srrna應(yīng)用的復(fù)興-展示頁(yè)
2025-07-26 17:23本頁(yè)面
【正文】 ? 元基因組是對(duì)一個(gè)群落的功能研究： 使用高通量的鳥(niǎo)槍法測(cè)序 優(yōu)點(diǎn)： 隨機(jī)抽樣存在于一個(gè)棲息地的 所有基因 而不只是 16srRNA ，因而提供了對(duì)一個(gè)群落的功能研究，而不只是對(duì)它的種系發(fā)育的總結(jié)。 提供一個(gè)客觀的系統(tǒng)發(fā)生的框架，并在這個(gè)框架中分類(lèi)細(xì)胞生物等級(jí)。 16srRNA及元基因組法的對(duì)比 ? 16srRNA具有不尋常的特征 特征 普遍存在性，末端序列守恒，具有一個(gè)進(jìn)化速率變化的區(qū)結(jié)構(gòu)。 ? 16srRNA應(yīng)用復(fù)興得益于以下技術(shù)的發(fā)展： 更高的分辨率（可發(fā)現(xiàn)更多的序列） 可對(duì)多重樣本分析（ 例如跨空間及跨時(shí)間樣本 ）。 元基因組：指環(huán)境樣品中的細(xì)菌和真菌的基因組總和。16SrRNA應(yīng)用的復(fù)興 李軍建 10808039 摘要 ? 16srRNA的研究已經(jīng)成為了描述細(xì)菌菌落結(jié)構(gòu)特征的重要依據(jù)。 ? 一種更好的方法：元基因組法。 優(yōu)點(diǎn)：提供了對(duì)群落功能潛力的全面觀察，而不只是一個(gè)菌落的詳細(xì)記錄。 對(duì)元數(shù)據(jù)的改良，及對(duì)元數(shù)據(jù)的使用。 在微生物進(jìn)化和生態(tài)學(xué)研究中的作用地位： 第一，完全改變了進(jìn)化的觀點(diǎn)。 第二，通過(guò)對(duì)直接來(lái)自環(huán)境中的 16srRNA的克隆和測(cè)序，證明了微生物的差異遠(yuǎn)比我們以前基于培養(yǎng)研究的差異要廣泛的多。 ? 結(jié)論： 第一步：應(yīng)用經(jīng)典的 16srRNA對(duì)群落成分進(jìn)行描述（在很大程度上決定了將要使用的測(cè)序技術(shù)及序列必需的數(shù)量 ） 第二步：元基因組分析 ? 16sRNA序列分析的數(shù)據(jù)產(chǎn)生和數(shù)據(jù)分析 測(cè)序產(chǎn)生數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)分析 數(shù)據(jù)產(chǎn)生 ? 測(cè)序技術(shù)： lower Sanger測(cè)序法， 454 pyrosequencing測(cè)序法及 Ph
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