原核生物基因組島的建模與識別-文庫吧資料
2024-10-19 21:04本頁面
【正文】 酶和轉(zhuǎn)座酶 。利用統(tǒng)計學以及機器學習技術(shù)改進基因組島識別的系統(tǒng)的可操作性很強，在我們的研究時段內(nèi)可以順利完成。 擬解決的關(guān)鍵問題 (準確性 )評價 全基因組序列數(shù)據(jù) Zcurve 處理數(shù)據(jù) 比較基因組法 初步識別 基因組島 第一階段 系統(tǒng)發(fā)育 進化關(guān)系 第二階段 第三階段 第 四 階段 實驗路線流程圖 待分析序列 建立隱馬氏模型 （ HMM） 提取特征參數(shù) 基因組島區(qū)域 第一階段 第二階段 第三階段第 四 階段最終優(yōu)化方案 MYSQL數(shù)據(jù)庫 編程實現(xiàn)整個系統(tǒng) 第一階段第二階段第三階段第 四 階段 基因組島區(qū)域 準確性判斷模型 是否達到預設(shè)閥值？ 返回修改模型參數(shù) 最終優(yōu)化方案 第一階段 第二階段 第三階段 第 四 階段 是 否 實驗 的可行性分析 1 全基因組測序計劃的實行，使我們通過互聯(lián)網(wǎng)即可擁有可靠的已測序的全基因組數(shù)據(jù)來源，如 GenBank數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng)：WEB程序及具體的數(shù)據(jù)、地址可在有關(guān)資料上找到，這給了我們開發(fā)相關(guān)程序很好的參考。 3. 設(shè)計評價指標來評價所設(shè)計的系統(tǒng) ,檢驗算法于模型的有效性及實用性 。 2. 用統(tǒng)計分析的方法研究基因組島邊緣序列的結(jié)構(gòu)特征及其局部區(qū)域相關(guān)關(guān)系 ， 建立起更準確的識別基因組島的馬爾可夫識別模型 。 FEMS Microbiology Reviews Vol. 33, 2 Pages: 376393 . 背景介紹 1 研究計劃 2 項目創(chuàng)新點 3 其它說明 4 . 研究 目標 研究內(nèi)容 研究進度 實驗路線 可行性分析 預實驗結(jié)果 項目的研究目標 通過整合統(tǒng)計學、機器學習、比較基因組學等方法，設(shè)計并實現(xiàn)一個有較好性能的原核生物基因組島識別分析系統(tǒng)。 由于它具有驚人的迅速獲得抗藥性的能力 ,目前已對多種抗菌藥物表現(xiàn)耐藥 。 它亦是引致皮膚炎的其中一種細菌 。 銅綠假單胞菌 原稱綠膿桿菌 ,有復雜的耐藥機制 ， 影響肺部及泌尿道 ， 造成燒傷 、 傷口及血液感染 ， 如敗血病 ； 亦會造成肺炎 。 幽門螺桿菌 Helicobacter pylori 革蘭氏陰性菌，幽門螺桿菌是人
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