biolink軟件試用版使用說明手冊-文庫吧資料
2025-07-01 06:05本頁面
【正文】 真核細胞。 motif at: 3 Uncleavable? Ipos set to: 13 Discrimination of mitochondrial target seq.: Count: 預測的跨膜區(qū)數 modified ALOM score: 通常，只有細胞質膜蛋白有疏水性跨膜區(qū)，因此可作為分類信號。 count: 0 value: threshold: calculated from 1 除的可能性越高。 Signal Score () 為正值，且分值越高意味著信號肽序列被切 Discriminant Score為正值，分值越一些膜蛋 Discriminant Score: Peak Value of UR: MCG: 識別信號肽 未進行更改 Lipop: 脂蛋白分析 2）Step 1 輸入：氨基酸序列。輸入一條蛋白質序列和它的來源（如動物或酵母），PSORT會根據已知蛋 白信號肽等特征分析出輸入序列在細胞中的定位及相關信息。 功能：預測蛋白質在細胞內定位。 參數：For ORF longer than 300bp限定開放閱讀框的下限值為300bp（過短的ORF不太可能翻譯成蛋白）。輸入：DNA序列。一個開放閱讀框（ORF）是指一個起始和終止密碼子之間的序列。在原核基因中，編碼區(qū)是一個單獨的ORF；而真核基因的編碼區(qū)通常包含幾個不相連的ORF（被非編碼序列，即內含子所分隔）。 5. 開放閱讀框（ORF） 功能：識別基因編碼區(qū)。 c、按照酶的先后順序排列出所有的酶切位置。 a、所有查找到的酶的位置； 輸出：其輸出結果的窗口包含3個部分： 輸入：DNA序列。Flat Queryanchored without identities。Queryanchored without identities：不按照特征做固定查詢。 參數：比對的顯示方法：pairwise：標準的BLAST對其方式，查詢序列于數據庫序列一一對應。（注：可以有兩種形式：一種是FASTA格式的序列，一種是gi號。先將核酸序列翻譯成蛋白序列（一條核酸序列會被翻譯成可能的六條蛋白），再對每一條作一對一的蛋白序列比對。由于這種比對的復雜性，因此ＴＢＬＡＳＴＸ在比對中對缺口不予以考慮。4. ＴＢＬＡＳＴＸ是核酸序列到核酸庫中的一種查詢。3. ＴＢＬＡＳＴＮ是蛋白序列到核酸庫中的一種查詢。2. ＢＬＡＳＴＰ是蛋白序列到蛋白庫中的一種查詢。共有五種ＢＬＡＳＴ：1. ＢＬＡＳＴＮ是核酸序列到核酸庫中的一種查詢。也可選擇多個數據庫但數據庫必須是同一類型的,即要么都是蛋白數據庫要么都是核酸數據庫。,已將有缺口的比對序列也考慮在內了。同時還能發(fā)現具有缺口的可能比對上的序列。 轉角和螺旋卷曲 alpha折疊 輸出： o 一定pH值時蛋白序列所帶的凈電荷數列表（） o 計算所得的等電點參數：無2. 蛋白質二級結構預測（SSCP）： 功能:此軟件用于蛋白質二級結構，即雙螺旋結構的分析預測。本程序在假設不存在離子之間相互作用而改變離子化傾向的前提下，從蛋白質的氨基酸組成來計算等電點。根據氨基酸側鏈的電荷數，就能夠計算出給定pH值下，蛋白質所帶電荷的理論值（將氨基酸側鏈的電荷與氨基端和羧基端的電荷相加求和）。分析工具使用說明： 1. 等電點分析 功能：計算蛋白質的等電點。 結果文件處理：在輸出窗口中，用戶可以選擇左邊的功能按鈕對結果文件進行處理。選中文件名字，單擊顯示按鈕或雙擊該文件就可以查閱結果了。工具使用說明 五、 幫助 幫助: a) 單擊“幫助”菜單中的“幫助”命令獲取幫助信息。四、 窗口 輸出窗口: a) 單擊“窗口”菜單中的“輸出窗口”命令，彈出“結果輸出窗口”。 引物設計： i) 選中要進行分析的序列，單擊“功能”菜單中的“引物設計”命令，進行引物設計分析。DAS： h) 選中要進行分析的序列，單擊“功能”菜單中的“DAS”命令，進行DAS分析。理化性質： g) 選中要進行分析的序列，單擊“功能”菜單中的“理化性質”命令，進行理化性質分析。PSORT： f) 選中要進行分析的序列，單擊“功能”菜單中的“PSORT”命令，進行PSORT分析。 ORF： e) 選中要進行分析的序列，單擊“功能”菜單中的“ORF”命令，進行ORF分析。酶切圖譜： d) 選中要進行分析的序列，單擊“功能”菜單中的“酶切圖譜”命令，進行酶切圖譜分析。 BLAST： c) 選中要進行分析的序列，單擊“功能”菜單中的“BLAST”命令，進行BLAST分析。SSCP： b) 選中要進行分析的序列，單擊“功能”菜單中的“SSCP”命令，進行SSCP分析。按“是”，則彈出“分析結果”窗口，如下圖：按“否”，則不查看結果。等電點分析： a) 選中要進行分析的序列，單擊“功能”菜單中的“等電點分析”命令，進行等電點分析。粘貼： ☉ 在要放入信息的編輯欄中，單擊要放入信息的位置 ☉ 單擊“編輯”菜單中的“粘貼”命令，把剪貼板中的內容插入當前位置。 復制： ☉ 選擇要編輯的序列的某一段。 剪切： ☉ 選中要編輯的序列的某一段。二、 編輯菜單：是對序列文件進行相關的操作 撤銷： ☉ 單擊“編輯”菜單中的“撤銷”命令，撤消上一步的操作。按“取消“，取消該操作。系統會彈出確認窗口要求確認刪除。保存序列： o 單擊“文件”菜單中的“保存序列”命令，保存當前選擇的序列。 167。167。 167。當選擇的是NCBI數據庫時，可以設置符合查詢條件的返回記錄數，該數值的大小決定了查詢速度的快慢 167。 167。彈出窗口如下：167。如下圖：o 從網絡添加： 167。 167。 167。導入序列： o 從文件添加： 167。如
醫(yī)療健康相關推薦
鄂ICP備17016276號-1