微生物分子生態(tài)學(xué)研究方法-閱讀頁(yè)
2025-01-28 23:11本頁(yè)面
【正文】 RITC)四甲基羅丹明異硫氰酸鹽熒光素 557 576 紅 Texas Red 德克薩斯紅 578 600 紅 Cy3 TM 550 570 橙 /紅 Cy5 TM 651 674 紅外 10 ?m ● Desulfotomaculum (DFMI227a ) ? % ● Methanosaeta (MX825) ? % 20 ?m ● Bacteria (EUB338 I/II/III) ? % ● Archaea (ARC915) ? % Fluorescence in situ hybridization (FISH) Microbial munity determined by Fluorescent InSitu Hybridization (FISH) ? universal ? gamma probe ? universal ? specific probe 1 ? specific probe 2 基于 16S rRNA基因的分類微陣列 －－ 高通量的分析微生物群落結(jié)構(gòu)，成為檢測(cè)復(fù)雜環(huán)境微生物群落結(jié)構(gòu)的重要工具。 分析復(fù)雜環(huán)境微生物群落結(jié)構(gòu)的方法的最近進(jìn)展： 未培養(yǎng)微生物資源的開(kāi)發(fā)： 任何微生物培養(yǎng)技術(shù)和培養(yǎng)基都不能完全再現(xiàn)全部微生物的自然生存環(huán)境，使用免培養(yǎng)技術(shù)和基因組技術(shù)，直接分離土壤系統(tǒng)中未培養(yǎng)微生物 DNA樣品并建立相應(yīng)的生態(tài)基因組庫(kù)，通過(guò)高通量篩選技術(shù)進(jìn)行大規(guī)模的新的重要功能基因的研究，鑒定參與污染物降解與轉(zhuǎn)化、各種抗酸、抗鹽、抗?jié)?、抗旱及抗（耐）重金屬毒害等抗逆特殊功能基因? 生 物 圈 種類豐富多樣的微生物 分離培養(yǎng) 大規(guī)模發(fā)酵培養(yǎng) 宏基因組篩選 獲得產(chǎn)物 通過(guò)構(gòu)建宏基因組表達(dá)文庫(kù)，通過(guò)基于序列或酶活力篩選文庫(kù)獲得目的基因。 進(jìn)展： 底物誘導(dǎo)基因表達(dá)篩選 。 Screening metagenomic expression libraries 針對(duì)未培養(yǎng)微生物的培養(yǎng)技術(shù)研究 微生物不可培養(yǎng)的原因 培養(yǎng)條件 營(yíng)養(yǎng)限制 失去生態(tài)位 模擬原位生態(tài)條件的培養(yǎng)技術(shù) 主體為一個(gè)墊圈，兩側(cè)用 ，允許環(huán)境中的化學(xué)物質(zhì)通過(guò)，但不允許細(xì)胞通過(guò)。 Isolating “Uncultivable” Microanisms in Pure Culture in a Simulated Natural Environment,T. Kaeberlein, K. Lewis,* S. S. Epstein*?, SCIENCE VOL 296 10 MAY 2022 Accessing the uncultivated microbial majority through cultivationbased approaches Science 2022 土壤宏基因組（ Metagenome）計(jì)劃 把所有緊密聯(lián)系在一起的土壤 生物的團(tuán)聚體理解為是一個(gè)“土壤細(xì)胞”，把這一特定的土壤功能單位內(nèi)全部生物遺傳物質(zhì)總和看成是一個(gè)基因組，即土壤宏基因組 , 通過(guò)宏基因組測(cè)序策略（ metagenomics sequencing strategy） ——隨機(jī)鳥(niǎo)槍法測(cè)序（ random shotgun sequencing）重建全基因組，通過(guò)整合生物信息學(xué)理論與方法（ JAZZ—全基因組鳥(niǎo)槍法匯編程序），從基因水平上重建土壤功能單位的能量流、代謝流和信息流，描繪土壤功能團(tuán)的藍(lán)圖，重新理解土壤的真正功能、微生物之間的共生、競(jìng)爭(zhēng)和代謝等復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)關(guān)系、揭開(kāi)土壤微生物群落的價(jià)值、揭示更高更復(fù)雜層次上的生命運(yùn)動(dòng)規(guī)律。 ? billion bps of nonredundant sequence generated, annotated, and analyzed ?derive from at least 1800 genomic species , including 148 previously unknown bacterial phylotypes. ? identified over million previously unknown genes, including more than 782 new rhodopsinlike photoreceptors 百慕大群島附近海水微生物群落基因組的 ，包含了至少1800細(xì)菌種類的基因組， 148個(gè)以前未報(bào)道過(guò)的細(xì)菌類型，并鑒定了 120萬(wàn)個(gè)未報(bào)道的基因（ Science， 2022）
教學(xué)課件相關(guān)推薦
鄂ICP備17016276號(hào)-1