。 定向效應(yīng): 由于酶的構(gòu)象作用 , 底物的反應(yīng)基團(tuán)之間 、酶與底物的反應(yīng)
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