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正文內(nèi)容

質(zhì)粒種類與應(yīng)用ppt課件-資料下載頁

2025-01-17 19:20本頁面
  

【正文】 和第四個堿基之間產(chǎn)生缺口,并形成單鏈 TDNA。 ? TDNA的 LB和 RB在整合中的作用是不對稱的, RB順序與整合有關(guān),而 LB無關(guān)。 ? TDNA的整合可以是單拷貝的,也可以是多拷貝的,成串聯(lián)形式排列,但整合位點的特異性尚未確定。 植物細(xì)胞轉(zhuǎn)化的共整合系統(tǒng) ? TDNA克隆在大腸桿菌質(zhì)粒上,含有 選擇標(biāo)記和植物選擇標(biāo)記 Kmr。 ? 首先在 組分子,然后將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到農(nóng)桿菌中,質(zhì)粒與 Ti質(zhì)粒上的同源序列發(fā)生同源重組,將外源基因整合到 Ti質(zhì)粒上,用于侵染植物細(xì)胞。TDNA重組分子整合到植物細(xì)胞染色體 DNA上, Kmr篩選轉(zhuǎn)化細(xì)胞。 植物細(xì)胞轉(zhuǎn)化的雙元系統(tǒng) ? 目前 TDNA轉(zhuǎn)化植物細(xì)胞的標(biāo)準(zhǔn)方法是雙元系統(tǒng),即穿梭質(zhì)粒。插入外源基因的重組穿梭質(zhì)粒直接轉(zhuǎn)化含有 Ti質(zhì)粒的根瘤農(nóng)桿菌,經(jīng)篩選后直接感染植物細(xì)胞。與共整合系統(tǒng)所不同的是,含外源基因的質(zhì)??稍谵r(nóng)桿菌內(nèi)自主復(fù)制并保留下來。農(nóng)桿菌侵染植物細(xì)胞后,植物的創(chuàng)傷信號啟動 Ti質(zhì)粒上的 Vir基因,隨后將穿梭質(zhì)粒的 TDNA切割下來,轉(zhuǎn)移到植物細(xì)胞中。 典型的桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng) ? 典型的桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)是利用大腸桿菌中位點特異的轉(zhuǎn)座或昆蟲細(xì)胞中的同源重組來產(chǎn)生重組桿狀病毒。這些過程要求大量的操作時間,周期長達(dá)幾周。 BaculoDirect? 桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)簡化了這些過程,節(jié)省了大量時間,使你可以比以往任何時候更快地獲得桿狀病毒表達(dá)結(jié)果。 ? BaculoDirect? 系統(tǒng)利用快速、簡便的Gateway174。技術(shù)。BaculoDirect? 線性DNA包含了 attR位點,允許與包含有目的基因的 Gateway174。入門克隆進(jìn)行有效的重組。將entry克隆、BaculoDirect? 線性DNA和 Gateway174。 LR Clonase? 酶混合物稍加混勻,在室溫下反應(yīng) 1小時即可。最終的反應(yīng)混和物中包含有攜帶目的基因的桿狀病毒,可以直接用于轉(zhuǎn)染昆蟲細(xì)胞( sf9或 sf21)。 SV40病毒作為載體 反轉(zhuǎn)錄病毒 ? 反轉(zhuǎn)錄病毒載體是常用的病毒載體之一。 ? 反轉(zhuǎn)錄病毒的 DNA基因組的兩端各有一個長末端重復(fù)序列 (5‘— LTR和 3’— LTR),有一個包裝病毒顆粒時必需的非編碼序列 ψ+,同時有三個編碼蛋白質(zhì)的基因 gag、 pol和 env。 ? 反轉(zhuǎn)錄病毒載體可以容納外源 DNA的長度在 10 kb左右,以很高的轉(zhuǎn)染率感染宿主細(xì)胞,特別是分裂中的細(xì)胞。轉(zhuǎn)入宿主的細(xì)胞后,反轉(zhuǎn)錄病毒載體隨即整合到宿主細(xì)胞基因組內(nèi),這種整合的位點是隨機(jī)的。 ? 反轉(zhuǎn)錄病毒載體在構(gòu)建時,刪去了 poi、 env基因和 gag基因的 3’端,但保留了病毒顆粒所需的 ψ+序列。其目的是在于提高載體的安全性,防止反轉(zhuǎn)錄病毒進(jìn)入宿主細(xì)胞后進(jìn)行增殖并包裝成病毒顆粒對宿主細(xì)胞造成可能的傷害。這樣,在制備反轉(zhuǎn)錄病毒載體時,就必須有一個輔助細(xì)胞系,這種細(xì)胞內(nèi)有缺陷型病毒可以提供包裝用的外殼蛋白,但自身沒有包裝信號。這樣,反轉(zhuǎn)錄病毒載體就可利用這些外殼蛋白包裝成病毒顆粒在輔助細(xì)胞系內(nèi)大量擴(kuò)增。 ? 反轉(zhuǎn)錄病載體多半用于基因治療,由于病毒載體在宿主細(xì)胞基因組上隨機(jī)插入,人們擔(dān)心會引起不安全的后果,這種載體還在不斷改進(jìn)之中。 YAC 人工染色體載體 ? 是利用釀酒酵母( Saccharomyces cerevisiae)的染色體的復(fù)制元件構(gòu)建的載體,其工作環(huán)境也是在釀酒酵母中。 ? 釀酒酵母的形態(tài)為扁圓形和卵形,生長的代時為 90 分鐘;含 16 條染色體,其大小為 2251900kb ,總計有14 106 bp;具真核 mRNA 的加工活性。 人造染色體載體 酵母人造染色體( Yeast Artificial Chromosomes YAC) YAC載體應(yīng)含有下列元件: 酵母染色體的端粒序列 酵母人造染色體的構(gòu)建: pYAC4 CEN4 EcoRI URA3 TEL BamHI TEL ori Apr TRP1 ARS1 酵母染色體的復(fù)制子 酵母染色體的中心粒序列 酵母系統(tǒng)的 選擇標(biāo)記 大腸桿菌的復(fù)制子 大腸桿菌的 選擇標(biāo)記 YAC載體的裝載量為 350 400 kb 人造染色體載體 酵母人造染色體( Yeast Artificial Chromosomes YAC) 酵母人造染色體的使用: pYAC4 CEN EcoRI URA TEL BamHI TEL ori Apr TRP ARS EcoRI EcoRI EcoRI BamHI 連接 轉(zhuǎn)化酵母菌 重組酵母染色體 ? pYAC4 :當(dāng)用 BamHⅠ 切割成線狀后,就形成了一個微型酵母染色體,包含染色體復(fù)制的必要順式元件,如自主復(fù)制序列、著絲粒和位于兩端的端粒。這些元件在酵母菌中可以驅(qū)動染色體的復(fù)制和分配,從而決定這個微型染色體可以攜帶酵母染色體大小的 DNA 片段。 ? YAC 載體的原理性工作流程:對于 BamHⅠ 切割后形成的微型酵母染色體,當(dāng)用 EcoRⅠ 或 SmaⅠ 切割抑制基因 sup4 內(nèi)部的位點后形成染色體的兩條臂,與外源大片段 DNA 在該切點相連就形成一個大型人工酵母染色體,通過轉(zhuǎn)化進(jìn)入到酵母菌后可象染色體一樣復(fù)制,并隨細(xì)胞分裂分配到子細(xì)胞中去,達(dá)到克隆大片段DNA 的目的。裝載了外源 DNA 片段的重組子導(dǎo)致抑制基因 sup4 插入失活,從而形成紅色菌落; 而載體自身連接后轉(zhuǎn)入到酵母細(xì)胞后形成白色菌落。這些紅色的裝載了不同外源 DNA 片段的重組酵母菌菌落的群體就構(gòu)成了 YAC 文庫。 YAC 文庫裝載的 DNA 片段的大小一般可達(dá) 200500kb,有的可達(dá) 1Mb 以上,甚至達(dá)到 2Mb 。 用于轉(zhuǎn)化子篩選的標(biāo)記基因 用于酵母菌轉(zhuǎn)化子篩選的標(biāo)記基因主要有 營養(yǎng)缺陷型互補基因 和 顯性基因 兩大類 營養(yǎng)缺陷型互補基因主要有氨基酸和核苷酸生物合成基因,如: LEU、 TRP、 HIS、 LYS、 URA、 ADE 但對于多倍體酵母來說,篩選營養(yǎng)缺陷型的受體非常困難 營養(yǎng)缺陷型的互補基因 用于轉(zhuǎn)化子篩選的標(biāo)記基因 顯性標(biāo)記基因的編碼產(chǎn)物只要是毒性物質(zhì)的抗性蛋白 顯性標(biāo)記基因 aph 氨基糖苷轉(zhuǎn)移酶 抗 G418 cat 氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶 抗氯霉素 dhfr 二氫葉酸還原酶 抗氨甲喋呤和磺胺 cup1 銅離子螯合物 耐受銅離子 suc2 蔗糖轉(zhuǎn)化酶 耐受高濃度蔗糖 ilv2 乙酰乳糖合成酶 抗硫酰脲除草劑 標(biāo)記基因 編碼產(chǎn)物 遺傳表型 C 用于基因轉(zhuǎn)移的受體菌或細(xì)胞 3 基因工程的基本條件 各種基因工程受體的特性 實驗室常用的基因工程受體 受體細(xì)胞應(yīng)具備的條件 受體細(xì)胞應(yīng)具備的條件 限制性缺陷型 外切酶和內(nèi)切酶活性缺陷( recB, recC, hsdR) 重組整合缺陷型 用于基因擴(kuò)增或高效表達(dá)的受體細(xì)胞 ( recA) 具有較高的轉(zhuǎn)化效率 具有與載體選擇標(biāo)記互補的表型 感染寄生缺陷型 防止重組細(xì)菌擴(kuò)散污染,生物武器除外 各種基因工程受體的特性 大腸桿菌 遺傳背景清楚,載體受體系統(tǒng)完備,生長迅速,培養(yǎng)簡單,重組子穩(wěn)定 適用于外源 DNA的擴(kuò)增和克隆、原核生物基因的高效表達(dá)、基因文庫的構(gòu)建,是 DNA重組實驗和基因工程的主要受體菌 產(chǎn)結(jié)構(gòu)復(fù)雜、種類繁多的內(nèi)毒素 各種基因工程受體的特性 枯草桿菌 遺傳背景清楚,蛋白質(zhì)分泌機(jī)制健全 ,生長迅速,培養(yǎng)簡單,不產(chǎn)內(nèi)毒素 適用于原核生物基因的克隆、表達(dá)以及重組蛋白多肽的有效分泌 遺傳欠穩(wěn)定,載體受體系統(tǒng)欠完備 各種基因工程受體的特性 鏈霉菌 抗生素的主要生產(chǎn)者,分子遺傳相對操作簡便,不產(chǎn)內(nèi)毒素 主要用于抗生素生產(chǎn)菌株的改良 遺傳不穩(wěn)定,生長相對緩慢 各種基因工程受體的特性 酵母菌 具有真核生物的特征,遺傳背景清楚,生長迅速,培養(yǎng)簡單,外源基因表達(dá)系統(tǒng)完善,遺傳穩(wěn)定 適用于外源 DNA的擴(kuò)增、克隆以及真核生物基因的高效表達(dá)、基因文庫的構(gòu)建、真核生物基因表達(dá)調(diào)控的研究,是 DNA重組實驗和基因工程重要的真核性受體菌 內(nèi)源性蛋白產(chǎn)物種類繁多且含量高 各種基因工程受體的特性 昆蟲細(xì)胞(家蠶) 具有真核生物的特征,外源基因表達(dá)量高,繁殖相對較快,培養(yǎng)成本低廉,遺傳穩(wěn)定 適用于真核生物基因的高效表達(dá) DNA重組操作系統(tǒng)欠完善 各種基因工程受體的特性 哺乳動物細(xì)胞(中國 倉鼠卵巢細(xì)胞 CHO) 與人的親緣關(guān)系近,分子重組表達(dá)系統(tǒng)健全,具有合適的糖基化修飾系統(tǒng) 適用于哺乳類動物和人的基因表達(dá)調(diào)控研究、基因藥物的生產(chǎn),是 DNA重組實驗和基因工程的主要哺乳動物受體 細(xì)胞培養(yǎng)條件苛刻,生長緩慢 各種基因工程受體的特性 植物細(xì)胞(擬南芥菜、煙葉 ) 農(nóng)作物的經(jīng)濟(jì)意義重大,轉(zhuǎn)基因植物細(xì)胞易于分化,細(xì)胞培養(yǎng)簡單且成本低廉,具有光合作用 適用于高等植物基因表達(dá)調(diào)控的研究、基因藥物的生產(chǎn),農(nóng)作物品質(zhì)的改良 遺傳操作繁瑣 實驗室常用的基因工程受體 大腸桿菌 用于接受質(zhì)粒: C600、 W31 HB10 JM8 JM101( Aps、 Tcs、 Cms) 用于接受 lDNA: LE39 ED8654 酵母菌 哺乳動物細(xì)胞 CHO 畢赤酵母 啤酒酵母
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