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新型蛋白質結構分析手段-氫氘交換質譜技術進展-展示頁

2024-08-19 16:57本頁面
  

【正文】 pid Commun. Mass Spectrom. 1991, 5, 214–217(7) Chakraborty K, Chatila M, Sinha J, et al. Chaperonincatalyzed rescue of kinetically trapped states in protein folding. Cell. 2010 Jul 9。 沃特世的nanoACQUITY UPLC HDExchange System為氫氘交換質譜實驗提供了前所未有的簡易的解決方案,強有力地推動了氫氘交換技術在蛋白質結構及動態(tài)變化研究、蛋白質相互作用位點發(fā)現(xiàn)、蛋白表位以及活性位點鑒定方面的應用,正在成為眾多結構生物學科學家和生物制藥企業(yè)必不可少的工作平臺。SYNPAT質譜提供的ETD(電子轉移解離)碎裂模式可以避免氘原子重排造成的信息混亂,并具有良好的碎裂信號[16]。 在某些特殊研究中,要求對蛋白氫氘交換位點做到精確到氨基酸的測量,這是氫氘交換質譜研究的又一個難點。沃特世氫氘交換質譜解決方案所提供的DynamX軟件可以為科學家提供簡便直觀的分析結果,并包含多種呈現(xiàn)方式。 實現(xiàn)氫氘交換質譜技術的第四個關鍵點,是如何高效分析實驗產生的多時間點及多次重復帶來的大量數(shù)據(jù)。除氫氘交換技術外,SYNAPT質譜系統(tǒng)在蛋白質復合體結構研究中也是獨具特色,已有多篇高質量應用文獻發(fā)表[13,14,15]。因此這種SYNPAT獨有的被命名為HDMSE的質譜分析技術可以將因質荷比相同而重疊的多肽分離開,輕而易舉地解決了質譜信號疊加的問題,得到準確的交換率數(shù)據(jù)[11,12](圖2)。質譜平臺還具備根據(jù)離子大小及形態(tài)進行分離的功能(行波離子淌度分離)。但是,這個看似不可能完成的任務卻被沃特世 nanoACQUITY UPLC HDExchange System攻克了。因為交換率判斷需要通過對發(fā)生交換的多肽進行定量,毫無疑問因疊加的而混亂的質譜數(shù)據(jù)將極大的影響對質譜峰的準確定量。因此,這些質譜峰可能與哪些未發(fā)生交換反應的多肽質譜峰逐漸疊加、相互覆蓋。nanoACQUITY UPLC HDExchange System完全通過智能機械臂,精確完成交換、終止交換、進樣、酶切等一系列實驗過程,而且始終保證各個步驟所需不同的溫度環(huán)境。再考慮到重復實驗的需求,人工手動操作會對最終數(shù)據(jù)可信度產生影響。在實驗中一般需要采集0s、10s、1min、10min、60min、240min等多個時間點的數(shù)據(jù)。因此UPLC可以做到在不損失色譜分離效果的要求下,極大縮短液相分析時間的要求[9]。沃特世UPLC174。 氫氘交換實驗中的回交現(xiàn)象將嚴重影響實驗數(shù)據(jù)的可信度,甚至導致錯誤結果的產生。除科研需求外,沃特世氫氘交換質譜系統(tǒng)也受到眾多
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