差異表達基因分析ppt課件-文庫吧資料
2025-05-09 22:35本頁面
【正文】 因為個別值的缺失而刪除整個記錄，可能丟失大量有價值的信息 填充或修補缺失數(shù)據(jù) 缺失數(shù)據(jù)的處理 固定值法，比如 0或者 1 行平均法 使用重復數(shù)據(jù)點對缺失數(shù)據(jù)進行填充。 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換和標準化 數(shù)據(jù)變換的目的是在盡量保證原始數(shù)據(jù)特征不變的前提下，使變換后的數(shù)據(jù)更適于進行統(tǒng)計分析?？梢酝ㄟ^計算原始數(shù)據(jù)的均數(shù)和標準差，去除位于給定區(qū)間外的數(shù)據(jù)（如均數(shù)加減 3個標準差外的數(shù)據(jù)）。然而，使用一個集中趨勢指標代替一組數(shù)值意味著信息的丟失，因此數(shù)據(jù)的合并應(yīng)謹慎。Treeview軟件 Genesis軟件 預分析（ PreAnalysis） 重復值合并（ replicate handling ） 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換和標準化（ data transformation and standardization） 缺失數(shù)據(jù)處理（ missing value management ） 基因篩選（ pattern selection） 重復值合并 基因不同命名 重復值合并 Gene ID converter 重復值合并 在特定條件下把所有的重復值合并成一個數(shù)值可能更為方便，而這一個值是給定基因 /條件的代表。 oligonucleotide arrays) sam/ref 基因表達數(shù)據(jù)矩陣 (glass slides) 數(shù)據(jù)矩陣具體形式 數(shù)據(jù)形式 數(shù)據(jù)矩陣 ,基因數(shù)遠大于樣品數(shù) 對任意一個基因來說 ,樣本值是特征值 ,數(shù)據(jù)的維數(shù)是 M 對任意一個樣本來說 ,基因值是特征值 ,數(shù)據(jù)的維數(shù)是 N 聚類時考慮基因之間的相似性，從數(shù)學上講就是看對應(yīng)的 M維數(shù)據(jù)之間的相似性 Clusteramp。為了達到這個目的，統(tǒng)計學家們常常用控制錯誤發(fā)現(xiàn)率（ False Discovery Rate）的方法來判斷差異基因。 單通道寡核苷酸芯片差異基因（兩個樣本直接比較） Affymetrix， illumina芯片由于有探針重復，可以利用統(tǒng)計方法計算出一個統(tǒng)計性的 P值或者 score值，篩選差異表達基因 不同類樣本差異基因識別 評價一組數(shù)的統(tǒng)計量 平均值 標
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