動物基因組學基礎ppt課件-展示頁
2025-01-26 16:25本頁面
【正文】 鑒別的標記 (marker) ?遺傳標記（ Geic Markers）：是指能夠用以區(qū)別生物個體或群體及其特定基因型，并能穩(wěn)定遺傳的物質(zhì)標志 ?基因標記： 用基因作為標記，分析各基因間的連鎖關(guān)系及遺傳距離，繪制出連鎖遺傳圖譜 ?DNA標記： RFLP、 SSLP、 SNPs等 ?包括形態(tài)標記、細胞學標記、生化標記、 DNA分子標記 形態(tài)標記 ? 形態(tài)性狀：株高、顏色、白化癥等 ? 又稱表型標記 ? 數(shù)量少 ? 很多突變是致死的 ? 受環(huán)境、生育期等因素的影響 ? 最早建立的果蠅連鎖圖，就是利用控制果蠅眼睛的形狀、顏色，軀體的顏色、翅膀的形狀等形態(tài)性狀作為標記，分析它們連鎖關(guān)系及遺傳距離，繪制而成的 ? 控制性狀的其實是基因，所以形態(tài)標記實質(zhì)上就是基因標記 果蠅連鎖圖 細胞學標記 ?明確顯示遺傳多態(tài)性的 染色體結(jié)構(gòu)特征和數(shù)量特征 染色體的核型 染色體的帶型 染色體的結(jié)構(gòu)變異 染色體的數(shù)目變異 ?優(yōu)點：不受環(huán)境影響 ?缺點：數(shù)量少、費力、費時、對生物體的生長發(fā)育不利 生化標記 ?又稱蛋白質(zhì)標記 ，就是利用蛋白質(zhì)的多態(tài)性作為遺傳標記 如：同工酶、等位酶 ?優(yōu)點：數(shù)量較多，受環(huán)境影響小 ?缺點：受發(fā)育時間的影響、有組織特異性、只反映基因編碼區(qū)的信息 DNA分子標記 簡稱分子標記，以 DNA序列的多態(tài)性作為遺傳標記 優(yōu)點： ? 不受時間和環(huán)境的限制 ? 遍布整個基因組，數(shù)量無限 ? 不影響性狀表達 ? 自然存在的變異豐富，多態(tài)性好 ? 共顯性，能鑒別純合體和雜合體 理想的分子遺傳標記應具備的特點 ?遺傳多態(tài)性高 ?檢測手段簡單快捷 ?易于實現(xiàn)自動化 ?遺傳共顯性 第一代 DNA遺傳標記 （ restriction fragment length polymorphism， RFLP） ? 最早的 DNA標記 ? 限制性酶切位點：被特定的內(nèi)切酶所識別的 4個或更多個堿基組成的特異性序列 ? DNA序列能或不能被某一酶酶切 ， 相當于一對等位基因的差異 ? 可將 RFLP作為標記 ， 定位在基因組中某一位置上 ? 人類基因組中有 105個 RFLP位點 ， 每一位點只有兩個等位基因 RFLP 分析過程 RFLP 分析結(jié)果 RFLP 標記的特點 ? 可靠 —— 重現(xiàn)性好 ? 目的序列已知時才能檢測 ? 操作復雜 —— 自動化程度低 ? 耗時長 —— 至少需要 2天，通常 37天 ? 多態(tài)信息含量低 PCRRFLP PCR 電 泳 酶 切 基因型 ? 基因組中存在大量重復序列 ? 重復單位長度在 1565個核苷酸左右的小衛(wèi)星DNA ? 在酶切片段里邊核心序列重復次數(shù)不同導致酶切片段長度的差異 ? 又稱為 DNA指紋 ? 與 RFLP 分析方法類似，利用探針雜交檢測 ? 區(qū)別在于酶切位點不在可變重復區(qū)，而在側(cè)翼區(qū) VNTR 分析過程 VNTR 檢測結(jié)果 VNTR 標記的特點 ? 多態(tài)性檢測率高 —— 一個探針可以檢測出十幾個甚至幾十個位點的多態(tài)信息 ? 位點呈共顯性遺傳 ? 個體具有高度特異性 ? 技術(shù)復雜，實驗成本高 ? 有時譜帶過于復雜，難于分辨 VNTR 應用 ? 計算遺傳距離 ? 雜種優(yōu)勢預測 ? 親子鑒定 1/10000 (% likely) ? 法醫(yī)鑒定 1/10,000,000 第二代 DNA遺傳標記 （ short tandem repeat ,STR） ? 重復單位長度在 26個核苷酸之間的微衛(wèi)星 DNA（ microsatellite DNA） ， 又稱為簡短串聯(lián)重復 （ SSR 、 STRP 或 SSLP ， short sequence repeat polymorphism 或者 simple sequence length polymorphism） ? STR有兩個最突出的優(yōu)點 ， 即作為遺傳標記的“ 多態(tài)性 ” 與 “ 高頻率 ” ? 如一條染色體 TCTGAGAGAGACGC 另一染色體 TCTGAGAGAGAGAGAGAGACGC， 就構(gòu)成了多態(tài)性 STR 標記檢測方法 ? 需要根據(jù)保守的側(cè)翼序列設計特異性擴增引物 ? PCR 反應擴增 STR 區(qū)域 ? PCR產(chǎn)物用變性聚丙烯酰胺膠分離 ? 不同的核心序列重復數(shù)導致不同長度的 PCR產(chǎn)物 STR 標記特點 ? 核心重復單位為 2 6 個堿基 ? 在基因組中分布更加廣泛均勻 ? 多態(tài)信息含量豐富 ? 呈共顯性遺傳 ? 穩(wěn)定性好，分析技術(shù)易于自動化 ? 比 Southern雜法更快捷 ? DNA用量少 ? 甚至部分降解的樣品也可用于檢測 ? 易受基因組污染的影響 ? 必須事先了解側(cè)翼序列才能設計引物
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