蛋白折疊及折疊中間體的素材-資料下載頁
2025-10-26 05:25本頁面
【正文】 249。c232。)開展趨勢,更高的預(yù)測精度〔大于 60%－70%〕 更加自動化的預(yù)測，盡量減少人為(r233。nw233。i)的干預(yù) 與其他方法相結(jié)合,第五十三頁，共六十四頁。,54,4 我們(wǒ men)的思路－雞尾酒方法 〔Semi ab initio 方法〕,分子動力學(xué)模擬 優(yōu)點：實時。 良好的理論根底 缺點(quēdiǎn)：計算本錢高。 精確度不夠高 基于模型的方法 優(yōu)點：計算速度快。 精確度高 缺點：不實時。 物理圖像不夠明確,第五十四頁，共六十四頁。,55,Semi ab initio 方法(fāngfǎ),局部細節(jié)〔線段、原子尺度〕 分子動力學(xué)方法 全局結(jié)構(gòu) 基于模型的方法，以及基于知識庫，或基于機器學(xué)習(xí)(xu233。x237。)的方法 通過比照不同尺度與細節(jié)的信息，力爭找到一類有較強理論根底的預(yù)測方法,第五十五頁，共六十四頁。,56,Semi ab initio 方法(fāngfǎ),特點: 快速 高精度 尺度分辨 實時 更扎實的理論(lǐl249。n)根底,第五十六頁，共六十四頁。,57,研究(y225。njiū)的難點,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)理論研究是一個(yī ɡ232。)跨越多學(xué)科的綜合性研究課題。不同學(xué)科之間的溝通和知識共享成為現(xiàn)實上的難題。 該領(lǐng)域的許多先進的算法〔GenTHREADER, BioInBgu, SAMT02 等〕往往來源于數(shù)種已有算法的綜合。不斷的重寫代碼提高了研究本錢，降低了代碼可信度。,第五十七頁，共六十四頁。,58,5 虛擬(xūnǐ)實驗室〔Wet Lab〕,. he draws inspiration from how scientists mapped the human genome. It was not, he notes, because of new technology but because the scientific community organized itself differently and allowed machines to take over most of the mechanical work . Richard Morais wrote this sentence in his interview of Peter Goodfellow, Senior Vice President, Discovery Research of Glaxo Smith Kline,第五十八頁，共六十四頁。,59,Wet Lab 能夠(n233。ngg242。u)提供,蛋白質(zhì)分子實時(sh237。 sh237。)仿真器 信息交流和存儲的平臺 統(tǒng)一的表達方式 統(tǒng)一的存儲方式 有效的溝通方式 可重用的組件庫 方便成果共享 縮短新方法的研究周期,第五十九頁，共六十四頁。,60,我們(wǒ men)的目標(biāo),為 Wet Lab 提供蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模擬和預(yù)測算法引擎 和其他領(lǐng)域的專家合作，提供相關(guān)算法的組件(zǔ ji224。n)庫 以 Wet Lab 為平臺，研究新的算法，獲取新的知識 利用新的算法和知識研究蛋白質(zhì)動力學(xué)，改進藥物設(shè)計,第六十頁，共六十四頁。,61,致 謝,謝謝大家(d224。jiā) 感謝會議的組織者和參與者,第六十一頁，共六十四頁。,人有了知識，就會具備各種(ɡ232。 zhǒnɡ)分析能力， 明辨是非的能力。 所以我們要勤懇讀書，廣泛閱讀， 古人說“書中自有黃金屋。 〞通過閱讀科技書籍，我們能豐富知識， 培養(yǎng)邏輯思維能力； 通過閱讀文學(xué)作品，我們能提高文學(xué)鑒賞水平， 培養(yǎng)文學(xué)情趣； 通過閱讀報刊，我們能增長見識，擴大自己的知識面。 有許多書籍還能培養(yǎng)我們的道德情操， 給我們巨大的精神力量， 鼓舞我們前進。,第六十二頁，共六十四頁。,第六十三頁，共六十四頁。,內(nèi)容(n232。ir243。ng)總結(jié),王 琦 吳 韜。目前，對一定氨基酸序列的多肽鏈折疊形成特定空間結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的機制了解甚少。幫助我們發(fā)現(xiàn)新藥物和改進藥物的設(shè)計。PoissonBoltzmann 靜電模型提供了一個較快又較簡單的自由能模擬方法，這種情況下靜電相互作用是主要的。MD 模擬正在引導(dǎo)我們對酶的生物活性有一個更深入的了解。可以獲取核酸序列以及各種溶劑條件(ti225。oji224。n)對結(jié)構(gòu)和分子的運動的影響信息。不斷的重寫代碼提高了研究本錢，降低了代碼可信度,第六十四頁，共六十四頁
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