生物信息ppt課件-閱讀頁(yè)
2025-01-29 23:50本頁(yè)面
【正文】 test 4. Train Model trained 5. Reselect 6. Repartition 8. Feature genes selection 9. Good trees selection Selection based on rules Ensemble process on the results Based on the new Parameter Zg m a xggggZ h f h??????Algorithm flow chart 18 feature ion channel genes were selected Gene ID Symbol Gene ID Symbol Gene ID Symbol 22 SLC17A8 85 CACNG1 313 P2RX7 27 KCNG1 119 KCNA3 325 SLC12A8 31 IRTA1 157 SLC17A2 360 CFTR 38 TPTE 200 KCNA10 456 KCND1 61 KCNV1 209 KCNK12 476 KCNJ10 70 NECAB2 227 TRPM5 533 No record Feature genes KCNG1 KCNJ10 CFTR 調(diào)控通路內(nèi)基因表達(dá)的相關(guān)性分析 ? 利用 7套你釀酒酵母基因芯片表達(dá)譜數(shù)據(jù)，分析研究了17條基因表達(dá)調(diào)控通路內(nèi)的基因在 mRNA表達(dá)水平上的相關(guān)性。 0123456781 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17pathway顯著數(shù)據(jù)數(shù)目面向個(gè)性化醫(yī)療的醫(yī)學(xué)生物學(xué)信息系統(tǒng) 個(gè)性化醫(yī)療系統(tǒng) 個(gè)性化給藥系統(tǒng) 個(gè)性化保健系統(tǒng) 個(gè)性化診斷系統(tǒng) 疾病再確認(rèn) 發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)分析 靶藥物選擇 虛擬治療及效果分析 … 網(wǎng)絡(luò)和本地?cái)?shù)據(jù)庫(kù) 分子 細(xì)胞 組織 系統(tǒng) 臨床醫(yī)學(xué) 數(shù)據(jù)庫(kù) 群體 數(shù)據(jù)庫(kù) 分子生物學(xué) 數(shù)據(jù)庫(kù) … 病人 序列分析 表達(dá)譜 分析 通路分析 智能化生物醫(yī)學(xué) 信息搜索引擎 醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)算法庫(kù) … 分子模擬 關(guān)鍵技術(shù) 數(shù)據(jù)庫(kù) 功能模塊 應(yīng)用模塊 科研論文數(shù)量和質(zhì)量 －新的飛躍 ?論文 100余篇（ SCI論文 20篇： EI論文 3篇） ?Xia Li, Shaoqi Rao,YadongWang. Gene Mining: A Novel and Powerful Ensemble Decision Approach to Hunting for Disease Genes Using Microarray Expression Profiling. Nucleic Acids Research, 2022 ( 影響因子： ) ?Li X， Rao S， Zhang T .An ensemble method for gene discovery based on DNA microarray data. SCIENCE IN CHINA (Series C) 2022； 34(2). ?Li X, Rao S, Moser KL, Elston RC, Olson JM, Guo Z, Zhang T: Geic mapping of plex discrete human diseases by discriminant analysis. Progress In Natural Science 2022, 12:431437. ?Li X, Rao S, Elston RC, Olson JM, Moser KL, Zhang T, Guo Z: Locating the genes underlying a simulated plex disease by discriminant analysis. Ge Epidemiol 2022, 21 Suppl 1:S516521. ?Guo Z, Li X, Rao S, Moser KL, Gong B, Shen G, Li L, Cannata R, Zirzow E, Topol EJ, Wang Q: Discriminant sibpair linkage analysis of longitudinal phenotypes. In: Geic Workshop 13, International Geic Epidemiology Society。 New Orleans, LA, USA ?Li X, Rao S, Moser KL, Elston RC, Olson JM, Guo Z, Zhang T: Sibpair Linkage Analysis of Complex Diseases via Pattern Recognition. In: Polygenic Diseases and Human HealthProceedings of the International Symposium for Mapping and Identification of Genes for Complex Traits. Changsa, China。 ? 宮濱生 ，李霞，郭政， SAGE遺傳分析系統(tǒng)的功能及應(yīng)用，中國(guó)優(yōu)生與遺傳雜志 2022－10－ 1 ? 王磊 ，郭政，李霞 , 屠康，徐建震，喻輝，宮濱生，互作蛋白質(zhì)對(duì)應(yīng)基因在 mRNA水平的表達(dá)相關(guān)性分析，哈爾濱醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào) ? 朱晶 ，郭政，李霞，宮濱生，屠康，喻輝，徐建震，編碼蛋白位于同一個(gè)信號(hào)傳導(dǎo)通路內(nèi)的基因表達(dá)相關(guān)性分析，哈爾濱醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào) ? 李傳星 , 調(diào)控通路內(nèi)基因表達(dá)的相關(guān)性分析，遺傳 ,2022. ? 王海蕓 ,李 霞 ,郭 政 ,張瑞杰 ,四種模式分類方法應(yīng)用于基因表達(dá)譜分析的比較研究 ,生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)雜志 ,2022 ? 徐娜 ，李霞，郭政，杜磊，李麗，功能驅(qū)使的基因表達(dá)相似性分析，哈爾濱醫(yī)科大學(xué)，2022， 37(6)183186. ? 李霞 ，張?zhí)镂模铥?，郭政，決策樹(shù)特征基因選擇方法對(duì) SVM有效性的研究 , 中國(guó)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)報(bào)； 2022, 23(1):6672 ? .李霞 ，張?zhí)镂模埥B奇，李麗，特征基因挖掘的決策森林方法，哈爾濱工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)，2022, 36(4). ? 郭政 ，張?zhí)镂?，李霞，屠康，喻輝，徐建震 ,王辰光 .利用 GeneHub軟件多角度分析基因功能相關(guān)與表達(dá)相關(guān)的聯(lián)系，生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)雜志．（已接受） ? 喻輝，郭政，李霞，屠康．與實(shí)驗(yàn)條件相關(guān)的基因功能模塊聚類分析方法．生物物理學(xué)報(bào)．（已接受） ? …… ?國(guó)家級(jí)刊物：
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