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常用實驗室儀器使用方法-資料下載頁

2025-10-12 09:21本頁面
  

【正文】 那些含有被轉(zhuǎn)化質(zhì)粒的細胞才能生存并生長增殖。從而可以篩選出哪個克隆含有質(zhì)粒。 JM109菌株為受體細胞,受體菌使其處于感受態(tài),然后與pUC18質(zhì)粒共保溫實現(xiàn)轉(zhuǎn)化。將經(jīng)過轉(zhuǎn)化后的全部受體細胞進行適當稀釋,在含有氨卞青霉素的平板培養(yǎng)基上培養(yǎng),只有轉(zhuǎn)化體才能存活,化的受體細胞則因無抵抗氨卞青霉素的能力而死亡。轉(zhuǎn)化子經(jīng)過擴增后,可將轉(zhuǎn)入的質(zhì)粒DNA分離提取出來,用于電泳分析、限制性內(nèi)切酶圖譜的制作以及二、儀器及試劑:恒溫搖床、電熱恒溫培養(yǎng)箱、電熱恒溫水浴鍋、超凈工作臺、分光光度計、高速冷凍離心機、臺式離心機。 JM109受體菌、質(zhì)粒pUC18。:LB培養(yǎng)液(1L):胰蛋白胨10g酵母粉5gNaCl10g(高鹽)或氨芐青霉素(Ampicillin)100mg/ml用CaCl2處理而未有轉(zhuǎn)DNA測序等實驗。5g(低鹽)在三角瓶中將胰蛋白胨 10g,酵母粉 5g以及 NaCl 5g溶于1L的重蒸水中并高壓滅菌。待冷卻至55℃, 100mg/ml 的氨芐青霉素。然后貯存于4℃?zhèn)溆?。LB平板培養(yǎng)基:胰蛋白胨10g酵母粉5gNaCl10g瓊脂13g在三角瓶中依次將上述配方加入1L的重蒸水中并高壓滅菌。待培養(yǎng)基降溫至養(yǎng)基并輕輕旋轉(zhuǎn)以使溶解的瓊脂均勻分布于整個培養(yǎng)基溶液中,根據(jù)需要加入氨芐青霉素,然后可直接從三角瓶中倒出培養(yǎng)基鋪制平板。90mm直徑的培養(yǎng)皿約需培養(yǎng)基完全凝結(jié)后,倒置平皿并貯存于4℃?zhèn)溆?。其它試劑?CaCl2溶液、滅菌蒸餾水三、操作步驟:(1) JM109菌平板上挑取一單克隆菌落,培養(yǎng)基的試管中中,37℃ 220 rpm振蕩培養(yǎng)過夜(12~16h)。(2) ml過夜菌液接種到裝有50ml LB液體培養(yǎng)基三角瓶中中,振蕩培養(yǎng)2-3h,隔20-30min測量OD600值, 離心管中,每管1ml菌液,按需要決定管數(shù)。(3)4℃,12000 rpm,離心2 min,以回收細菌。(4)倒凈上清液,倒置離心管于濾紙上1min,使殘留的痕量培養(yǎng)液流盡。,冰浴30 min。(5)4℃,12000 rpm,2 min。(6)倒凈上清液,倒置離心管1min,使殘留液流盡。每管加CaCl2重新懸浮細胞(重懸時操作要輕),即成感受態(tài)細胞懸浮液。:(1)取3只滅菌的Ep管,分別編號分別加入以下各組分:加入5g。無菌條件下將細菌100 ul冰預(yù)冷的 50℃,取出培50ml培養(yǎng)基。5ml LB液體37℃,220 mol/L 10~20ng或 ~ 質(zhì)粒DNA(體積小于10ul),同時做兩個對照組:1號:受體菌對照組:100ul感受態(tài)細胞懸浮液+2ul無菌ddH2O2號:質(zhì)粒DNA對照組:100ul +2ul pUC193號:正常轉(zhuǎn)化組:100ul感受態(tài)細胞懸浮液+2ul pUC19(2)輕輕旋轉(zhuǎn)離心管以混勻內(nèi)容物,冰浴30min,促進DNA分子在感受態(tài)細胞表面的吸附。(3)轉(zhuǎn)入便于DNA分子的吸附進入,提高轉(zhuǎn)化率。(4)迅速轉(zhuǎn)入冰上冷卻(5)使受體菌恢復(fù)正常生長狀態(tài),并且表達(6)取200ul37℃恒溫培養(yǎng)箱倒置培養(yǎng)可將之置于37℃恒溫培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng),100ul左右,用移液器吹打重懸,再全部涂于含(7)觀察并記錄轉(zhuǎn)化子出現(xiàn)的數(shù)目,計算轉(zhuǎn)化率。四、注意事項:,以防止雜菌和外源,溶液移取、分裝等均應(yīng)在無菌超凈工作臺上進行。,以檢驗實驗過程中是否有污染。,42℃水浴2min,通過熱刺激增強CaCL2的作用,2min,修復(fù)細胞膜。600u無抗生素lLB液體培養(yǎng)基,搖勻后于37℃,Ampicillin抗性基因。Ampicillin的LB平板,將平板置于無菌臺直至液體被吸收,12-16h后觀察結(jié)果,其余保存于4℃。如果平板上沒有長出菌落,同時將剩下的500ul菌液離心,Ampicillin的LB平板上,置 DNA。26使細胞膜產(chǎn)生通道,220 rpm,振蕩倒掉大部分上清,37℃培養(yǎng)。60min。留 加菌液涂在含 的污染。實驗六動物組織細胞基因組一、實驗原理真核生物的一切有核細胞(包括培養(yǎng)細胞)都能用來制備基因組的DNA是以染色體的形式存在于細胞核內(nèi),質(zhì)、脂類和糖類等分離,又要保持組織細胞在含仿/異戊醇抽提分離蛋白質(zhì),得到的蛋白酶K在勻漿后提取EDTA則抑制細胞中分子完整地分離出來。二、儀器及試劑、臺式離心機、紫外分光光度計(離心管(滅菌)SDS(十二烷基硫酸鈉)和蛋白酶DNA的反應(yīng)體系中,Dnase、吸頭(滅菌)DNA提取 因此,制備DNA分子的完整。提取KDNA溶液經(jīng)乙醇沉淀使SDS和EDTA(乙二胺四乙酸二鈉)存在下保持很高的活性。SDS可破壞細胞膜、活性;而蛋白酶K可將 27DNA的原則是既要將DNADNA核膜,并使組織蛋白與蛋白質(zhì)降解成小肽或氨基酸,GeneQuant)DNA。真核生物DNA與蛋白 DNA分離,使DNA 的一般過程是將分散好的的溶液中消化分解蛋白質(zhì),再用酚和氯從溶液中析出。的重要特性是能在的 儀器:、移液器、玻璃勻漿器、:(1)細胞裂解緩沖液:Tris()mmol/LEDTA(pH )500 mmol/LNaCLmmol/LSDS10%胰RNA酶20ug/ml(2)蛋白酶K:稱取20mg蛋白酶k溶于1ml滅菌的雙蒸水中,?C20℃?zhèn)溆谩#?)TE緩沖液(pH ):高壓滅菌,室溫貯存。(4)酚?氯仿?異戊醇(25:24:1)、(5)異丙醇、冷無水乙醇、70%乙醇、滅菌水。三、操作步驟(),盡量剪碎。置于玻璃勻漿器中,加入1ml的細胞裂解緩沖液勻漿至不見組織塊, 離心管中,加入蛋白酶K(500ug/ml)20μl,混勻。在65℃恒溫水浴鍋中水浴30min,也可轉(zhuǎn)入37℃水浴12~24h,間歇振蕩離心管數(shù)次。于臺式離心機以12000 rpm離心5min,取上清液入另一離心管中。,倒轉(zhuǎn)混勻后,可以看見絲狀物,用100ul 吸頭挑出,涼干,用200ul TE 重新溶解。(可進行PCR反應(yīng)等,需要進一步純化的按下列步驟進行)?氯仿?異戊醇振蕩混勻,離心12000 rpm,5min。,加入等體積的氯仿?異戊醇,振蕩混勻,離心12000 rpm,5min。,加入1/,混勻后室溫沉淀2min,離心12000 rpm ,10min。,將離心管倒置于吸水紙上,將附于管壁的殘余液滴除掉。 70%乙醇洗滌沉淀物1次,離心12000 rpm,5min。,將離心管倒置于吸水紙上,將附于管壁的殘余液滴除掉,室溫干燥。 TE重新溶解沉淀物,然后置于4℃或?C20℃保存?zhèn)溆?。四、常見問題,處理時間不易過長。,細胞必須均勻分散,以減少:不純,含雜質(zhì)較多;加溶解液太少使?jié)舛冗^大。沉淀物太干燥,也將使溶解變得很困難。:操作不慎;污染核酸酶等。,其上清液太黏不易吸取:含高濃度的的量或減少所取組織的量。A280/%,并重復(fù)步驟 DNA團塊形成。;不純,含有蛋白質(zhì)等雜質(zhì)。在這種情況下,2~8。DNA,可加大抽提前緩沖液29的小于實驗七DNA的定量一、實驗原理核酸分子(DNA或RNA)由于含有嘌吟環(huán)和嘧啶環(huán)的共軛雙鍵,在260 nm的紫外吸收峰,其吸收強度與核酸的濃度成正比,這個物理特性為測定核酸溶液濃度提供了基礎(chǔ)。OD260相當于dsDNA 50 ug/ml,ssDNA 33 ug/ml和ssRNA 40 ug/ml??梢源藖碛嬎愫怂針悠返臐舛?。紫外分光光度法不但能確定核酸的濃度,還可通過測定260nm和280nm的紫外線吸收值的比值(A260/A280)估計核酸的純度,,則可能有RNA污染。對于很稀的核酸溶液,可用熒光光度法進行測定。DNA 本身并不產(chǎn)生熒光,但在熒光染料溴化乙錠(EB)插入DNA 的堿基對平面之間并與之結(jié)合后,DNA樣品能在紫外光的激發(fā)下產(chǎn)生桔紅色熒光。熒光強度與被結(jié)合的EB的量成正比,而被結(jié)合的EB的量又與核酸分子長度和含量成正比,使用一系列已知的不同濃度DNA溶液作標準對照,可比較出被測DNA溶液的濃度。靈敏度可達1~5ng。由于是基于目測,所以是估計水平。簡便,但準確性較低。二、儀器及試劑:AmershamGeneQantTM Pro 紫外可見分光光度儀,瓊脂糖凝膠電泳設(shè)備。:5上樣緩沖液:配制10 ml, 波長處有特異若 該方法經(jīng)濟 mol/L EDTA()ml10% SDSul50% 甘油 ml% 溴酚藍mg% 二甲苯青FFmg加去離子水至10 ml其它試劑:TE、DNA標準液,EB儲存液(10 mg/ml),三、實驗步驟(1)TE對待測DNA樣品按1:20或合適的倍數(shù)稀釋。(2)開機,儀器會自動對光路及分析軟件進行檢測,待顯示屏上出現(xiàn)“instrument Ready”時,進入核酸測定窗口(3)調(diào)零。TE緩沖液注入樣品杯,放入樣品槽,關(guān)閉蓋板。點擊“set ref”鍵,儀器自動校正零點。將樣品槽內(nèi)的樣品杯取出,換上待測樣品。(4)吸70 ul已稀釋的DNA樣品轉(zhuǎn)入石英樣品杯,放入樣品槽,關(guān)閉蓋板。如果樣品很少,可以用5~7ul的石英樣品杯。點擊“enter” 鍵,儀器即進入分析狀態(tài)。窗口同時顯示260和280nm處的光密度(OD值)及260/280nm和280/260nm的比率以及DNA樣品的濃度等。(5)打開蓋板,取出石英樣品杯,吸出樣液,用高純水清潔石英樣品杯,風干后,再加入下一個待測樣品。(6)DNA純度:以O(shè)D260/ OD280比值來反映。當OD60 /OD80比值 ,說明樣品存在RNA污染,可以用RNA酶處理樣品去處RNA。(1)瓊脂糖凝膠的制備。(2)樣品的準備。把待測DNA樣品進行1:2連續(xù)稀釋,并準備一份DNA標準液作對照。(3)上樣。稀釋樣品與上樣緩沖液按1:5混合均勻后上樣。(4)電泳。用100V穩(wěn)壓電泳至溴酚藍指示劑遷移到凝膠的3/4處停止電泳。(5)取出凝膠,入EB熒光染液中作用20min,取出后清水漂洗干凈,然后紫外檢測。肉眼可見到的最高稀釋度約含DNA 80ng。此法也可用于了解核酸樣品中的嚴重污染干擾核酸紫外線吸收物質(zhì)的情況。四、常見問題1. 紫外分光光度法不能區(qū)分三種構(gòu)型,也不能區(qū)分染色體染色體DNA、以及偏高。2.OD320值是背景,若溶液鹽濃度越高,3.的光面以避免干擾測定。DNADNA和DNA解鏈的增色效應(yīng)等因素的影響,因此測得的數(shù)據(jù)往往比實際濃度 RNA等。由于測定吸收光度OD320也越高。要小心不要摔破,32DNA分子的超螺旋、開環(huán)、線狀A(yù)260時,難以排除 持杯時也不要接觸透明RNA、分子的構(gòu)型,如質(zhì)粒測樣品時使用的石英樣品杯比較貴,實驗八PCR基因擴增一、實驗原理聚合酶鏈式反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)是一種體外核酸擴增系統(tǒng),其原理類似DNA分子的天然復(fù)制過程,是將在待擴增的DNA片段和與其兩側(cè)互補的兩個寡聚核苷酸引物,經(jīng)變性、退火和延伸若干個循環(huán)后,生物學(xué)中一種有助于DNA克隆及基因分析的必需工具。PCR的工作程序?qū)嶋H上是一個在模板種脫氧核苷酸等存在的情況下,DNA聚合酶依賴的酶促合成反應(yīng)。擴增的特異性取決于引物與模板DNA的結(jié)合。整個擴增過程分三步:①變性,加熱使模板裂而形成兩條單鏈;②退火,突然降低溫度后模板存在兩條模板鏈之間的結(jié)合,但由于引物的高濃度、物與模板之間;③延伸,在DNA聚合酶及鎂離子等的存在條件下,從引物的結(jié)合單核苷酸,形成與模板鏈互補的新的循環(huán),樣本中的DNA量就增加一倍,新形成的40個循環(huán)后,DNA 可擴增106~109倍。二、儀器及試劑:PCR儀、臺式離心機、移液器及吸頭、:10X PCR 緩沖液配制(部分隨Taq250~500 mmol/L100~500 mmol/L15~20 mmol/L%1mg/L其它試劑:模板DNA、dNTP 混合液、凝膠、等DNA擴增 DNA、一對已知序列的寡核苷酸引物和四DNA引物按堿基配對原則互補結(jié)合,也結(jié)構(gòu)簡單等特點,DNA鏈。完成以上三步為一個循環(huán),每經(jīng)過一個DNA鏈又成為下一輪循環(huán)的模板?,F(xiàn)用圖示說明PCRPCR薄壁管、電泳儀等: KCl TrisCl()MgCl2Tween20BSA Taq聚合酶、上游和下游寡核苷酸引物、瓊脂糖332n 倍。該技術(shù)已成為分子DNA主要的結(jié)合發(fā)生在引: 3 ′端開始,經(jīng)過25~ 雙鏈間的氫鍵斷 原理酶提供)三、操作步驟 體系(40ul):4ul10XPCR 緩沖液4ul25mM MgCl2(根據(jù)不同公司PCR 緩沖液的不同而定)Xul模板DNA ≥50ng1ul上游引物(50100ng)1ul下游引物(50100ng)1uldNTP Mixture(終濃度 ulTaq聚合酶加ddH2O至40ul視PCR儀有無熱蓋,不加或添加石蠟油。加樣后用手輕彈混勻,使反應(yīng)成分集于管底。:(1)95℃300s變性(2)94℃45s變性(3)55℃45s退火(根據(jù)不同引物可能有不同退火溫度)(4)72℃45s延伸(每分鐘可延伸重復(fù)步驟24共 30 循環(huán)(5)72℃600s延伸反應(yīng)結(jié)束后短暫離心,吸取少量(10ul)進行分析,其余置4℃保存?zhèn)溆谩?0-200uM)1kp)6000 rpm 15 sec離心四、注意事項: 體系所加成分的實際用量應(yīng)根據(jù)實驗者選用的該成分的終濃度及所擁有的貯備液濃度進行核算。,吸頭垂直進入試劑管,每加完一樣要換一個吸頭,同時在已加的樣品前做個記號以防止錯加或漏加,避免污染。(置于冰盒上)應(yīng)最后加入,盡量減少室溫接觸機會。加酶時吸頭深入不可過深,酶量不能過多。五、影響PCR的主要因素單鏈、雙鏈DNA白水解酶等的污染。模板用量依具體實驗而定,PCR反應(yīng)時模板變性要充分。
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