浪潮集群系統(tǒng)使用規(guī)范-浪潮培訓(xùn)教材-展示頁
2025-03-21 20:59本頁面
【正文】 /opt/issp2/g03 $FILENAME 22 作業(yè)腳本注意事項(xiàng) 為減少資源消耗，系統(tǒng)配置采用 autofs， 20分鐘無操作，即會(huì)卸載目錄，因此，在腳本中，需使用絕對(duì)路徑，保證任務(wù)可以正常運(yùn)行 作業(yè)腳本參考 VASP Wien2k g03 castep dmol3 espresso Inspur group 四：計(jì)算任務(wù)投放 23 Inspur group 提交作業(yè) 查詢作業(yè) (1) 四：計(jì)算任務(wù)投放 作業(yè)管理 24 查詢作業(yè) (2) Inspur group 查詢作業(yè) (3) 作業(yè)管理 四：計(jì)算任務(wù)投放 25 刪除作業(yè) Inspur group 作業(yè)管理 四：計(jì)算任務(wù)投放 26 五：存儲(chǔ)空間使用 1. 系統(tǒng)使用 lustre并行文件系統(tǒng)提高 I/O性能，作為工作目錄，由于其承載壓力較大，容易出現(xiàn)硬盤故障，因此，該目錄只存放計(jì)算中的臨時(shí)文件，請(qǐng)及時(shí)將結(jié)果文件備份回屬主目錄中。 pbs mom:是一個(gè)守護(hù)進(jìn)程，從 pbs server處接收作業(yè)后放入其執(zhí)行隊(duì)列中等待執(zhí)行。 Inspur group 11 PBS基本組件 pbs mand:用于提交、監(jiān)視、修改和刪除作業(yè)。 7. 刀片節(jié)點(diǎn)單個(gè)任務(wù)不能超過 24GB內(nèi)存。 5. 不能在屬主目錄（登陸目錄）下存放任務(wù)臨時(shí)文件，必須在工作目（ lustre）錄中存放臨時(shí)文件。臨時(shí)性文件存放不要超過三個(gè)月。 3. 計(jì)算任務(wù)提交后，應(yīng)注意定時(shí)查看自己任務(wù)狀態(tài)，當(dāng)需要?dú)⑺雷约哼M(jìn)程或刪除任務(wù)時(shí)，以用 qdel命令 , 如果無法刪除必要時(shí)聯(lián)系主機(jī)組協(xié)助。 Inspur group 10 四：計(jì)算任務(wù)投放 ，請(qǐng)務(wù)必先檢測提交程序的正確性以及資源占用的合理適度，通過小批量測試數(shù)據(jù)預(yù)估占用 CPU、內(nèi)存和存儲(chǔ)資源，強(qiáng)烈建議進(jìn)行代碼優(yōu)化以減少 CPU、內(nèi)存、 I/O資源占用，及時(shí)釋放申請(qǐng)的內(nèi)存，優(yōu)化文件目錄讀寫訪問等 I/O功能，避免資源和計(jì)算時(shí)間的浪費(fèi)。異常或較大的文件并作相應(yīng)清理。 Inspur group 8 登陸天梭集群系統(tǒng) ssh l (your count) 第一次登陸設(shè)置環(huán)境變量 vi ~/.bashrc source /opt/intel/impi/ source /opt/intel/cce/ source /opt/intel/fce/ source /opt/intel/mkl/ 保存退出后 source ~/.bashrc 使用命令 du kh | sort n ，查看異常或較大的文件 1/20/2023 Inspur group 二：登錄、退出系統(tǒng)連接 9 三：屬主目錄使用 1. 屬主目錄為登錄后缺省進(jìn)入的目錄： /home/研究室 /yourid 2. 屬主目錄用于系統(tǒng)存放管理用戶的登陸和所使用軟件配置文件，嚴(yán)禁用戶隨意存放執(zhí)行程序的臨時(shí)文件和非相關(guān)的文件，避免占用和耗費(fèi)寶貴的系統(tǒng)存儲(chǔ)資源，影響登陸連接服務(wù)。 Inspur group 6 二：登錄、退出系統(tǒng)連接 1. 登錄方式 SSH： 缺省提供，該登錄方式有一定強(qiáng)度的加密安全保證 軟件可以使用 Putty等 2. 文件上傳與下載 SFTP： 缺省提供，暫不提供 FTP方式 軟件可以使用 SecureFX、 WinSCP等 3. 登錄系統(tǒng)后的必要操作 使用 mail命令，檢查系統(tǒng)發(fā)送給用戶的通知和信息 在屬主目錄下使用命令 du kh | sort n ，查看異?；蜉^大的文件，并做相應(yīng)的清理 Inspur group 7 二：登錄、退出系統(tǒng)連接 4. 長時(shí)間誤操作，請(qǐng)結(jié)束訪問，避免占用系統(tǒng)資源 5. 結(jié)束系統(tǒng)訪問必要操作 非停電、斷網(wǎng)等意外設(shè)備故障導(dǎo)致，嚴(yán)禁在終端上直接關(guān)閉訪問窗口或直接關(guān)閉終端電源實(shí)現(xiàn)結(jié)束系統(tǒng)訪問。 8. 個(gè)人賬號(hào)只限個(gè)人使用，嚴(yán)禁將帳號(hào)和密碼泄露給外單位和項(xiàng)目組外人員，公共組賬號(hào)由管理員負(fù)責(zé)控制和使用分發(fā)。 6. 注銷賬號(hào)時(shí)請(qǐng)整理好用此賬號(hào)建立的所有數(shù)據(jù)，做好移交及備份清理工作，并至少提前一天通知管理員。 4. 人員發(fā)生調(diào)動(dòng)時(shí)，請(qǐng)調(diào)動(dòng)人員做好數(shù)據(jù)移交，并及時(shí)通知管理員申請(qǐng)權(quán)限改動(dòng)。管理員聯(lián)系方式見本指南維護(hù)人員聯(lián)系方式。中國科學(xué)院合肥分院 浪潮集群使用規(guī)范 Inspur
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