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三螺旋dnaword版-資料下載頁(yè)

2025-08-17 04:30本頁(yè)面
  

【正文】 A):T表示。當(dāng)三螺旋在水溶液中時(shí),水分子也參與了三堿基之間的相互作用(圖329e)。在(TA):T三堿基中,水分子作為媒介將第三個(gè)堿基T的O4和第一個(gè)堿基A的N7用氫鍵連接起來(lái)。同時(shí)Zhurkin等發(fā)現(xiàn)R鏈上每一個(gè)堿基的電荷分布嚴(yán)格地與同源WC堿基對(duì)大溝上的堿基電荷電性互補(bǔ),因面提出了同源序列的相互識(shí)別可能是通過(guò)互補(bǔ)的靜電相互作用進(jìn)行的,即含有靜電識(shí)別密碼。 2.HDNA HDNA又稱(chēng)鉸鏈DNA,是三螺旋結(jié)構(gòu)中較為特殊的一種,1987年由Mirkin等在一種持粒的酸性溶液中首次發(fā)現(xiàn)。HDNA可在任何以鏡象重復(fù)的寡聚核苷酸中產(chǎn)生(核苷酸序列具有H回文結(jié)構(gòu))。HDNA的形成始于共聚物內(nèi)部突環(huán),其中的雙鏈在一邊輕微旋轉(zhuǎn),折疊回去,以生成第一個(gè)三股堿基對(duì)。這種成核過(guò)程建立了一種非平衡的HDNA構(gòu)型。纏繞與變性導(dǎo)致了其余DNA分子負(fù)超螺旋松弛。3′和5′一半的多聚嘧啶鏈都可以作HDNA的給予體鏈,而形成兩種異構(gòu)體如圖330所示,它們?cè)跇?gòu)型上是等價(jià)的。簡(jiǎn)言之,HDNA是由部分未纏繞的復(fù)合DNA中的一個(gè)富嘧啶鏈,經(jīng)回折同復(fù)合體中伸展的富嘌呤鏈間形成Hoogsteen氫鍵而形成的分子內(nèi)三螺旋,即DNA的雙鏈所形成的三鏈螺旋。由于形成過(guò)程中發(fā)生C→C+的轉(zhuǎn)化,故稱(chēng)HDNA。并把這類(lèi)序列稱(chēng)為H回文序列。 研究還發(fā)現(xiàn)在毫摩爾級(jí)的Mg2+和中性pH下,d(G)30d(C)30所形成一種由GGC三堿基體組成的嘌呤分子內(nèi)三螺旋結(jié)構(gòu)(H*DNA),而另外一些研究則發(fā)現(xiàn)d(AG)nd(T)n和d(G)nd(C)n束道也能形成同時(shí)含有HDNA和H*DNA的紐結(jié)(nodule)三錠結(jié)構(gòu)。如圖330,在這個(gè)DNA結(jié)構(gòu)中,兩個(gè)三螺旋的頂端含有少數(shù)幾個(gè)未配對(duì)的DNA堿基,而且由于不同結(jié)構(gòu)間存在大量的鏈節(jié),因此,紐結(jié)DNA的形成具有較高的成核能,但延伸能較低(因?yàn)閱捂渽^(qū)較少)。 3.三鏈辮狀DNA 1990年,白春禮等首次采用掃描隧道顯微鏡(STM)研究了變性λDNA HindIII的微觀(guān)結(jié)構(gòu)特征,結(jié)果觀(guān)察到了一種新的三鏈結(jié)構(gòu)——三鏈辮狀結(jié)構(gòu)(圖331)。在此結(jié)構(gòu)中,3條核昔酸鏈?zhǔn)潜舜舜┎宥幊赊p狀結(jié)構(gòu)。其中每條鏈的核苷酸在組成上一般是不同型的,它們有間隔重復(fù)的嘌呤核苷酸片段,使之在辮狀結(jié)構(gòu)中作為“穿入”片段。能量分析結(jié)果顯示,這種辮狀結(jié)構(gòu)模型的總能量(5 )要高于三鏈螺旋的總能量(7 );無(wú)論在骨架能量還是堿基酸對(duì)的能量,三鏈螺旋均要低于相對(duì)的辮狀結(jié)構(gòu)。因此,與辮狀結(jié)構(gòu)相比,三鏈螺旋結(jié)構(gòu)可能較為穩(wěn)定。目前對(duì)于三鏈辮狀結(jié)構(gòu)是否在生物體內(nèi)存在,還無(wú)法做出任何解釋和回答,但從結(jié)構(gòu)分子生物學(xué)角度看,辮狀結(jié)構(gòu)模型無(wú)疑對(duì)于我們了解三鏈的多態(tài)性具有積極的作用。
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