大型機(jī)使用手冊(已改無錯(cuò)字)
2022-08-15 20:11:40 本頁面
【正文】 90日配額 – 前 29日 /89日的累計(jì)計(jì)算量 ? 每年 10月中旬開始進(jìn)行計(jì)算配額申報(bào)，截至日期為 10月底， 11月中旬將由大型機(jī)主管部門組織高性能資源分配協(xié)調(diào)會(huì)，討論并協(xié)調(diào)高性能計(jì)算資源的最終分配方案 六 計(jì)算資源管理 2）計(jì)算量統(tǒng)計(jì)方式 計(jì)算量按‘核 小時(shí)’為單位來進(jìn)行統(tǒng)計(jì) ? 獨(dú)占任務(wù) 墻鐘小時(shí) x 所用計(jì)算節(jié)點(diǎn) x 核數(shù) /節(jié)點(diǎn) x 權(quán)重系數(shù) ? 共享任務(wù) 核 秒 /3600 x 權(quán)重系數(shù) 七 不允許行為 以下情況將不被允許 ，導(dǎo)致節(jié)點(diǎn)響應(yīng)緩慢，影響到其他用戶 ，直接提交任務(wù)到計(jì)算節(jié)點(diǎn) /繞過工作目錄卷、臨時(shí)文件目錄卷的文件清理機(jī)制 處理 不進(jìn)行通知，直接中止正在運(yùn)行的程序 第一次違反，將給以警告 第二次違反，將立即禁用賬號 30天 第三次違反，立即禁用賬號，在項(xiàng)目負(fù)責(zé)人提出賬戶解凍申請并做相應(yīng)承諾后，酌情處理 八作業(yè)提交 1. PBS指令 – 在腳本中以“ PBS”開頭 – PBS N jobname ? 可選設(shè)置，作業(yè)名 – PBS –S /bin/bash ? 指定 PBS的 Shell為 bash – PBS P project number ? 必需設(shè)置，作業(yè)項(xiàng)目號， P+９位數(shù)字 – PBS q queue ? 必須設(shè)置，隊(duì)列名， Regular, Economy, Longtime (注意 : 隊(duì)列名大小寫敏感 ) – PBS l nodes=N:ppn=M ? 必須設(shè)置， N:節(jié)點(diǎn)數(shù) , M:每個(gè)節(jié)點(diǎn)核數(shù) – PBS l walltime=hh:nn:mm ? 可選設(shè)置，墻鐘限制，不同隊(duì)列，墻鐘限制不一樣，最長２４小時(shí) 八作業(yè)提交 – PBS M me@eartch ? 可選設(shè)置，作業(yè)報(bào)告發(fā)送電子郵件地址 – PBS m bea ? 可選設(shè)置，作業(yè)報(bào)告發(fā)送狀態(tài)， b – 開始， e – 結(jié)束， a – 中止 – PBS –V ? 可選設(shè)置，復(fù)制用戶環(huán)境變量 – PBS o ? 可選設(shè)置，標(biāo)準(zhǔn)輸出輸出文件 – PBS e ? 可選設(shè)置，標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤輸出文件 注：注釋 PBS指令，在指令前再加一個(gè)“?！?，例如： PBS –V PBS指令也可以通過命令行方式提供，不放到腳本中，指令前不需要加“＃ PBS” 例如： qsub n helloworld P P123456789 l nodes=2:ppn=12 l walltime=00:05:00 q Regular 八作業(yè)提交 變 量 名 說 明 登陸 SHELL繼承來的變量 包括 $HOME， $LANG， $LOGNAME， $PATH， $MAIL， $SHELL和 $TZ。 $PBS_O_HOST qsub提交的節(jié)點(diǎn)名稱 $PBS_O_QUEUE qsub提交的作業(yè)的最初隊(duì)列名稱 $PBS_O_WORKDIR qsub提交的作業(yè)的絕對路徑 $PBS_JOBID 作業(yè)被 PBS系統(tǒng)指定的作業(yè)號 $PBS_JOBNAME 用戶指定的作業(yè)名 $PBS_NODEFILE PBS系統(tǒng)指定的作業(yè)運(yùn)行的節(jié)點(diǎn)名 $PBS_QUEUE PBS腳本在執(zhí)行時(shí)的隊(duì)列名 2. PBS的環(huán)境變量 八作業(yè)提交 ３ . 命令運(yùn)行方式 – MPI程序 mpirun n np – OpenMP程序 export OMP_NUM_THREADS = np ./ – 串行程序 ./ 八作業(yè)提交 示例一 MPI并行作業(yè)，使用兩個(gè)節(jié)點(diǎn)，每個(gè)節(jié)點(diǎn)１２個(gè)核 !/bin/bash PBS –S /bin/bash PBS N helloworld PBS P P123456789 PBS q queue Regular PBS l nodes=2:ppn=12 PBS l walltime=00:05:00 cd $PBS_O_WORKDIR nprocs=`cat $PBS_NODEFILE | wc l` mpirun np $nprocs ./ 八作業(yè)提交 示例二 串行作業(yè)，使用 1個(gè)節(jié)點(diǎn)，４個(gè)核運(yùn)行 4個(gè)任務(wù) !/bin/sh ? PBS l nodes=1:ppn=4 ? cd $WORK_DIR1 /usr/bin/time amp。 cd $WOR_DIR2 /usr/bin/time amp。 cd $WORK_DIR3 /usr/bin/time amp。 cd $WORK_DIR4 /usr/bin/time 八作業(yè)提交 示例三 關(guān)聯(lián)作業(yè) !/bin/bash job1=`qsub ` job2=`qsub W depen
環(huán)評公示相關(guān)推薦
鄂ICP備17016276號-1