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新藥設(shè)計(jì)與開發(fā)的基本途徑和方法先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)(ppt111頁)-資料下載頁

2025-01-03 21:14本頁面
  

【正文】 Lead discovery 1. 天然生物活性物質(zhì) 2. 以生物化學(xué)為基礎(chǔ)發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)物 3. 基于臨床副作用觀察產(chǎn)生先導(dǎo)物 4. 基于生物轉(zhuǎn)化發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)物 5. 藥物合成的中間體作為先導(dǎo)物 6. 組合化學(xué)的方法產(chǎn)生先導(dǎo)物 7. 基于生物大分子結(jié)構(gòu)和作用機(jī)理設(shè)計(jì)先導(dǎo)物 8. 反義核苷酸 9. 幸運(yùn)及篩選發(fā)現(xiàn)的先導(dǎo)物 幸運(yùn)發(fā)現(xiàn)的先導(dǎo)物 ?抓住意外機(jī)遇 ?青霉素的發(fā)現(xiàn) ?苯二氮卓的發(fā)現(xiàn) ?順鉑的發(fā)現(xiàn) 青霉素的發(fā)現(xiàn) ?英國(guó)圣瑪利學(xué)院的細(xì)菌學(xué)家 亞歷山大 弗萊明 一九二八年開始研究葡萄球菌,觀察在不同條件下各種葡萄球菌的生長(zhǎng)狀況。有一次,他發(fā)現(xiàn)在一只培養(yǎng)球菌的碟子上原來生長(zhǎng)得很好的葡萄球菌忽然消失了。這一偶然現(xiàn)象引起了弗萊明的深思 。這是什么原因呢?他經(jīng)過仔細(xì)觀察后發(fā)現(xiàn),原來是一些偶然落到培養(yǎng)基上的青霉菌在葡萄球菌的培養(yǎng)碟內(nèi)生長(zhǎng)起來了。碟內(nèi)葡萄球菌的消失,說明 青霉菌具有殺死葡萄球菌的能力 。這正是弗萊明所期待已久的。 青霉素的發(fā)現(xiàn) ? 他從青霉菌中提煉出了一小瓶透明的液體,并將這種液體滴到長(zhǎng)滿葡萄球菌的培養(yǎng)碟內(nèi)。幾小時(shí)后,培養(yǎng)碟內(nèi)的葡萄球菌全部溶化了。他又將這種液體注射到兔子身上,兔子照樣生活得很好,證明這種液體 對(duì)動(dòng)物和人沒有毒性 。這種能夠殺菌的物質(zhì)被命名為“ 青霉素 ”。弗萊明和他的助手把這些極有價(jià)值的發(fā)現(xiàn)寫成科學(xué)論文,發(fā)表在一九二九年英國(guó)的一本醫(yī)學(xué)雜志上。弗萊明指出, 青霉素在治療一些由細(xì)菌引起的疾病方面是很有作用的 。 ? 弗萊明的偶然發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致了青霉素的誕生 , 但是要把它實(shí)際應(yīng)用于醫(yī)療上卻還有一段艱難的路程 。 因?yàn)檫@種綠色霉菌所分泌的青霉素畢竟太少 , 而且提純的手續(xù)又非常麻煩 ,大量生產(chǎn)時(shí)有許多困難都難以克服 。 所以在當(dāng)時(shí)弗萊明還沒有辦法來解決這些實(shí)際問題 。 盡管這是一項(xiàng)十分有意義的工作 , 他也不得不停頓下來 。 青霉素在弗萊明實(shí)驗(yàn)室的試管里沉睡了十年之久 。 弗萊明的遺憾 11年后的重新發(fā)現(xiàn) ?11年過去了,牛津大學(xué)的病理學(xué)家 霍華施 弗洛里 教授從書堆里找到了弗萊明 11年前寫成的論文,對(duì)這種能夠殺死多種病菌的青霉素產(chǎn)生了濃厚興趣。他認(rèn)為當(dāng)時(shí) 青霉素未能投入生產(chǎn)的原因是沒有依靠集體的力量 。于是,在一次科學(xué)家的集會(huì)上,他將自己的想法告訴了大家,會(huì)上除了生物學(xué)家外,還有化學(xué)家 恩斯特 錢 。科學(xué)家們懷著對(duì)病人深切的同情開始了對(duì)青霉素的聯(lián)合實(shí)驗(yàn)研究工作。化學(xué)家恩斯特 錢用化學(xué)方法從培養(yǎng)液的濾液里提煉青霉素。 ? 經(jīng)過幾十個(gè)晝夜的奮戰(zhàn) , 一種純度很高的青霉素終于誕生了 。 經(jīng)過實(shí)驗(yàn)效果很好 。 但是為了提高青霉素的產(chǎn)量 , 還必須 找到更好的菌種 。 他們分離出了幾百種霉菌 , 最后終于從垃圾堆里的一塊西瓜皮上分離出了第 832號(hào)留菌苗株 , 這種霉菌不僅能在培養(yǎng)液的表面上繁殖 , 而且還能深入到培養(yǎng)液里生長(zhǎng) 。 所以它的產(chǎn)量提高了兩倍 。 他們還動(dòng)員了許多義務(wù)勞動(dòng)者 , 搜集了一切可以利用的材料 , 采用了營(yíng)養(yǎng)豐富的培養(yǎng)液 , 開始了大規(guī)模生產(chǎn) , 使產(chǎn)量提高到十倍以上 。 短短的兩年時(shí)間 , 青霉素就已經(jīng)能普遍用于醫(yī)療上了 。 1945年諾貝爾醫(yī)學(xué)獎(jiǎng) ? 如果說 , 原子彈是第二次世界大戰(zhàn)中殺傷力量最強(qiáng)的武器 ,那么 , 青霉素就是從這個(gè)戰(zhàn)場(chǎng)拯救生命最多的藥物 。 難怪有人把 原子彈 、 雷達(dá) 和 青霉素 并列為 第二次世界大戰(zhàn)期間的三大科學(xué)發(fā)明 。 ? 為了表彰這一造福人類的貢獻(xiàn) , 弗萊明 、 錢 、 弗洛里 于1945年 , 共同獲得 諾貝爾醫(yī)學(xué)獎(jiǎng) 。 Sir Alexander Fleming Ernst Boris Chain Sir Howard Walter Florey 篩選發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)物 ?隨機(jī)與非隨機(jī)篩選 Random/nonrandom screening ?高通量篩選 Highthroughput screening (HTS) ?虛擬篩選 Virtual screening Virtual screening ?用計(jì)算機(jī)篩選的方法稱為 虛擬篩選 ,或稱 in silico篩選 ,成為 in silico→ in vitro→ in vivo 模式。 計(jì) 算 試 驗(yàn)in silico離 體 試 驗(yàn)in vitro在 體 試 驗(yàn)in vivoVirtual screening 虛擬庫(kù)專利指導(dǎo)設(shè)計(jì)庫(kù)類藥原則藥代性質(zhì)潛在毒性受體結(jié)構(gòu)?用一系列 “ 基于知識(shí)的濾片 ” 對(duì)虛擬庫(kù) “ 篩選 ” , 以“ 濃縮 ” 出能夠滿足預(yù)定標(biāo)準(zhǔn)的化合物 。 ?這些濾片包括 類藥性 (drug like), 藥代動(dòng)力學(xué)性質(zhì) ,毒性 , 知識(shí)產(chǎn)權(quán)問題 以及 與受體的互補(bǔ)性 或 與配體的相似性 等 , 是通過數(shù)據(jù)庫(kù)搜尋和計(jì)算化學(xué)實(shí)現(xiàn)的 。 類藥性 ? Lipinski規(guī)則 是藥物分子設(shè)計(jì)和藥物篩選中常用的規(guī)則之一。 ? 1996年, Lipinski通過對(duì) 2023多種口服藥物進(jìn)行分析,提出了用于藥物分子篩選的“ 類藥 5規(guī)則 ” (Rule of Five),概括了類藥的最低標(biāo)準(zhǔn),即 1. 分子量在 500以下; 2. 氫鍵的給體不超過 5個(gè); 3. 氫鍵的接受體不超過 10個(gè); 4. 計(jì)算的分配系數(shù) (正辛醇 水系統(tǒng) )clogP值不超過 5。 ? 上述原則只限于化合物經(jīng)被動(dòng)擴(kuò)散機(jī)理的吸收。 ? 化合物的柔性不宜過強(qiáng),否則會(huì)存在許多種構(gòu)象。 ? 化合物不得含有重金屬和反應(yīng)活性基團(tuán)。 藥代動(dòng)力學(xué)性質(zhì) ?臨床試驗(yàn)被終止淘汰的候選藥物 40%是由于 藥代動(dòng)力學(xué)不合理 造成的 。 ?決定藥物能夠穿越細(xì)胞膜并在胞漿中轉(zhuǎn)運(yùn)的性質(zhì)是分子的化學(xué)結(jié)構(gòu) , 表現(xiàn)在分子量 , 解離常數(shù) ,親脂性 , 極性表面積 , 以及形成氫鍵的數(shù)目等 。 ?藥物的代謝轉(zhuǎn)化主要在肝臟中發(fā)生 。 將 細(xì)胞色素P450 2D6和 3A4催化中心的三維結(jié)構(gòu)作為藥效團(tuán) ,可用于預(yù)測(cè)未知化合物的代謝命運(yùn) 。 ?通過分析化合物的三維結(jié)構(gòu)與半衰期的相關(guān)性 ,可以來 預(yù)測(cè)未知物的代謝模式 。 毒性的預(yù)測(cè) ?基于已有化合物的毒性和結(jié)構(gòu)特征,經(jīng)線性判別分析和多重回歸分析得到的模型,可用來預(yù)測(cè)未知物的毒性。 ?基于知識(shí)的專家系統(tǒng) (knowledgebased system)的軟件如 DEREK,可批處理化合物的致癌性、致畸性、致突變性、刺激性、皮膚敏感性、急性毒性和神經(jīng)毒等。 ?另一個(gè)基于知識(shí)的專家系統(tǒng)是 HazardExpert程序 ,通過輸入化合物名稱、給藥途徑、劑量和用藥時(shí)程,程序可給出結(jié)果。 知識(shí)產(chǎn)權(quán)的預(yù)測(cè) ?化合物具備自主的知識(shí)產(chǎn)權(quán)和專利保護(hù)的前景 , 是開發(fā)決策的重要指標(biāo) , 篩選虛擬庫(kù)和組合庫(kù)時(shí)要 剔除已被其它專利覆蓋或有可能侵權(quán)的化合物 。 ?所以 , 完備的化合物檢索查新系統(tǒng)可確?;衔锝Y(jié)構(gòu)的新穎性 。 基于結(jié)構(gòu)的設(shè)計(jì) ?在 受體結(jié)構(gòu)信息已知 的情況下,可根據(jù)結(jié)合部位的三維結(jié)構(gòu)信息 ,用分子對(duì)接方法,對(duì)互補(bǔ)性好、評(píng)分高的化合物,可預(yù)計(jì)有較強(qiáng)的親和力。 ?若 不知受體的三維結(jié)構(gòu) ,可根據(jù) 藥效團(tuán)特征 篩選虛擬庫(kù),并以不同程度的限制條件, “ 濾除 ” 與藥效團(tuán)無相似性的分子。 Lead discovery 1. 天然生物活性物質(zhì) 2. 以生物化學(xué)為基礎(chǔ)發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)物 3. 基于臨床副作用觀察產(chǎn)生先導(dǎo)物 4. 基于生物轉(zhuǎn)化發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)物 5. 藥物合成的中間體作為先導(dǎo)物 6. 組合化學(xué)的方法產(chǎn)生先導(dǎo)物 7. 基于生物大分子結(jié)構(gòu)和作用機(jī)理設(shè)計(jì)先導(dǎo)物 8. 反義核苷酸 9. 幸運(yùn)及篩選發(fā)現(xiàn)的先導(dǎo)物 謝謝! 演講完畢,謝謝觀看!
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