大型機(jī)使用手冊(cè)-閱讀頁
2025-08-02 20:11本頁面
【正文】 Currently Loaded Modulefiles: 1) intel/ 3) ncl/ 2) openmpi/ 4) cdf/ ? [jliulog02 ~]$ module swap cdf/ cdf/ ? [jliulog02 ~]$ module list Currently Loaded Modulefiles: 1) intel/ 3) ncl/ 2) openmpi/ 4) cdf/ 三 運(yùn)行環(huán)境設(shè)置 ? Fortran 編譯命令 – Intel : ifort – GNU: gfortran – PGI : pgf90/pgf77/pgfortran ? C 編譯命令 – Intel : icc – GNU: gcc – PGI : pgcc ? C++編譯命令 – Intel : icpc – GNU : g++ – PGI : pgCC ? MPI編譯命令 – Fortran : mpif90, mpif77 – C: mpicc – C++ : mpic++, mpicxx 四 作業(yè)管理 1）隊(duì)列設(shè)置 隊(duì)列類型 說明 Regular 最多使用 512個(gè)核，每個(gè)用戶最多可同時(shí)運(yùn)行 2個(gè)任務(wù)，同時(shí)提交 5個(gè)任務(wù) Economy 最多使用 512個(gè)核，每個(gè)用戶最多可同時(shí)運(yùn)行 2個(gè)任務(wù)，同時(shí)提交 5個(gè)任務(wù) Longtime 最多使用 336個(gè)核，每個(gè)用戶最多可同時(shí)運(yùn)行 1個(gè)任務(wù)，同時(shí)提交 2個(gè)任務(wù) 四 作業(yè)管理 2）墻鐘限制 隊(duì)列類型 墻鐘限制 Regular 12小時(shí) Economy 24小時(shí) Longtime 無墻鐘限制 五 賬戶管理規(guī)則 1）賬號(hào)申請(qǐng) ? 項(xiàng)目負(fù)責(zé)人填寫“計(jì)算資源申請(qǐng)表”申請(qǐng)資源 ? 項(xiàng)目成員填寫“高性能計(jì)算機(jī)賬號(hào)申請(qǐng)表”開通其個(gè)人賬號(hào)。小時(shí)） 配額估算依據(jù) 申請(qǐng)人： 填表人： 日期： 填表說明： P+工號(hào) +三位數(shù)字（第一個(gè)為 001， 第二個(gè)為 002， ... ）。 。 五 賬戶管理規(guī)則 超級(jí)計(jì)算機(jī)賬號(hào)申請(qǐng)表 姓名 學(xué)號(hào) /工號(hào) 預(yù)設(shè)賬號(hào) 電話 電子郵件 院系 用戶類別 □ 教師 □ 學(xué)生 □ 合作、訪問學(xué)者 計(jì)算 項(xiàng)目號(hào) 有效期 項(xiàng)目主管人 申請(qǐng)人： 日期： 填表說明： /工號(hào)；合作、訪問人員不用填寫。 ，并由項(xiàng)目負(fù)責(zé)人簽字。 五 賬戶管理規(guī)則 2）賬戶數(shù)目限制 每人只允許使用一個(gè)賬戶。在任意連續(xù) 30日 /90日內(nèi)如果超出配額限制，則該項(xiàng)目組的所有賬號(hào)都需要暫停使用，直到 30日 /90日累計(jì)算量降到配額限制以下才能恢復(fù)使用。小時(shí)’為單位來進(jìn)行統(tǒng)計(jì) ? 獨(dú)占任務(wù) 墻鐘小時(shí) x 所用計(jì)算節(jié)點(diǎn) x 核數(shù) /節(jié)點(diǎn) x 權(quán)重系數(shù) ? 共享任務(wù) 核 $PBS_O_HOST qsub提交的節(jié)點(diǎn)名稱 $PBS_O_QUEUE qsub提交的作業(yè)的最初隊(duì)列名稱 $PBS_O_WORKDIR qsub提交的作業(yè)的絕對(duì)路徑 $PBS_JOBID 作業(yè)被 PBS系統(tǒng)指定的作業(yè)號(hào) $PBS_JOBNAME 用戶指定的作業(yè)名 $PBS_NODEFILE PBS系統(tǒng)指定的作業(yè)運(yùn)行的節(jié)點(diǎn)名 $PBS_QUEUE PBS腳本在執(zhí)行時(shí)的隊(duì)列名 2. PBS的環(huán)境變量 八作業(yè)提交 ３ . 命令運(yùn)行方式 – MPI程序 mpirun n np – OpenMP程序 export OMP_NUM_THREADS = np ./ – 串行程序 ./ 八作業(yè)提交 示例一 MPI并行作業(yè)，使用兩個(gè)節(jié)點(diǎn)，每個(gè)節(jié)點(diǎn)１２個(gè)核 !/bin/bash PBS –S /bin/bash PBS N helloworld PBS P P123456789 PBS q queue Regular PBS l nodes=2:ppn=12 PBS l walltime=00:05:00 cd $PBS_O_WORKDIR nprocs=`cat $PBS_NODEFILE | wc l` mpirun np $nprocs ./ 八作業(yè)提交 示例二 串行作業(yè)，使用 1個(gè)節(jié)點(diǎn)，４個(gè)核運(yùn)行 4個(gè)任務(wù) !/bin/sh ? PBS l nodes=1:ppn=4 ? cd $WORK_DIR1 /usr/bin/time amp。 cd $WORK_DIR3 /usr/bin/time amp。 WRFDA – ? GFORTRAN WRF
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