【正文】 Gaussian 培訓(xùn) 張祥 G03W的一些設(shè)置 GAUSSIAN03的批處理 ? 在 Scratch文件夾中的 G03程序運(yùn)行的省缺參數(shù)： ? M 200MW ? P 4 ? MaxDisk=10GB ? SCF=Conventional or Direct ? MP2=NoDirect or Direct ? OPTCYC=200 ? SCFCYC=200 ? IOPs 設(shè)置 如 iop（ 2/16=1） ? Default route: MaxDisk=2GB SCF=Direct MP2=Direct OPTCYC=200 SCFcyc=100 iop(2/16=1) iop(5/13=1) ? ? ccsd/631G** opt ? ? L903/L905 and L906 can only do MP2. 問題在于，Ｍ P2=Direct ！ 去掉這個(gè)設(shè)置， CCSD的作業(yè)就能進(jìn)行了。 因此，建議在 Default設(shè)置中只設(shè)置，內(nèi)存，最大硬盤，等項(xiàng)。 勢(shì)能面上的局域極小點(diǎn) 限制性空間軌道和非限制性空間軌道 閉殼層缺省為限制性空間軌道計(jì)算；開殼層缺省為非限制性空間軌道計(jì)算 應(yīng)該用開竅層計(jì)算的體系 ? 具有奇數(shù)個(gè)電子的體系（例如，離子或自由基） ? 激發(fā)態(tài) ? 具有特殊電子結(jié)構(gòu)的體系，如外層具有 2個(gè)或多個(gè)為成對(duì)電子的體系 ? 具有鍵的解離，如反應(yīng)中，需要將一對(duì)電子分開的過程的體系，這樣的體系限制性計(jì)算將導(dǎo)致不正確結(jié)果（盡管電子數(shù)是偶數(shù)） ? 對(duì)于某些體系，需要用額外的關(guān)鍵詞 Guess=mix或者 Guess=alter來強(qiáng)制得到非限制性的波函數(shù)。 凍結(jié)核近似 ? FC=FREEZEN CORE ? 相關(guān)能計(jì)算中不考慮內(nèi)殼層軌道的貢獻(xiàn) ? 要考慮內(nèi)殼層軌道的貢獻(xiàn)用 FULL ? 指定相關(guān)能計(jì)算軌道，用 RW或 Window ? FC， Full， RW 和 Window是互不相容的。 MP2（ FC） :表示 MP2方法下相關(guān)能的計(jì)算不考慮內(nèi)殼層軌道的貢獻(xiàn) MP2（ FULL） :表示 MP2方法下相關(guān)能的計(jì)算考慮所有軌道的貢獻(xiàn) MP2（ FreezenNobleGasCore） = MP2(FrzNGC) MP2(FreezenInnerNobleGasCore)=MP2(FrzINGC) RW的用法 MP2（ RW） /631* sp Title 0 1 分子描述 m, n MP2/631G*水平下 CH4結(jié)構(gòu)優(yōu)化和頻率分析 ? Example 1: Job Type: MP2/631G* OPT %chk=CH4 ！ Link0 命令 : chk,rwf,nosave,mem,nproc P MP2/631G* OPT FREQ TEST ！作業(yè)命令行 ！ 需要空行 OPT And FREQ on CH4 ！ 標(biāo)題行 ！需要空行 0 1 ！電荷和多重度 C ！用內(nèi)坐標(biāo)的分子描述 H 1 r H 1 r 2 a H 1 r 2 a 3 120. H 1 r 2 a 3 120. Variables ！ 變量，表示以下給變量賦值；也可以只空一行 r Constants ！常數(shù)，表示以下量的值計(jì)算中不變；也可以只空一行 a ！空行，必須 電荷和自旋多重度 ? 電荷是指體系所帶的凈的電荷，原子單位 ? 自旋多程度是指體系在優(yōu)外加磁場情況下可能穩(wěn)定存在的狀態(tài)數(shù)。 它與體系中凈的平行自旋電子數(shù)有關(guān)： 平行自旋電子數(shù)和自旋多重度關(guān)系 理論上自旋平方為 S2 = S（ S+1）： 平行自旋電子數(shù) 0 1 2 3 4 S 0 1/2 1 3/2 2 自旋多重度 1 2 3 4 5 理論 S2 輸出文件的解釋 以 CH4為例 : 輸入方向 : 以輸入的坐標(biāo)為準(zhǔn) , 不做處理 Input orientation: Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms) Number Number Type X Y Z 1 6 0 2 1 0 3 1 0 4 1 0 5 1 0 標(biāo)準(zhǔn)方向 : 將坐標(biāo)原點(diǎn)放在分子的電荷中心上 Standard orientation: Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms) Number Number Type X Y Z 1 6 0 2 1 0 3 1 0 4 1 0 5 1 0 X， Y和 Z各方向上，各原子的 z坐標(biāo)分量乘以自身核電荷后加和，結(jié)果為零。 標(biāo)準(zhǔn)方向很重要，很多計(jì)算的性質(zhì)是對(duì)應(yīng)于標(biāo)準(zhǔn)方向的，如 Freq計(jì)算中的分子振動(dòng)方向 ?對(duì)稱性 :Stoichiometry CH4 計(jì)量化學(xué) , 分子式 Framework group TD[O(C),4C3(H)] 所屬分子對(duì)稱群 Deg. of freedom 1 自由度數(shù) Full point group TD NOp 24 點(diǎn)群 Largest Abelian subgroup D2 NOp 4