【正文】 ————————— oxyluciferin Pyrosequencing RNA Pyrosequencing RNA primer RNA （ 3） RNA的結(jié)構(gòu)分析 ? 用于 RNA順序測定的主要有兩種方法： 一種是片段重疊法 另一種是直讀法 RNA 第 四節(jié) 蛋 白 質(zhì) Protein ? 一、蛋白質(zhì)的結(jié)合位點和多亞基蛋白質(zhì) ? 二、蛋白質(zhì)活性的調(diào)節(jié) ? 三、蛋白質(zhì)重要的結(jié)構(gòu)域 ? 四、生物大分子相互作用和復(fù)雜聚集物的結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì) ? 執(zhí)行酶學(xué)和調(diào)節(jié)功能的蛋白質(zhì)催化兩種蛋白質(zhì)分子之間或者細(xì)胞內(nèi)多種分子之間的高度專一反應(yīng)，這些反應(yīng)發(fā)生在蛋白質(zhì)分子表面的氨基酸側(cè)鏈之間。 ? 由于多肽鏈的折疊，側(cè)鏈產(chǎn)生一個帶電荷和疏水基團(tuán)的獨特的表面構(gòu)型。通常一個表面構(gòu)型的大小為 5～ 10197。的小區(qū)域 (這個小區(qū)域叫蛋白質(zhì)的結(jié)合位點 )，它與蛋白質(zhì)和其他分子之間的相互作用有關(guān)。 一、蛋白質(zhì)的結(jié)合位點和多亞基蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì)都是氨基酸的多聚體，具有特定的三維結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì) 球蛋白分子： 蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì)為什么要采取多亞基形式呢？ 因為多亞基體系有以下優(yōu)點： ? （ 1） 亞基對 DNA的利用來說是一種經(jīng)濟(jì)的方法 。 ? （ 2） 采取多亞基形式可以減少蛋白質(zhì)合成過程中隨機的錯誤對蛋白質(zhì)活性的影響 。 ? （ 3）多亞基蛋白質(zhì)的活性能夠非常有效地和非常迅速地被打開和被關(guān)閉。 蛋白質(zhì) 二、蛋白質(zhì)活性的調(diào)節(jié) 終產(chǎn)物的抑制作用 蛋白質(zhì) 已知別構(gòu)酶的結(jié)構(gòu)特點： ▲ 有多個亞基、有四級結(jié)構(gòu)； ▲ 除了有可以結(jié)合底物的酶的活性中心之外，還有可以結(jié)合調(diào)節(jié)物的別構(gòu)中心，而且，這兩個中心位于酶蛋白的不同部位上 ,或處在不同的亞基上，或處在同一個亞基的不同部位上。 多亞基蛋白質(zhì)的調(diào)節(jié) —— 變構(gòu) 蛋白質(zhì) 變構(gòu)調(diào)節(jié)的兩種機制 蛋白質(zhì) 變構(gòu)的主要模型 一種變構(gòu)酶：門冬酰胺轉(zhuǎn)氨甲酰酶 蛋白質(zhì) ? 大腸桿菌的天冬氨酸轉(zhuǎn)氨甲酰酶，簡稱 ATCase（ aspartate transcarbamoylase） —— 它是嘧啶核苷酸生物合成 CTP多酶體系反應(yīng)序列中的第一個酶 ? 其正常底物為天冬氨酸及氨甲酰磷酸 ? 它受 CTP的反饋抑制， CTP是其負(fù)調(diào)節(jié)物，其正調(diào)節(jié)物是ATP ? 它所催化的反應(yīng)如下： 氨甲酰磷酸 + 天冬氨酸 氨甲酰天冬氨酸 UMP UTP CTP ? CTP在不影響酶的 Vmax的情況下通過 降低 酶與底物的親和性來抑制 ATCase； ATP則相反，它 增強 酶與底物的親和性，也不影響其 Vmax。 ? 這種調(diào)節(jié)的生物學(xué)意義是： ATP作為信號表明有能量供 DNA復(fù)制使用并引發(fā)需求嘧啶核苷酸的生物合成； CTP則保證在嘧啶核苷酸已豐足時，不再進(jìn)行不必要的氨甲酰天冬氨酸及其他后續(xù)中間物的合成。 ? ATCase由 C、 R亞基 組成： C亞基可與底物作用，有活性中心，但活性中心對調(diào)節(jié)分子 CTP及ATP沒有反應(yīng)； R亞基上有可以結(jié)合 CTP及 ATP的別構(gòu)中心，但無催化活性。 蛋白質(zhì) ? ATCase的三維結(jié)構(gòu) 汞化物 巰基乙醇 + 完整的酶分子 （活性形式） 催化亞基 （三聚體） 調(diào)節(jié)亞基 （二聚體） C R 蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì) 真核細(xì)胞中蛋白質(zhì)的磷酸化是導(dǎo)致變構(gòu)的共同方式 蛋白質(zhì) cdk蛋白的三維結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì) CDK激活的精細(xì)模型 蛋白質(zhì) 由 GTP水解引起的 EFTU的構(gòu)型變化 蛋白質(zhì) ATP結(jié)合使馬達(dá)蛋白從構(gòu)型 1滑動到構(gòu)型 2， ATP接著被水解，引起從構(gòu)型 2到構(gòu)型 3的變化。 三、蛋白質(zhì)重要的結(jié)構(gòu)域 蛋白質(zhì) ? 鋅指結(jié)構(gòu)（ Zinc finger ） ? 螺旋 拐角 螺旋 (helixturnhelix, HTH) ? 螺旋 環(huán) 螺旋（ helixloophelix， HLH） ? 亮氨酸拉鏈 (leucine zipper) ? 同質(zhì)異形結(jié)構(gòu)域 (homeodomain,HD) ? SH2和 SH3結(jié)構(gòu)域 鋅指結(jié)構(gòu) Zinc Finger: 2 His (green) and 2 Cys (red) coordinate the Zn++ (blue) 蛋白質(zhì) 拐角 螺旋 (helixturnhelix, HTH) 蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì) 螺旋 環(huán) 螺旋（ helixloophelix， HLH） 蛋白質(zhì) 亮氨酸拉鏈 (leucine zipper) 蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì) 5. 同質(zhì)異形結(jié)構(gòu)域 (homeodomain,HD) 蛋白質(zhì) 6. SH2和 SH3結(jié)構(gòu)域 蛋白質(zhì) 四、生物大分子相互作用和復(fù)雜聚集物的結(jié)構(gòu) 一種多蛋白裝配體 —— 膠原蛋白 原膠原細(xì)絲 (procollagen filaments) (0~4nm) ↓ 原小纖維 (protofibrils) (11~15nm) ↓ 微小纖維 (microfibrils) (30~200nm) ↓ 膠原蛋白小纖維 (collagen fibrils) (~ m) ↓ 纖維 (fibers) (1~10μ m) ↓ 腱、骨胳、軟骨等 (肉眼可見 ) 蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì) （ a）膠原纖維的分子結(jié)構(gòu)與形成過程 (Ⅰ ～ Ⅶ )； （ b）膠原纖維的電鏡照片 蛋白質(zhì) 膠原纖維中原膠原蛋白分子的排列 蛋白質(zhì) 復(fù)雜的 DNA結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì) DNA雙螺旋 1/7 螺旋化 (H2A， H2B， H3， H4) 核小體 1/6 螺旋化 (H1) 螺線管 1/30 折疊和螺旋化 超螺線環(huán) 1/5 折疊和螺旋化 合計 1/6 300 染色單體 DNA壓縮比率 壓縮方法 DNA與一個識別專一堿基順序的蛋白質(zhì)的相互作用 許多蛋白質(zhì)只對特定的堿基順序結(jié)合，這些蛋白質(zhì)有三種類型： ? ①聚合酶 ? ②調(diào)節(jié)蛋白 ? ③限制性內(nèi)切核酸酶 蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì) λDNA上與 Cro蛋白結(jié)合的 17個堿基的順序 Cro蛋白的排列 Cro蛋白—OR3復(fù)合物的推測結(jié)構(gòu) 生物膜 (biological membranes) 蛋白質(zhì) 流動鑲嵌模型 復(fù)雜聚集物的自我裝配 煙草花葉病毒裝配的移動環(huán)模型 蛋白質(zhì) 謝謝觀看 /歡迎下載 BY FAITH I MEAN A VISION OF GOOD ONE CHERISHES AND THE ENTHUSIASM THAT PUSHES ONE TO SEEK ITS FULFILLMENT REGARDLESS OF OBSTACLES. BY FAITH I BY FAITH